RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584328.1

NF1-223, Transcript of neurofibromin 1, human

TSL 2

Gene NF1, Length 566 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NF1-223	ENST00000584328		F5H768	121 aa		3.43	□□□□□ -1.86
NF1-223	ENST00000584328		H0YGX0	51 aa		3.43	□□□□□ -1.86
NF1-223	ENST00000584328	IGHV3-53	P01767	116 aa		3.43	□□□□□ -1.86
NF1-223	ENST00000584328	C9orf153	Q5TBE3	101 aa		3.43	□□□□□ -1.86
NF1-223	ENST00000584328	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		3.43	□□□□□ -1.86
NF1-223	ENST00000584328	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
NF1-223	ENST00000584328	PKD1	P98161	4303 aa		3.42	□□□□□ -1.86
NF1-223	ENST00000584328	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		3.42	□□□□□ -1.86
NF1-223	ENST00000584328	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		3.42	□□□□□ -1.86
NF1-223	ENST00000584328	FAM236A	A0A1B0GUQ0	79 aa		3.42	□□□□□ -1.86
NF1-223	ENST00000584328	FAM236B	A0A1B0GV22	79 aa		3.42	□□□□□ -1.86
NF1-223	ENST00000584328		J3KT08	172 aa		3.42	□□□□□ -1.86
NF1-223	ENST00000584328	BAALC-AS2	P0C853	105 aa		3.42	□□□□□ -1.86
NF1-223	ENST00000584328	CRYGA	P11844	174 aa		3.42	□□□□□ -1.86
NF1-223	ENST00000584328	HTN3	P15516	51 aa		3.42	□□□□□ -1.86
NF1-223	ENST00000584328	COX7C	P15954	63 aa		3.42	□□□□□ -1.86
NF1-223	ENST00000584328	C5orf47	Q569G3	176 aa		3.42	□□□□□ -1.86
NF1-223	ENST00000584328	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		3.42	□□□□□ -1.86
NF1-223	ENST00000584328	OR13C6P	Q8NH95	151 aa		3.42	□□□□□ -1.86
NF1-223	ENST00000584328	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		3.42	□□□□□ -1.86
NF1-223	ENST00000584328	UPK3B	Q9BT76	320 aa		3.42	□□□□□ -1.86
NF1-223	ENST00000584328		Q9UF83	564 aa		3.42	□□□□□ -1.86
NF1-223	ENST00000584328	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		3.41	□□□□□ -1.86
NF1-223	ENST00000584328	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		3.41	□□□□□ -1.86
NF1-223	ENST00000584328	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
NF1-223	ENST00000584328	ESRG	Q1W209	222 aa		3.41	□□□□□ -1.86
NF1-223	ENST00000584328	CLEC2B	Q92478	149 aa		3.41	□□□□□ -1.86
NF1-223	ENST00000584328	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		3.41	□□□□□ -1.86
NF1-223	ENST00000584328	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		3.41	□□□□□ -1.86
NF1-223	ENST00000584328	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		3.41	□□□□□ -1.86
NF1-223	ENST00000584328	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		3.4	□□□□□ -1.87
NF1-223	ENST00000584328	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		3.4	□□□□□ -1.87
NF1-223	ENST00000584328	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		3.4	□□□□□ -1.87
NF1-223	ENST00000584328	BCE1	O60756	84 aa		3.4	□□□□□ -1.87
NF1-223	ENST00000584328	DNAL4	O96015	105 aa		3.4	□□□□□ -1.87
NF1-223	ENST00000584328	TMEM258	P61165	79 aa		3.4	□□□□□ -1.87
NF1-223	ENST00000584328	HIST1H4A	P62805	103 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
NF1-223	ENST00000584328	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		3.4	□□□□□ -1.87
NF1-223	ENST00000584328		Q6ZVQ6	151 aa		3.4	□□□□□ -1.87
NF1-223	ENST00000584328	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
NF1-223	ENST00000584328	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		3.4	□□□□□ -1.87
NF1-223	ENST00000584328	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
NF1-223	ENST00000584328	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
NF1-223	ENST00000584328	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		3.39	□□□□□ -1.87
NF1-223	ENST00000584328	KRTAP5-9	P26371	169 aa		3.39	□□□□□ -1.87
NF1-223	ENST00000584328	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
NF1-223	ENST00000584328	ATP5EP2	Q5VTU8	51 aa		3.39	□□□□□ -1.87
NF1-223	ENST00000584328		Q6JHZ5	121 aa		3.39	□□□□□ -1.87
NF1-223	ENST00000584328	FAM104A	Q969W3	186 aa		3.39	□□□□□ -1.87
NF1-223	ENST00000584328	RYR1	P21817	5038 aa		3.39	□□□□□ -1.87
