RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488550.5

MEIS1-209, Transcript of Meis homeobox 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MEIS1, Length 5,111 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS1-209ENST00000488550 Q5W150 140 aa4.71□□□□□ -1.66
MEIS1-209ENST00000488550 Q6ZR54 194 aa4.7□□□□□ -1.66
MEIS1-209ENST00000488550 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa4.7□□□□□ -1.66
MEIS1-209ENST00000488550 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa4.7□□□□□ -1.66
MEIS1-209ENST00000488550 SPATA8Q6RVD6 105 aa4.7□□□□□ -1.66
MEIS1-209ENST00000488550 A6NN06 94 aa4.69□□□□□ -1.66
MEIS1-209ENST00000488550 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa4.68□□□□□ -1.66
MEIS1-209ENST00000488550 TECTAO75443 2155 aa4.68□□□□□ -1.66
MEIS1-209ENST00000488550 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
MEIS1-209ENST00000488550 J3QL48 77 aa4.67□□□□□ -1.66
MEIS1-209ENST00000488550 KRTAP10-11P60412 298 aa4.66□□□□□ -1.66
MEIS1-209ENST00000488550 CACNA1BQ00975 2339 aa4.65□□□□□ -1.66
MEIS1-209ENST00000488550 Q6ZSA8 131 aa4.65□□□□□ -1.67
MEIS1-209ENST00000488550 HIVEP2P31629 2446 aa4.65□□□□□ -1.67
MEIS1-209ENST00000488550 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa4.64□□□□□ -1.67
MEIS1-209ENST00000488550 PLAC8Q9NZF1 115 aa4.64□□□□□ -1.67
MEIS1-209ENST00000488550 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
MEIS1-209ENST00000488550 ACACAQ13085 2346 aa4.64□□□□□ -1.67
MEIS1-209ENST00000488550 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
MEIS1-209ENST00000488550 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
MEIS1-209ENST00000488550 K7EIL1 84 aa4.63□□□□□ -1.67
MEIS1-209ENST00000488550 ANAPC11Q9NYG5 84 aa4.63□□□□□ -1.67
MEIS1-209ENST00000488550 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
MEIS1-209ENST00000488550 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa4.63□□□□□ -1.67
MEIS1-209ENST00000488550 LCE6AA0A183 80 aa4.62□□□□□ -1.67
MEIS1-209ENST00000488550 PLCE1Q9P212 2302 aa4.61□□□□□ -1.67
MEIS1-209ENST00000488550 CASC10Q5T4H9 136 aa4.61□□□□□ -1.67
MEIS1-209ENST00000488550 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP4.6□□□□□ -1.674e-8■■■■■ 30.4
MEIS1-209ENST00000488550 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
MEIS1-209ENST00000488550 CREBBPQ92793 2442 aa4.6□□□□□ -1.67
MEIS1-209ENST00000488550 CACNA1GO43497 2377 aa4.58□□□□□ -1.68
MEIS1-209ENST00000488550 KRTAP10-3P60369 221 aa4.57□□□□□ -1.68
MEIS1-209ENST00000488550 R4GN34 69 aa4.56□□□□□ -1.68
MEIS1-209ENST00000488550 SORL1Q92673 2214 aa4.55□□□□□ -1.68
MEIS1-209ENST00000488550 MUC4Q99102 2169 aa4.55□□□□□ -1.68
MEIS1-209ENST00000488550 SPTBN2O15020 2390 aa4.55□□□□□ -1.68
MEIS1-209ENST00000488550 Q8NDZ9 215 aa4.55□□□□□ -1.68
MEIS1-209ENST00000488550 CACNA1HO95180 2353 aa4.54□□□□□ -1.68
MEIS1-209ENST00000488550 NOTCH3Q9UM47 2321 aa4.54□□□□□ -1.68
MEIS1-209ENST00000488550 GPR179Q6PRD1 2367 aa4.53□□□□□ -1.68
MEIS1-209ENST00000488550 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa4.53□□□□□ -1.69
MEIS1-209ENST00000488550 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
MEIS1-209ENST00000488550 PANO1I0J062 215 aa4.52□□□□□ -1.69
MEIS1-209ENST00000488550 PCNX1Q96RV3 2341 aa4.51□□□□□ -1.69
MEIS1-209ENST00000488550 RPS29P62273 56 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
MEIS1-209ENST00000488550 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa4.5□□□□□ -1.69
MEIS1-209ENST00000488550 WNK1Q9H4A3 2382 aa4.5□□□□□ -1.69
MEIS1-209ENST00000488550 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
MEIS1-209ENST00000488550 MED13LQ71F56 2210 aa4.48□□□□□ -1.69
