RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 ADM2Q7Z4H4 148 aa9.66□□□□□ -0.86
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa9.66□□□□□ -0.86
CTIF-201ENST00000256413 DNAH12Q6ZR08 3092 aa9.64□□□□□ -0.87
CTIF-201ENST00000256413 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
CTIF-201ENST00000256413 EPG5Q9HCE0 2579 aa9.63□□□□□ -0.87
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
CTIF-201ENST00000256413 A0A0C4DFX4 3053 aa9.62□□□□□ -0.87
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa9.6□□□□□ -0.87
CTIF-201ENST00000256413 S4R3F8 94 aa9.59□□□□□ -0.87
CTIF-201ENST00000256413 PLAC8Q9NZF1 115 aa9.57□□□□□ -0.88
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP1-1Q07627 177 aa9.56□□□□□ -0.88
CTIF-201ENST00000256413 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
CTIF-201ENST00000256413 FASNP49327 2511 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CTIF-201ENST00000256413 Q5VSD8 79 aa9.48□□□□□ -0.89
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa9.48□□□□□ -0.89
CTIF-201ENST00000256413 A0A087X002 238 aa9.47□□□□□ -0.89
CTIF-201ENST00000256413 NDUFAF8A1L188 74 aa9.47□□□□□ -0.89
CTIF-201ENST00000256413 MGAM2Q2M2H8 2515 aa9.47□□□□□ -0.89
CTIF-201ENST00000256413 CEP350Q5VT06 3117 aa9.43□□□□□ -0.9
CTIF-201ENST00000256413 R4GN34 69 aa9.43□□□□□ -0.9
CTIF-201ENST00000256413 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa9.42□□□□□ -0.9
CTIF-201ENST00000256413 PANO1I0J062 215 aa9.41□□□□□ -0.9
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa9.37□□□□□ -0.91
CTIF-201ENST00000256413 AKAP13Q12802 2813 aa9.34□□□□□ -0.91
CTIF-201ENST00000256413 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
CTIF-201ENST00000256413 CFAP54Q96N23 3096 aa9.32□□□□□ -0.92
CTIF-201ENST00000256413 ATRQ13535 2644 aa9.3□□□□□ -0.92
CTIF-201ENST00000256413 M0QZ58 72 aa9.28□□□□□ -0.92
CTIF-201ENST00000256413 CHD6Q8TD26 2715 aa9.27□□□□□ -0.93
CTIF-201ENST00000256413 A8MUU9 505 aa9.27□□□□□ -0.93
CTIF-201ENST00000256413 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
CTIF-201ENST00000256413 UTRNP46939 3433 aa9.25□□□□□ -0.93
CTIF-201ENST00000256413 UNC79Q9P2D8 2635 aa9.25□□□□□ -0.93
CTIF-201ENST00000256413 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
CTIF-201ENST00000256413 ITPR3Q14573 2671 aa9.23□□□□□ -0.93
CTIF-201ENST00000256413 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa9.22□□□□□ -0.93
CTIF-201ENST00000256413 C5orf42Q9H799 3197 aa9.21□□□□□ -0.93
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa9.21□□□□□ -0.94
CTIF-201ENST00000256413 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
CTIF-201ENST00000256413 PCNTO95613 3336 aa9.19□□□□□ -0.94
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa9.18□□□□□ -0.94
CTIF-201ENST00000256413 CHD7Q9P2D1 2997 aa9.18□□□□□ -0.94
CTIF-201ENST00000256413 HECTD1Q9ULT8 2610 aa9.17□□□□□ -0.94
CTIF-201ENST00000256413 PLAC4Q8WY50 150 aa9.14□□□□□ -0.95
CTIF-201ENST00000256413 CENPEQ02224 2701 aa9.1□□□□□ -0.95
CTIF-201ENST00000256413 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa9.09□□□□□ -0.95
CTIF-201ENST00000256413 MAST4O15021 2626 aa9.07□□□□□ -0.96
CTIF-201ENST00000256413 NOTCH1P46531 2555 aa9.06□□□□□ -0.96
CTIF-201ENST00000256413 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa9.04□□□□□ -0.96
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP10-1P60331 282 aa9.03□□□□□ -0.96
