RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367740.2

VAMP4-202, Transcript of vesicle associated membrane protein 4, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VAMP4, Length 1,193 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4-202ENST00000367740 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
VAMP4-202ENST00000367740 C18orf32Q8TCD1 76 aa7.07□□□□□ -1.28
VAMP4-202ENST00000367740 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa7.07□□□□□ -1.28
VAMP4-202ENST00000367740 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa7.06□□□□□ -1.28
VAMP4-202ENST00000367740 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa7.06□□□□□ -1.28
VAMP4-202ENST00000367740 FABP9Q0Z7S8 132 aa7.06□□□□□ -1.28
VAMP4-202ENST00000367740 RHEBQ15382 184 aa7.06□□□□□ -1.28
VAMP4-202ENST00000367740 OR13C6PQ8NH95 151 aa7.06□□□□□ -1.28
VAMP4-202ENST00000367740 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa7.06□□□□□ -1.28
VAMP4-202ENST00000367740 LEPROTO15243 131 aa7.05□□□□□ -1.28
VAMP4-202ENST00000367740 KRTAP5-9P26371 169 aa7.05□□□□□ -1.28
VAMP4-202ENST00000367740 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.04□□□□□ -1.28
VAMP4-202ENST00000367740 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa7.02□□□□□ -1.29
VAMP4-202ENST00000367740 IFI27L1Q96BM0 104 aa7.02□□□□□ -1.29
VAMP4-202ENST00000367740 SEC11CQ9BY50 192 aa7.02□□□□□ -1.29
VAMP4-202ENST00000367740 J3QQQ9 107 aa7.01□□□□□ -1.29
VAMP4-202ENST00000367740 COX19Q49B96 90 aa7□□□□□ -1.29
VAMP4-202ENST00000367740 Q6ZVH6 145 aa7□□□□□ -1.29
VAMP4-202ENST00000367740 SPANXCQ9NY87 97 aa7□□□□□ -1.29
VAMP4-202ENST00000367740 NMUP48645 174 aa6.99□□□□□ -1.29
VAMP4-202ENST00000367740 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.99□□□□□ -1.29
VAMP4-202ENST00000367740 A0A1B0GV90 55 aa6.98□□□□□ -1.29
VAMP4-202ENST00000367740 A8MWP4 228 aa6.97□□□□□ -1.29
VAMP4-202ENST00000367740 A0A0J9YXY3 114 aa6.96□□□□□ -1.3
VAMP4-202ENST00000367740 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.95□□□□□ -1.3
VAMP4-202ENST00000367740 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa6.95□□□□□ -1.3
VAMP4-202ENST00000367740 CLEC2BQ92478 149 aa6.95□□□□□ -1.3
VAMP4-202ENST00000367740 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.94□□□□□ -1.3
VAMP4-202ENST00000367740 C14orf144Q96I85 54 aa6.94□□□□□ -1.3
VAMP4-202ENST00000367740 A0A1B0GWB2 263 aa6.93□□□□□ -1.3
VAMP4-202ENST00000367740 A6NN06 94 aa6.93□□□□□ -1.3
VAMP4-202ENST00000367740 F8WEM9 126 aa6.93□□□□□ -1.3
VAMP4-202ENST00000367740 LST1O00453 97 aa6.93□□□□□ -1.3
VAMP4-202ENST00000367740 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.93□□□□□ -1.3
VAMP4-202ENST00000367740 H0Y8G0 127 aa6.92□□□□□ -1.3
VAMP4-202ENST00000367740 Q6JHZ5 121 aa6.91□□□□□ -1.3
VAMP4-202ENST00000367740 LITAFQ99732 161 aa6.91□□□□□ -1.3
VAMP4-202ENST00000367740 TSTD3H0UI37 97 aa6.9□□□□□ -1.3
VAMP4-202ENST00000367740 UQCC3Q6UW78 93 aa6.9□□□□□ -1.3
VAMP4-202ENST00000367740 C9orf118A6NHY6 69 aa6.89□□□□□ -1.31
VAMP4-202ENST00000367740 DSCR10P59022 87 aa6.89□□□□□ -1.31
VAMP4-202ENST00000367740 HERVK_113P61574 105 aa6.89□□□□□ -1.31
VAMP4-202ENST00000367740 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa6.89□□□□□ -1.31
VAMP4-202ENST00000367740 PLNP26678 52 aa6.88□□□□□ -1.31
VAMP4-202ENST00000367740 SVBPQ8N300 66 aa6.88□□□□□ -1.31
VAMP4-202ENST00000367740 DLEU1O43261 78 aa6.87□□□□□ -1.31
VAMP4-202ENST00000367740 MTURNQ8N3F0 131 aa6.87□□□□□ -1.31