MEIS1-209ENST00000488550 M0QZ58 72 aa4.48□□□□□ -1.69
MEIS1-209ENST00000488550 PLAC4Q8WY50 150 aa4.47□□□□□ -1.69
MEIS1-209ENST00000488550 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
MEIS1-209ENST00000488550 ADM2Q7Z4H4 148 aa4.44□□□□□ -1.7
MEIS1-209ENST00000488550 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa4.43□□□□□ -1.7
MEIS1-209ENST00000488550 NDUFAF8A1L188 74 aa4.41□□□□□ -1.7
MEIS1-209ENST00000488550 CSPG4Q6UVK1 2322 aa4.41□□□□□ -1.7
MEIS1-209ENST00000488550 KRTAP1-1Q07627 177 aa4.41□□□□□ -1.7
MEIS1-209ENST00000488550 PP632Q6XCG6 107 aa4.39□□□□□ -1.71
MEIS1-209ENST00000488550 NBASA2RRP1 2371 aa4.39□□□□□ -1.71
MEIS1-209ENST00000488550 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa4.37□□□□□ -1.71
MEIS1-209ENST00000488550 M0R2T5 61 aa4.37□□□□□ -1.71
MEIS1-209ENST00000488550 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa4.36□□□□□ -1.71
MEIS1-209ENST00000488550 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa4.35□□□□□ -1.71
MEIS1-209ENST00000488550 A8MUU9 505 aa4.34□□□□□ -1.71
MEIS1-209ENST00000488550 CR1P17927 2039 aa4.34□□□□□ -1.71
MEIS1-209ENST00000488550 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa4.33□□□□□ -1.72
MEIS1-209ENST00000488550 FAM208BQ5VWN6 2430 aa4.3□□□□□ -1.72
MEIS1-209ENST00000488550 A8MU10 97 aa4.3□□□□□ -1.72
MEIS1-209ENST00000488550 NAV2Q8IVL1 2488 aa4.29□□□□□ -1.72
MEIS1-209ENST00000488550 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa4.29□□□□□ -1.72
MEIS1-209ENST00000488550 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
MEIS1-209ENST00000488550 TNP1P09430 55 aa4.28□□□□□ -1.72
MEIS1-209ENST00000488550 C2CD3Q4AC94 2353 aa4.27□□□□□ -1.73
MEIS1-209ENST00000488550 TTC28Q96AY4 2481 aa4.27□□□□□ -1.73
MEIS1-209ENST00000488550 ABCA2Q9BZC7 2435 aa4.26□□□□□ -1.73
MEIS1-209ENST00000488550 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa4.26□□□□□ -1.73
MEIS1-209ENST00000488550 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa4.25□□□□□ -1.73
MEIS1-209ENST00000488550 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
MEIS1-209ENST00000488550 Q5VSD8 79 aa4.23□□□□□ -1.73
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MEIS1-209ENST00000488550 KRTAP10-1P60331 282 aa4.22□□□□□ -1.73
MEIS1-209ENST00000488550 MUC6Q6W4X9 2439 aa4.22□□□□□ -1.73
MEIS1-209ENST00000488550 C10orf95Q9H7T3 257 aa4.21□□□□□ -1.74
MEIS1-209ENST00000488550 P0C880 135 aa4.2□□□□□ -1.74
MEIS1-209ENST00000488550 ACACBO00763 2458 aa4.19□□□□□ -1.74
MEIS1-209ENST00000488550 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
MEIS1-209ENST00000488550 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa4.19□□□□□ -1.74
MEIS1-209ENST00000488550 SPG11Q96JI7 2443 aa4.18□□□□□ -1.74
MEIS1-209ENST00000488550 MYO18BQ8IUG5 2567 aa4.17□□□□□ -1.74
MEIS1-209ENST00000488550 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa4.15□□□□□ -1.74
MEIS1-209ENST00000488550 KRTAP10-2P60368 255 aa4.15□□□□□ -1.75
MEIS1-209ENST00000488550 F8P00451 2351 aa4.15□□□□□ -1.75
MEIS1-209ENST00000488550 CUL9Q8IWT3 2517 aa4.14□□□□□ -1.75
MEIS1-209ENST00000488550 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa4.12□□□□□ -1.75
MEIS1-209ENST00000488550 SONP18583 2426 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
MEIS1-209ENST00000488550 H0YAA0 97 aa4.11□□□□□ -1.75
MEIS1-209ENST00000488550 NOTCH2Q04721 2471 aa4.1□□□□□ -1.75
MEIS1-209ENST00000488550 CACNA1AO00555 2505 aa4.07□□□□□ -1.76
MEIS1-209ENST00000488550 PTPN13Q12923 2485 aa4.06□□□□□ -1.76
MEIS1-209ENST00000488550 LRRK2Q5S007 2527 aa4.03□□□□□ -1.76
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