CTIF-201ENST00000256413 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa9.01□□□□□ -0.97
CTIF-201ENST00000256413 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP10-2P60368 255 aa8.99□□□□□ -0.97
CTIF-201ENST00000256413 STAB1Q9NY15 2570 aa8.96□□□□□ -0.98
CTIF-201ENST00000256413 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
CTIF-201ENST00000256413 CHD9Q3L8U1 2897 aa8.95□□□□□ -0.98
CTIF-201ENST00000256413 RPS29P62273 56 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
CTIF-201ENST00000256413 FREM2Q5SZK8 3169 aa8.9□□□□□ -0.98
CTIF-201ENST00000256413 MGAQ8IWI9 3026 aa8.9□□□□□ -0.98
CTIF-201ENST00000256413 C10orf95Q9H7T3 257 aa8.89□□□□□ -0.99
CTIF-201ENST00000256413 COL6A5A8TX70 2615 aa8.88□□□□□ -0.99
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa8.87□□□□□ -0.99
CTIF-201ENST00000256413 H0YAA0 97 aa8.87□□□□□ -0.99
CTIF-201ENST00000256413 CFAP46Q8IYW2 2715 aa8.86□□□□□ -0.99
CTIF-201ENST00000256413 STAB2Q8WWQ8 2551 aa8.86□□□□□ -0.99
CTIF-201ENST00000256413 FRYQ5TBA9 3013 aa8.85□□□□□ -0.99
CTIF-201ENST00000256413 ITPR1Q14643 2758 aa8.85□□□□□ -0.99
CTIF-201ENST00000256413 TEX15Q9BXT5 2789 aa8.83□□□□□ -1
CTIF-201ENST00000256413 BAHCC1Q9P281 2608 aa8.82□□□□□ -1
CTIF-201ENST00000256413 TRIOO75962 3097 aa8.81□□□□□ -1
CTIF-201ENST00000256413 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
CTIF-201ENST00000256413 P0C880 135 aa8.77□□□□□ -1
CTIF-201ENST00000256413 KALRNO60229 2985 aa8.74□□□□□ -1.01
CTIF-201ENST00000256413 HTTP42858 3142 aa8.73□□□□□ -1.01
CTIF-201ENST00000256413 TRANK1O15050 2925 aa8.71□□□□□ -1.01
CTIF-201ENST00000256413 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
CTIF-201ENST00000256413 NBEAQ8NFP9 2946 aa8.71□□□□□ -1.02
CTIF-201ENST00000256413 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
CTIF-201ENST00000256413 PP632Q6XCG6 107 aa8.69□□□□□ -1.02
CTIF-201ENST00000256413 TNP1P09430 55 aa8.69□□□□□ -1.02
CTIF-201ENST00000256413 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
CTIF-201ENST00000256413 WDFY4Q6ZS81 3184 aa8.68□□□□□ -1.02
CTIF-201ENST00000256413 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CTIF-201ENST00000256413 DSPP15924 2871 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CTIF-201ENST00000256413 VPS13AQ96RL7 3174 aa8.61□□□□□ -1.03
CTIF-201ENST00000256413 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
CTIF-201ENST00000256413 APCP25054 2843 aa8.6□□□□□ -1.03
CTIF-201ENST00000256413 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
CTIF-201ENST00000256413 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa8.59□□□□□ -1.03
CTIF-201ENST00000256413 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
CTIF-201ENST00000256413 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CTIF-201ENST00000256413 ZNF292O60281 2723 aa8.54□□□□□ -1.04
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP10-8P60410 259 aa8.51□□□□□ -1.05
CTIF-201ENST00000256413 LAMA3Q16787 3333 aa8.49□□□□□ -1.05
CTIF-201ENST00000256413 LRBAP50851 2863 aa8.49□□□□□ -1.05
CTIF-201ENST00000256413 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa8.47□□□□□ -1.05
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa8.43□□□□□ -1.06
CTIF-201ENST00000256413 UNC80Q8N2C7 3258 aa8.43□□□□□ -1.06
CTIF-201ENST00000256413 BRCA2P51587 3418 aa8.41□□□□□ -1.06
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