RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568227.5

SNAP23-215, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 4

Gene SNAP23, Length 599 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-215	ENST00000568227	TECTA	O75443	2155 aa		0.35	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	USP9Y	O00507	2555 aa	Predicted RBP	0.35	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		0.35	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	PTPRQ	Q9UMZ3	2332 aa		0.35	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	CEP290	O15078	2479 aa		0.35	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	0.35	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227		A0A087WWC5	75 aa		0.35	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		0.35	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227		A0A0J9YY99	117 aa		0.35	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		0.35	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	CXorf51A	A0A1B0GTR3	108 aa		0.35	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		0.35	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227		A0A1B0GWA3	101 aa		0.35	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	NAP1L6	A6NFF2	107 aa		0.35	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		0.35	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	TMEM14DP	A8MWL7	114 aa		0.35	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	SSSCA1	O60232	199 aa		0.35	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	SFT2D2	O95562	160 aa		0.35	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	LY6G6C	O95867	125 aa		0.35	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	IGHV3-33	P01772	117 aa		0.35	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	S100A3	P33764	101 aa		0.35	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	SPINT3	P49223	89 aa		0.35	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	EFNA4	P52798	201 aa		0.35	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	EDDM3B	P56851	147 aa		0.35	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	KRTDAP	P60985	99 aa		0.35	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	TFF3	Q07654	80 aa		0.35	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	SPAG11B	Q08648	103 aa		0.35	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227		Q0VG73	95 aa		0.35	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	WFDC2	Q14508	124 aa		0.35	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	PMCHL1	Q16048	86 aa		0.35	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	NMS	Q5H8A3	153 aa		0.35	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	BVES-AS1	Q5T3Y7	98 aa		0.35	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		0.35	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		0.35	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	C5orf38	Q86SI9	138 aa		0.35	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	TOMM5	Q8N4H5	51 aa		0.35	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	FDCSP	Q8NFU4	85 aa		0.35	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		0.35	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	COX7B2	Q8TF08	81 aa		0.35	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	AMELX	Q99217	191 aa		0.35	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		0.35	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	DPY30	Q9C005	99 aa		0.35	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		0.35	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	BET1L	Q9NYM9	111 aa		0.35	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		0.35	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		0.35	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		0.35	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227		V9GYS6	101 aa		0.35	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	MAST4	O15021	2626 aa		0.35	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	MYO7A	Q13402	2215 aa		0.35	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	JMJD1C	Q15652	2540 aa		0.35	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	0.35	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		0.35	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	0.35	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		0.35	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		0.35	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	HERC1	Q15751	4861 aa		0.35	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	0.34	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	ATR	Q13535	2644 aa		0.34	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	0.34	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		0.34	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		0.34	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		0.34	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		0.34	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		0.34	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	C10orf142	B7Z368	130 aa		0.34	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227		K7EP34	96 aa		0.34	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227		M0R135	149 aa		0.34	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	INE1	O15225	51 aa		0.34	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	GYPA	P02724	150 aa		0.34	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	HMGN2	P05204	90 aa	Known RBP	0.34	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	IAPP	P10997	89 aa		0.34	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	ACYP2	P14621	99 aa		0.34	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	CCL3L1	P16619	93 aa		0.34	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	HMGA1	P17096	107 aa	Known RBP	0.34	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	UBE2D1	P51668	147 aa		0.34	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	ATP5E	P56381	51 aa	Predicted RBP	0.34	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	0.34	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	CCL8	P80075	99 aa		0.34	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	HAMP	P81172	84 aa		0.34	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	PTPN13	Q12923	2485 aa		0.34	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		0.34	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		0.34	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	CNTRL	Q7Z7A1	2325 aa		0.34	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		0.34	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		0.34	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	KNL1	Q8NG31	2342 aa		0.34	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	ARHGAP5-AS1	Q96IT6	56 aa		0.34	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		0.34	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	MGST2	Q99735	147 aa		0.34	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	0.34	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	NMES1	Q9C002	83 aa		0.34	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		0.34	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	0.34	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		0.34	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	PLCE1	Q9P212	2302 aa		0.34	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227		R4GMQ9	66 aa		0.34	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		0.34	□□□□□ -2.36

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