RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

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Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRB-208ENST00000550358 A8MUN3 132 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRB-208ENST00000550358 DSCR10P59022 87 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRB-208ENST00000550358 SORL1Q92673 2214 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRB-208ENST00000550358 COX6B2Q6YFQ2 88 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRB-208ENST00000550358 SPG11Q96JI7 2443 aa5.46□□□□□ -1.53
PTPRB-208ENST00000550358 SPTBN4Q9H254 2564 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-208ENST00000550358 WNK1Q9H4A3 2382 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-208ENST00000550358 A0A1W2PNN7 141 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-208ENST00000550358 PKD1L2Q7Z442 2459 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-208ENST00000550358 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRB-208ENST00000550358 IGF2RP11717 2491 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRB-208ENST00000550358 EPG5Q9HCE0 2579 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRB-208ENST00000550358 DNAH12Q6ZR08 3092 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRB-208ENST00000550358 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
PTPRB-208ENST00000550358 PLAC8Q9NZF1 115 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRB-208ENST00000550358 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
PTPRB-208ENST00000550358 PTPN13Q12923 2485 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRB-208ENST00000550358 A0A1W2PNM2 257 aa5.41□□□□□ -1.54
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PTPRB-208ENST00000550358 CRIPTQ9P021 101 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-208ENST00000550358 USP24Q9UPU5 2620 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-208ENST00000550358 SPRR1BP22528 89 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRB-208ENST00000550358 CASC10Q5T4H9 136 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRB-208ENST00000550358 MUC4Q99102 2169 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRB-208ENST00000550358 CHD8Q9HCK8 2581 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRB-208ENST00000550358 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRB-208ENST00000550358 PCNTO95613 3336 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRB-208ENST00000550358 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
PTPRB-208ENST00000550358 SPRR1AP35321 89 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRB-208ENST00000550358 C4orf26Q17RF5 130 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRB-208ENST00000550358 H7BZZ5 65 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-208ENST00000550358 C9orf92A6NGG3 77 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-208ENST00000550358 NOTCH2Q04721 2471 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-208ENST00000550358 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRB-208ENST00000550358 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
PTPRB-208ENST00000550358 Q6ZSA8 131 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRB-208ENST00000550358 TNP2Q05952 138 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRB-208ENST00000550358 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRB-208ENST00000550358 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRB-208ENST00000550358 ABCA2Q9BZC7 2435 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRB-208ENST00000550358 CCDC168Q8NDH2 2452 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRB-208ENST00000550358 SPINT4Q6UDR6 99 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRB-208ENST00000550358 OCR1Q9BZK8 76 aa5.31□□□□□ -1.56
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PTPRB-208ENST00000550358 Q1T7F1 81 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRB-208ENST00000550358 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRB-208ENST00000550358 HRES1P13985 223 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRB-208ENST00000550358 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
PTPRB-208ENST00000550358 LRRK2Q5S007 2527 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRB-208ENST00000550358 SONP18583 2426 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
PTPRB-208ENST00000550358 LAMA3Q16787 3333 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRB-208ENST00000550358 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRB-208ENST00000550358 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRB-208ENST00000550358 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRB-208ENST00000550358 LCE6AA0A183 80 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRB-208ENST00000550358 CENPFP49454 3210 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRB-208ENST00000550358 CHD6Q8TD26 2715 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRB-208ENST00000550358 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRB-208ENST00000550358 LINC00483Q53H64 154 aa5.26□□□□□ -1.57
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PTPRB-208ENST00000550358 ZNF462Q96JM2 2506 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-208ENST00000550358 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-208ENST00000550358 LCA10Q71F78 164 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-208ENST00000550358 CFAP46Q8IYW2 2715 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRB-208ENST00000550358 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRB-208ENST00000550358 BRCA2P51587 3418 aa5.24□□□□□ -1.57
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PTPRB-208ENST00000550358 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRB-208ENST00000550358 OXTP01178 125 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRB-208ENST00000550358 PRR26Q8N8Z3 221 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRB-208ENST00000550358 Q75L30 129 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRB-208ENST00000550358 DMAC1Q96GE9 116 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRB-208ENST00000550358 CSAG1Q6PB30 78 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRB-208ENST00000550358 RPS29P62273 56 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.57
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PTPRB-208ENST00000550358 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRB-208ENST00000550358 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRB-208ENST00000550358 LINC00472Q9H8W2 130 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRB-208ENST00000550358 S4R3F8 94 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRB-208ENST00000550358 A0A0G2JQZ4 141 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRB-208ENST00000550358 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRB-208ENST00000550358 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRB-208ENST00000550358 Q8N1X5 172 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRB-208ENST00000550358 A0A1B0GU33 70 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRB-208ENST00000550358 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
PTPRB-208ENST00000550358 ITPR1Q14643 2758 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRB-208ENST00000550358 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRB-208ENST00000550358 REV3LO60673 3130 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRB-208ENST00000550358 C2CD3Q4AC94 2353 aa5.17□□□□□ -1.58
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PTPRB-208ENST00000550358 ABCA12Q86UK0 2595 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRB-208ENST00000550358 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
PTPRB-208ENST00000550358 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRB-208ENST00000550358 MYO9AB2RTY4 2548 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRB-208ENST00000550358 CR1P17927 2039 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRB-208ENST00000550358 AKAP13Q12802 2813 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRB-208ENST00000550358 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
PTPRB-208ENST00000550358 Q5W150 140 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRB-208ENST00000550358 Q6ZR54 194 aa5.14□□□□□ -1.59
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