RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-201ENST00000261266 SPATA8Q6RVD6 105 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-201ENST00000261266 CYSTM1Q9H1C7 97 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRB-201ENST00000261266 A0A0A0MQY5 61 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRB-201ENST00000261266 EPG5Q9HCE0 2579 aa5.21□□□□□ -1.57
PTPRB-201ENST00000261266 M0QZ58 72 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRB-201ENST00000261266 ACANP16112 2415 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRB-201ENST00000261266 PANO1I0J062 215 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRB-201ENST00000261266 PLAC4Q8WY50 150 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRB-201ENST00000261266 POLQO75417 2590 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRB-201ENST00000261266 ADM2Q7Z4H4 148 aa5.15□□□□□ -1.59
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PTPRB-201ENST00000261266 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
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PTPRB-201ENST00000261266 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
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PTPRB-201ENST00000261266 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa5.06□□□□□ -1.6
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PTPRB-201ENST00000261266 PP632Q6XCG6 107 aa4.98□□□□□ -1.61
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PTPRB-201ENST00000261266 TPRXLQ17RH7 258 aa4.9□□□□□ -1.62
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PTPRB-201ENST00000261266 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa4.89□□□□□ -1.63
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PTPRB-201ENST00000261266 UNC79Q9P2D8 2635 aa4.85□□□□□ -1.63
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PTPRB-201ENST00000261266 CFAP46Q8IYW2 2715 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRB-201ENST00000261266 A8MU10 97 aa4.83□□□□□ -1.64
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PTPRB-201ENST00000261266 TRANK1O15050 2925 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-201ENST00000261266 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-201ENST00000261266 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-201ENST00000261266 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa4.74□□□□□ -1.65
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PTPRB-201ENST00000261266 H0YAA0 97 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRB-201ENST00000261266 COL6A5A8TX70 2615 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRB-201ENST00000261266 P0C880 135 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRB-201ENST00000261266 CHD7Q9P2D1 2997 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRB-201ENST00000261266 C10orf95Q9H7T3 257 aa4.61□□□□□ -1.67
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PTPRB-201ENST00000261266 A0A0C4DFX4 3053 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRB-201ENST00000261266 TEX15Q9BXT5 2789 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRB-201ENST00000261266 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
PTPRB-201ENST00000261266 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRB-201ENST00000261266 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRB-201ENST00000261266 AKAP13Q12802 2813 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRB-201ENST00000261266 KRTAP10-10P60014 251 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRB-201ENST00000261266 CENPEQ02224 2701 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRB-201ENST00000261266 HTTP42858 3142 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRB-201ENST00000261266 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRB-201ENST00000261266 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
PTPRB-201ENST00000261266 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
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PTPRB-201ENST00000261266 CHD6Q8TD26 2715 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRB-201ENST00000261266 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
PTPRB-201ENST00000261266 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
PTPRB-201ENST00000261266 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
PTPRB-201ENST00000261266 NOTCH1P46531 2555 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRB-201ENST00000261266 HIVEP1P15822 2718 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRB-201ENST00000261266 LAMA3Q16787 3333 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRB-201ENST00000261266 BRCA2P51587 3418 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRB-201ENST00000261266 KRTAP12-2P59991 146 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRB-201ENST00000261266 KRTAP12-1P59990 96 aa4.35□□□□□ -1.71
PTPRB-201ENST00000261266 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRB-201ENST00000261266 APCP25054 2843 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRB-201ENST00000261266 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP4.33□□□□□ -1.72
PTPRB-201ENST00000261266 STAB2Q8WWQ8 2551 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRB-201ENST00000261266 MGAQ8IWI9 3026 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRB-201ENST00000261266 ITPR1Q14643 2758 aa4.32□□□□□ -1.72
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