RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 J3QQQ9 107 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRM-214ENST00000583153 PRSS2P07478 247 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRM-214ENST00000583153 ATXN8Q156A1 80 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRM-214ENST00000583153 GAGE2EQ4V326 116 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRM-214ENST00000583153 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRM-214ENST00000583153 GAGE2DQ9UEU5 116 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRM-214ENST00000583153 A0A1W2PNN7 141 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM223A0PJW6 202 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRM-214ENST00000583153 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRM-214ENST00000583153 TOMM7Q9P0U1 55 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRM-214ENST00000583153 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRM-214ENST00000583153 SNCGO76070 127 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRM-214ENST00000583153 IFITM1P13164 125 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRM-214ENST00000583153 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRM-214ENST00000583153 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRM-214ENST00000583153 TSPEAR-AS2P59090 65 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRM-214ENST00000583153 HERVK_113P63121 156 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRM-214ENST00000583153 PRR3P79522 188 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRM-214ENST00000583153 C6orf226Q5I0X4 101 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRM-214ENST00000583153 C10orf25Q5T742 122 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRM-214ENST00000583153 Q6ZRP5 223 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRM-214ENST00000583153 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRM-214ENST00000583153 C6orf48Q9UBA6 75 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRM-214ENST00000583153 A4D1N5 150 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRM-214ENST00000583153 C9JAW5 83 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRM-214ENST00000583153 H3BT86 120 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRM-214ENST00000583153 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
PTPRM-214ENST00000583153 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRM-214ENST00000583153 C2orf82Q6UX34 121 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRM-214ENST00000583153 MUSTN1Q8IVN3 82 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRM-214ENST00000583153 LINC01561Q8N1V8 128 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRM-214ENST00000583153 KIAA0087Q14695 138 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM170BQ5T4T1 132 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRM-214ENST00000583153 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
PTPRM-214ENST00000583153 SPANXCQ9NY87 97 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRM-214ENST00000583153 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRM-214ENST00000583153 B5MCH6 92 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRM-214ENST00000583153 TIMM17BO60830 172 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRM-214ENST00000583153 TLX1NBP0CAT3 122 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
PTPRM-214ENST00000583153 SPINK6Q6UWN8 80 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRM-214ENST00000583153 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
PTPRM-214ENST00000583153 IMUPQ9GZP8 106 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRM-214ENST00000583153 HMCN2Q8NDA2 5059 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRM-214ENST00000583153 A0A0J9YXY3 114 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRM-214ENST00000583153 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRM-214ENST00000583153 FAM168BA1KXE4 195 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRM-214ENST00000583153 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRM-214ENST00000583153 ACYP1P07311 99 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRM-214ENST00000583153 COX6CP09669 75 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRM-214ENST00000583153 C1orf137Q5JT78 98 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRM-214ENST00000583153 REG3GQ6UW15 175 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRM-214ENST00000583153 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRM-214ENST00000583153 Q8IZM0 81 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRM-214ENST00000583153 LITAFQ99732 161 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM126AQ9H061 195 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRM-214ENST00000583153 SS18L2Q9UHA2 77 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRM-214ENST00000583153 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRM-214ENST00000583153 UBE2BP63146 152 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRM-214ENST00000583153 LCE4AQ5TA78 99 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRM-214ENST00000583153 SFTA2Q6UW10 78 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRM-214ENST00000583153 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRM-214ENST00000583153 CCDC179H3BU77 68 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRM-214ENST00000583153 TRIAP1O43715 76 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRM-214ENST00000583153 PPDPFQ9H3Y8 114 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRM-214ENST00000583153 LST1O00453 97 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRM-214ENST00000583153 MT1HL1P0DM35 61 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRM-214ENST00000583153 CXCL5P42830 114 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRM-214ENST00000583153 COX7B2Q8TF08 81 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRM-214ENST00000583153 XAGE1AQ9HD64 81 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRM-214ENST00000583153 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRM-214ENST00000583153 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRM-214ENST00000583153 SMIM1B2RUZ4 78 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRM-214ENST00000583153 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRM-214ENST00000583153 TNXBP22105 4242 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRM-214ENST00000583153 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRM-214ENST00000583153 IGLV7-43P04211 117 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRM-214ENST00000583153 Q1RN00 199 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRM-214ENST00000583153 MEIG1Q5JSS6 88 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRM-214ENST00000583153 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRM-214ENST00000583153 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRM-214ENST00000583153 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRM-214ENST00000583153 COPS9Q8WXC6 57 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRM-214ENST00000583153 DIRC1Q969H9 104 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRM-214ENST00000583153 C22orf24Q9Y442 160 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRM-214ENST00000583153 LINC00643Q86TS7 51 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRM-214ENST00000583153 NDUFA12Q9UI09 145 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRM-214ENST00000583153 H7C2G1 150 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRM-214ENST00000583153 TRACP01848 142 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRM-214ENST00000583153 PFN2P35080 140 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRM-214ENST00000583153 HERV-K104P63124 156 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRM-214ENST00000583153 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRM-214ENST00000583153 UBR4Q5T4S7 5183 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRM-214ENST00000583153 KRTAP10-8P60410 259 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRM-214ENST00000583153 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
PTPRM-214ENST00000583153 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
PTPRM-214ENST00000583153 SMIM20Q8N5G0 67 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRM-214ENST00000583153 C3orf22Q8N5N4 141 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRM-214ENST00000583153 DAND5Q8N907 189 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
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