RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607561.1

RNU6-87P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 87, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-87P, Length 108 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-87P-201ENST00000607561 PEA15Q15121 130 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-87P-201ENST00000607561 V9GYS6 101 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-87P-201ENST00000607561 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-87P-201ENST00000607561 UBR3Q6ZT12 1888 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-87P-201ENST00000607561 NESP48681 1621 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-87P-201ENST00000607561 DOT1LQ8TEK3 1739 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-87P-201ENST00000607561 ACANP16112 2415 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-87P-201ENST00000607561 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-87P-201ENST00000607561 IQCF6A8MYZ5 107 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-87P-201ENST00000607561 SMIM11AP58511 58 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-87P-201ENST00000607561 PLGLAQ15195 96 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-87P-201ENST00000607561 PYY3Q5JQD4 70 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-87P-201ENST00000607561 PLIN4Q96Q06 1357 aa-0.22□□□□□ -2.45
RNU6-87P-201ENST00000607561 SMARCA2P51531 1590 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-87P-201ENST00000607561 NWD1Q149M9 1564 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-87P-201ENST00000607561 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-87P-201ENST00000607561 A0A1B0GUT8 65 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-87P-201ENST00000607561 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-87P-201ENST00000607561 DEFB135Q30KP9 77 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-87P-201ENST00000607561 C9orf62Q8N4C0 152 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-87P-201ENST00000607561 DIP2BQ9P265 1576 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-87P-201ENST00000607561 PIK3C2BO00750 1634 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-87P-201ENST00000607561 PCNX1Q96RV3 2341 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-87P-201ENST00000607561 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-87P-201ENST00000607561 SPRR2AP35326 72 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-87P-201ENST00000607561 Q9H521 79 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-87P-201ENST00000607561 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-87P-201ENST00000607561 RABAC1Q9UI14 185 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-87P-201ENST00000607561 MED14O60244 1454 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-87P-201ENST00000607561 SVEP1Q4LDE5 3571 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-87P-201ENST00000607561 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-87P-201ENST00000607561 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-87P-201ENST00000607561 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-87P-201ENST00000607561 HEPN1Q6WQI6 88 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-87P-201ENST00000607561 COX6B2Q6YFQ2 88 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-87P-201ENST00000607561 LINC00643Q86TS7 51 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-87P-201ENST00000607561 WFDC13Q8IUB5 93 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-87P-201ENST00000607561 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-87P-201ENST00000607561 GAFA1Q96PS6 74 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-87P-201ENST00000607561 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-87P-201ENST00000607561 PLXNC1O60486 1568 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-87P-201ENST00000607561 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-87P-201ENST00000607561 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-87P-201ENST00000607561 KNL1Q8NG31 2342 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-87P-201ENST00000607561 SCN11AQ9UI33 1791 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-87P-201ENST00000607561 WIZO95785 1651 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-87P-201ENST00000607561 FAT3Q8TDW7 4589 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-87P-201ENST00000607561 UACAQ9BZF9 1416 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-87P-201ENST00000607561 TRAV21A0A0B4J279 112 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-87P-201ENST00000607561 CYB5AP00167 134 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-87P-201ENST00000607561 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-87P-201ENST00000607561 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-87P-201ENST00000607561 PDZD2O15018 2839 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-87P-201ENST00000607561 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-87P-201ENST00000607561 NCOA2Q15596 1464 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-87P-201ENST00000607561 RPL38P63173 70 aaKnown RBP-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-87P-201ENST00000607561 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-87P-201ENST00000607561 TDRG1Q3Y452 100 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-87P-201ENST00000607561 CFAP43Q8NDM7 1665 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-87P-201ENST00000607561 CCDC88BA6NC98 1476 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-87P-201ENST00000607561 CEBPZOSA8MTT3 80 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-87P-201ENST00000607561 ACYP1P07311 99 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-87P-201ENST00000607561 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-87P-201ENST00000607561 PLCH1Q4KWH8 1693 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-87P-201ENST00000607561 NDUFA3O95167 84 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-87P-201ENST00000607561 SPRR2EP22531 72 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-87P-201ENST00000607561 GNG2P59768 71 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-87P-201ENST00000607561 WFDC9Q8NEX5 89 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-87P-201ENST00000607561 TRANK1O15050 2925 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-87P-201ENST00000607561 KDM5DQ9BY66 1539 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-87P-201ENST00000607561 LYSTQ99698 3801 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-87P-201ENST00000607561 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-87P-201ENST00000607561 DEPDC5O75140 1603 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-87P-201ENST00000607561 DNAH6Q9C0G6 4158 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-87P-201ENST00000607561 CFAP74Q9C0B2 1584 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-87P-201ENST00000607561 LCE6AA0A183 80 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-87P-201ENST00000607561 NDUFB1O75438 58 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-87P-201ENST00000607561 PCLOQ9Y6V0 5065 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-87P-201ENST00000607561 DNAH9Q9NYC9 4486 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-87P-201ENST00000607561 AKAP13Q12802 2813 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-87P-201ENST00000607561 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-87P-201ENST00000607561 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-87P-201ENST00000607561 ERVK-7P63135 1459 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-87P-201ENST00000607561 STAB2Q8WWQ8 2551 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-87P-201ENST00000607561 HERC1Q15751 4861 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-87P-201ENST00000607561 NBASA2RRP1 2371 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-87P-201ENST00000607561 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-87P-201ENST00000607561 RICTORQ6R327 1708 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-87P-201ENST00000607561 LAMA5O15230 3695 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-87P-201ENST00000607561 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-87P-201ENST00000607561 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-87P-201ENST00000607561 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-87P-201ENST00000607561 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-87P-201ENST00000607561 CCDC18Q5T9S5 1454 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-87P-201ENST00000607561 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-87P-201ENST00000607561 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-87P-201ENST00000607561 H0YAA0 97 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-87P-201ENST00000607561 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-87P-201ENST00000607561 SPTBN4Q9H254 2564 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-87P-201ENST00000607561 ITSN1Q15811 1721 aa-0.33□□□□□ -2.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.9 ms