VAMP4-202ENST00000367740 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
VAMP4-202ENST00000367740 APOC3P02656 99 aa6.84□□□□□ -1.31
VAMP4-202ENST00000367740 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
VAMP4-202ENST00000367740 TMEM218A2RU14 115 aa6.83□□□□□ -1.32
VAMP4-202ENST00000367740 DPM2O94777 84 aa6.83□□□□□ -1.32
VAMP4-202ENST00000367740 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
VAMP4-202ENST00000367740 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.82□□□□□ -1.32
VAMP4-202ENST00000367740 A4D1N5 150 aa6.82□□□□□ -1.32
VAMP4-202ENST00000367740 PMCHL2Q9BQD1 86 aa6.82□□□□□ -1.32
VAMP4-202ENST00000367740 TIMM17BO60830 172 aa6.81□□□□□ -1.32
VAMP4-202ENST00000367740 S100A2P29034 98 aa6.81□□□□□ -1.32
VAMP4-202ENST00000367740 OCIAD2Q56VL3 154 aa6.81□□□□□ -1.32
VAMP4-202ENST00000367740 ZNF815PA8K554 130 aa6.8□□□□□ -1.32
VAMP4-202ENST00000367740 IGKCP01834 107 aa6.8□□□□□ -1.32
VAMP4-202ENST00000367740 E9PLD3 99 aa6.79□□□□□ -1.32
VAMP4-202ENST00000367740 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.79□□□□□ -1.32
VAMP4-202ENST00000367740 M0R143 59 aa6.78□□□□□ -1.32
VAMP4-202ENST00000367740 SERF1AO75920 110 aa6.78□□□□□ -1.32
VAMP4-202ENST00000367740 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa6.78□□□□□ -1.32
VAMP4-202ENST00000367740 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa6.78□□□□□ -1.32
VAMP4-202ENST00000367740 GPR98Q8WXG9 6306 aa6.78□□□□□ -1.32
VAMP4-202ENST00000367740 HSBP1O75506 76 aa6.77□□□□□ -1.33
VAMP4-202ENST00000367740 MT1BP07438 61 aa6.76□□□□□ -1.33
VAMP4-202ENST00000367740 Q6ZQY7 126 aa6.76□□□□□ -1.33
VAMP4-202ENST00000367740 A6NDN8 102 aa6.75□□□□□ -1.33
VAMP4-202ENST00000367740 COLCA2A8K830 154 aa6.75□□□□□ -1.33
VAMP4-202ENST00000367740 LEPROTL1O95214 131 aa6.75□□□□□ -1.33
VAMP4-202ENST00000367740 LINC00313P59037 77 aa6.75□□□□□ -1.33
VAMP4-202ENST00000367740 SCGB1A1P11684 91 aa6.74□□□□□ -1.33
VAMP4-202ENST00000367740 KRTAP10-5P60370 271 aa6.74□□□□□ -1.33
VAMP4-202ENST00000367740 PYY3Q5JQD4 70 aa6.74□□□□□ -1.33
VAMP4-202ENST00000367740 H3BUT2 72 aa6.73□□□□□ -1.33
VAMP4-202ENST00000367740 SCGB1D1O95968 90 aa6.73□□□□□ -1.33
VAMP4-202ENST00000367740 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.73□□□□□ -1.33
VAMP4-202ENST00000367740 SPRR2EP22531 72 aa6.72□□□□□ -1.33
VAMP4-202ENST00000367740 SPRR2BP35325 72 aa6.72□□□□□ -1.33
VAMP4-202ENST00000367740 SPRR2AP35326 72 aa6.72□□□□□ -1.33
VAMP4-202ENST00000367740 LINC00575Q6W349 94 aa6.71□□□□□ -1.34
VAMP4-202ENST00000367740 SIGMAR1Q99720 223 aa6.71□□□□□ -1.34
VAMP4-202ENST00000367740 A0A1B0GV72 72 aa6.69□□□□□ -1.34
VAMP4-202ENST00000367740 A0A087WSZ3 146 aa6.68□□□□□ -1.34
VAMP4-202ENST00000367740 SPINK7P58062 85 aa6.68□□□□□ -1.34
VAMP4-202ENST00000367740 TTTY13Q9BZ97 58 aa6.68□□□□□ -1.34
VAMP4-202ENST00000367740 hADV29S1A0JD25 119 aa6.67□□□□□ -1.34
VAMP4-202ENST00000367740 SNHG12Q9BXW3 62 aa6.67□□□□□ -1.34
VAMP4-202ENST00000367740 A0A1W2PNM2 257 aa6.66□□□□□ -1.34
VAMP4-202ENST00000367740 FABP4P15090 132 aa6.66□□□□□ -1.34
VAMP4-202ENST00000367740 HSPB8Q9UJY1 196 aa6.66□□□□□ -1.34
VAMP4-202ENST00000367740 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.65□□□□□ -1.34
VAMP4-202ENST00000367740 Q5VV11 94 aa6.65□□□□□ -1.34
VAMP4-202ENST00000367740 PET117Q6UWS5 81 aa6.65□□□□□ -1.34
VAMP4-202ENST00000367740 TEN1Q86WV5 123 aa6.65□□□□□ -1.34
VAMP4-202ENST00000367740 VPS25Q9BRG1 176 aa6.65□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 110.9 ms