RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628904.2

PKP4-217, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

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Gene PKP4, Length 3,856 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-217ENST00000628904 M0QXV9 152 aa4.95□□□□□ -1.62
PKP4-217ENST00000628904 M0R378 163 aa4.95□□□□□ -1.62
PKP4-217ENST00000628904 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa4.95□□□□□ -1.62
PKP4-217ENST00000628904 LINC01600Q96MT4 127 aa4.95□□□□□ -1.62
PKP4-217ENST00000628904 LINC00643Q86TS7 51 aa4.94□□□□□ -1.62
PKP4-217ENST00000628904 C22orf24Q9Y442 160 aa4.94□□□□□ -1.62
PKP4-217ENST00000628904 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa4.94□□□□□ -1.62
PKP4-217ENST00000628904 UBE2AP49459 152 aa4.94□□□□□ -1.62
PKP4-217ENST00000628904 LINC00167Q96N53 147 aa4.94□□□□□ -1.62
PKP4-217ENST00000628904 F8WEM9 126 aa4.93□□□□□ -1.62
PKP4-217ENST00000628904 VPREB1P12018 145 aa4.92□□□□□ -1.62
PKP4-217ENST00000628904 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
PKP4-217ENST00000628904 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa4.92□□□□□ -1.62
PKP4-217ENST00000628904 NDUFC2O95298 119 aa4.92□□□□□ -1.62
PKP4-217ENST00000628904 TNP2Q05952 138 aa4.92□□□□□ -1.62
PKP4-217ENST00000628904 NREPQ16612 68 aa4.92□□□□□ -1.62
PKP4-217ENST00000628904 UPK3BQ9BT76 320 aa4.92□□□□□ -1.62
PKP4-217ENST00000628904 ACYP1P07311 99 aa4.91□□□□□ -1.62
PKP4-217ENST00000628904 TM2D3Q9BRN9 247 aa4.91□□□□□ -1.62
PKP4-217ENST00000628904 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
PKP4-217ENST00000628904 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa4.9□□□□□ -1.63
PKP4-217ENST00000628904 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa4.89□□□□□ -1.63
PKP4-217ENST00000628904 C20orf197Q8N268 126 aa4.89□□□□□ -1.63
PKP4-217ENST00000628904 SNURFQ9Y675 71 aa4.89□□□□□ -1.63
PKP4-217ENST00000628904 IGLV6-57P01721 117 aa4.89□□□□□ -1.63
PKP4-217ENST00000628904 ANK2Q01484 3957 aa4.89□□□□□ -1.63
PKP4-217ENST00000628904 ERC2-IT1O76042 136 aa4.88□□□□□ -1.63
PKP4-217ENST00000628904 LINC01561Q8N1V8 128 aa4.88□□□□□ -1.63
PKP4-217ENST00000628904 C2orf48Q96LS8 159 aa4.88□□□□□ -1.63
PKP4-217ENST00000628904 H3BNG1 76 aa4.88□□□□□ -1.63
PKP4-217ENST00000628904 MUC7Q8TAX7 377 aa4.88□□□□□ -1.63
PKP4-217ENST00000628904 ANAPC11Q9NYG5 84 aa4.87□□□□□ -1.63
PKP4-217ENST00000628904 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
PKP4-217ENST00000628904 BPY2O14599 106 aa4.86□□□□□ -1.63
PKP4-217ENST00000628904 REG3GQ6UW15 175 aa4.86□□□□□ -1.63
PKP4-217ENST00000628904 RPS28P62857 69 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
PKP4-217ENST00000628904 Q6ZVQ6 151 aa4.86□□□□□ -1.63
PKP4-217ENST00000628904 H3BS24 57 aa4.86□□□□□ -1.63
PKP4-217ENST00000628904 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PKP4-217ENST00000628904 C1orf137Q5JT78 98 aa4.85□□□□□ -1.63
PKP4-217ENST00000628904 WFDC13Q8IUB5 93 aa4.85□□□□□ -1.63
PKP4-217ENST00000628904 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa4.85□□□□□ -1.63
PKP4-217ENST00000628904 PRR4Q16378 134 aa4.85□□□□□ -1.63