NF1-223	ENST00000584328		H3BQ85	93 aa		3.38	□□□□□ -1.87
NF1-223	ENST00000584328	CRP	P02741	224 aa		3.38	□□□□□ -1.87
NF1-223	ENST00000584328	CCL18	P55774	89 aa		3.38	□□□□□ -1.87
NF1-223	ENST00000584328	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		3.38	□□□□□ -1.87
NF1-223	ENST00000584328	SERP2	Q8N6R1	65 aa		3.38	□□□□□ -1.87
NF1-223	ENST00000584328	OBSCN-AS1	Q96MR7	158 aa		3.38	□□□□□ -1.87
NF1-223	ENST00000584328	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		3.38	□□□□□ -1.87
NF1-223	ENST00000584328	PKHD1	P08F94	4074 aa		3.38	□□□□□ -1.87
NF1-223	ENST00000584328	NACA	E9PAV3	2078 aa		3.37	□□□□□ -1.87
NF1-223	ENST00000584328	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		3.37	□□□□□ -1.87
NF1-223	ENST00000584328	JMJD7-PLA2G4B	H0Y9G9	81 aa		3.37	□□□□□ -1.87
NF1-223	ENST00000584328	NDUFC2	O95298	119 aa		3.37	□□□□□ -1.87
NF1-223	ENST00000584328	LY6G6C	O95867	125 aa		3.37	□□□□□ -1.87
NF1-223	ENST00000584328	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		3.37	□□□□□ -1.87
NF1-223	ENST00000584328	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		3.37	□□□□□ -1.87
NF1-223	ENST00000584328	LELP1	Q5T871	98 aa		3.37	□□□□□ -1.87
NF1-223	ENST00000584328	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		3.37	□□□□□ -1.87
NF1-223	ENST00000584328	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
NF1-223	ENST00000584328	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		3.36	□□□□□ -1.87
NF1-223	ENST00000584328	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		3.36	□□□□□ -1.87
NF1-223	ENST00000584328	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		3.36	□□□□□ -1.87
NF1-223	ENST00000584328	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		3.36	□□□□□ -1.87
NF1-223	ENST00000584328	hADV29S1	A0JD25	119 aa		3.36	□□□□□ -1.87
NF1-223	ENST00000584328	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		3.36	□□□□□ -1.87
NF1-223	ENST00000584328	SEC61G	P60059	68 aa		3.36	□□□□□ -1.87
NF1-223	ENST00000584328		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
NF1-223	ENST00000584328	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		3.36	□□□□□ -1.87
NF1-223	ENST00000584328	HERC2	O95714	4834 aa		3.36	□□□□□ -1.87
NF1-223	ENST00000584328	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
NF1-223	ENST00000584328	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
NF1-223	ENST00000584328	RTL8C	O15255	209 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NF1-223	ENST00000584328	NPC2	P61916	151 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NF1-223	ENST00000584328	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
NF1-223	ENST00000584328	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NF1-223	ENST00000584328	TMEM243	Q9BU79	118 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NF1-223	ENST00000584328	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NF1-223	ENST00000584328	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NF1-223	ENST00000584328	TMEM256-PLSCR3	K7ERE1	68 aa		3.34	□□□□□ -1.87
NF1-223	ENST00000584328	UBE2L6	O14933	153 aa		3.34	□□□□□ -1.87
NF1-223	ENST00000584328	CCK	P06307	115 aa		3.34	□□□□□ -1.87
NF1-223	ENST00000584328	COX6A2	Q02221	97 aa		3.34	□□□□□ -1.87
NF1-223	ENST00000584328	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		3.34	□□□□□ -1.87
NF1-223	ENST00000584328	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		3.34	□□□□□ -1.87
NF1-223	ENST00000584328	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		3.34	□□□□□ -1.87
NF1-223	ENST00000584328	COX7B2	Q8TF08	81 aa		3.34	□□□□□ -1.87
NF1-223	ENST00000584328	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		3.34	□□□□□ -1.87
NF1-223	ENST00000584328	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		3.34	□□□□□ -1.87
NF1-223	ENST00000584328	ORMDL1	Q9P0S3	153 aa		3.34	□□□□□ -1.87
NF1-223	ENST00000584328	C22orf24	Q9Y442	160 aa		3.34	□□□□□ -1.87
NF1-223	ENST00000584328	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.88

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