PKP4-217ENST00000628904 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa4.85□□□□□ -1.63
PKP4-217ENST00000628904 SPINK6Q6UWN8 80 aa4.85□□□□□ -1.63
PKP4-217ENST00000628904 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa4.84□□□□□ -1.63
PKP4-217ENST00000628904 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa4.84□□□□□ -1.63
PKP4-217ENST00000628904 B9D2Q9BPU9 175 aa4.84□□□□□ -1.63
PKP4-217ENST00000628904 A0A087WSZ3 146 aa4.84□□□□□ -1.64
PKP4-217ENST00000628904 Q6JHZ5 121 aa4.84□□□□□ -1.64
PKP4-217ENST00000628904 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
PKP4-217ENST00000628904 NUPR2A6NF83 97 aa4.83□□□□□ -1.64
PKP4-217ENST00000628904 H0Y9J4 135 aa4.83□□□□□ -1.64
PKP4-217ENST00000628904 Q6ZQT0 140 aa4.83□□□□□ -1.64
PKP4-217ENST00000628904 APLNQ9ULZ1 77 aa4.82□□□□□ -1.64
PKP4-217ENST00000628904 FAM30AQ9NZY2 134 aa4.82□□□□□ -1.64
PKP4-217ENST00000628904 ATOX1O00244 68 aa4.82□□□□□ -1.64
PKP4-217ENST00000628904 Q6ZRX8 168 aa4.82□□□□□ -1.64
PKP4-217ENST00000628904 Q8N377 158 aa4.82□□□□□ -1.64
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PKP4-217ENST00000628904 FBN3Q75N90 2809 aa4.81□□□□□ -1.64
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PKP4-217ENST00000628904 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa4.8□□□□□ -1.64
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PKP4-217ENST00000628904 EPM2AB3EWF7 344 aa4.8□□□□□ -1.64
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PKP4-217ENST00000628904 C14orf177Q52M58 125 aa4.79□□□□□ -1.64
PKP4-217ENST00000628904 FAM229AH3BQW9 127 aa4.79□□□□□ -1.64
PKP4-217ENST00000628904 IMUPQ9GZP8 106 aa4.79□□□□□ -1.64
PKP4-217ENST00000628904 C1orf134Q5TEV5 83 aa4.78□□□□□ -1.64
PKP4-217ENST00000628904 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
PKP4-217ENST00000628904 C16orf90A8MZG2 172 aa4.78□□□□□ -1.64
PKP4-217ENST00000628904 LINC00476Q8WZB0 136 aa4.78□□□□□ -1.64
PKP4-217ENST00000628904 KCNQ1DNQ9H478 68 aa4.78□□□□□ -1.64
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PKP4-217ENST00000628904 Q5XG85 94 aa4.77□□□□□ -1.65
PKP4-217ENST00000628904 CRYGAP11844 174 aa4.77□□□□□ -1.65
PKP4-217ENST00000628904 COX7CP15954 63 aa4.77□□□□□ -1.65
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PKP4-217ENST00000628904 PRYO14603 147 aa4.76□□□□□ -1.65
PKP4-217ENST00000628904 PDE6GP18545 87 aa4.76□□□□□ -1.65
PKP4-217ENST00000628904 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa4.76□□□□□ -1.65
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PKP4-217ENST00000628904 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa4.76□□□□□ -1.65
PKP4-217ENST00000628904 CYSTM1Q9H1C7 97 aa4.75□□□□□ -1.65
PKP4-217ENST00000628904 CDK2AP2O75956 126 aa4.75□□□□□ -1.65
PKP4-217ENST00000628904 OXTP01178 125 aa4.75□□□□□ -1.65
PKP4-217ENST00000628904 RETNLBQ9BQ08 111 aa4.74□□□□□ -1.65
PKP4-217ENST00000628904 A0A087WTM6 91 aa4.74□□□□□ -1.65
PKP4-217ENST00000628904 A0A1W2PNM2 257 aa4.74□□□□□ -1.65
PKP4-217ENST00000628904 SMIM29Q86T20 159 aa4.74□□□□□ -1.65
PKP4-217ENST00000628904 MOBPQ13875 183 aa4.73□□□□□ -1.65
PKP4-217ENST00000628904 MPLKIPQ8TAP9 179 aa4.73□□□□□ -1.65
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