RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463635.1

VWA3B-208, Transcript of von Willebrand factor A domain containing 3B, human

TSL 3

Gene VWA3B, Length 471 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VWA3B-208	ENST00000463635	CXCL5	P42830	114 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VWA3B-208	ENST00000463635		Q6ZVH6	145 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VWA3B-208	ENST00000463635	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VWA3B-208	ENST00000463635	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VWA3B-208	ENST00000463635	LINC00167	Q96N53	147 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VWA3B-208	ENST00000463635	LITAF	Q99732	161 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VWA3B-208	ENST00000463635	RETNLB	Q9BQ08	111 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VWA3B-208	ENST00000463635	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VWA3B-208	ENST00000463635	SPANXC	Q9NY87	97 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VWA3B-208	ENST00000463635	BCE1	O60756	84 aa		4.78	□□□□□ -1.64
VWA3B-208	ENST00000463635	CRYGA	P11844	174 aa		4.78	□□□□□ -1.64
VWA3B-208	ENST00000463635	IFITM1	P13164	125 aa		4.78	□□□□□ -1.64
VWA3B-208	ENST00000463635	LINC00158	P58513	81 aa		4.78	□□□□□ -1.64
VWA3B-208	ENST00000463635	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
VWA3B-208	ENST00000463635	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
VWA3B-208	ENST00000463635	PFN2	P35080	140 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VWA3B-208	ENST00000463635	NPC2	P61916	151 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VWA3B-208	ENST00000463635	TPRXL	Q17RH7	258 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VWA3B-208	ENST00000463635	LCE2D	Q5TA82	110 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
VWA3B-208	ENST00000463635	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
VWA3B-208	ENST00000463635	DAND5	Q8N907	189 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VWA3B-208	ENST00000463635	COPS9	Q8WXC6	57 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VWA3B-208	ENST00000463635	RAB37	Q96AX2	223 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VWA3B-208	ENST00000463635	KRTAP4-1	Q9BYQ7	146 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VWA3B-208	ENST00000463635	ERG28	Q9UKR5	140 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VWA3B-208	ENST00000463635		A0A1B0GV90	55 aa		4.76	□□□□□ -1.65
VWA3B-208	ENST00000463635		A4D1N5	150 aa		4.76	□□□□□ -1.65
VWA3B-208	ENST00000463635	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		4.76	□□□□□ -1.65
VWA3B-208	ENST00000463635		K7ERJ3	54 aa		4.76	□□□□□ -1.65
VWA3B-208	ENST00000463635	TAX1BP3	O14907	124 aa		4.76	□□□□□ -1.65
VWA3B-208	ENST00000463635	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		4.76	□□□□□ -1.65
VWA3B-208	ENST00000463635	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		4.75	□□□□□ -1.65
VWA3B-208	ENST00000463635		A0A1B0GWB2	263 aa		4.75	□□□□□ -1.65
VWA3B-208	ENST00000463635	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
VWA3B-208	ENST00000463635	COX17	Q14061	63 aa		4.75	□□□□□ -1.65
VWA3B-208	ENST00000463635	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		4.75	□□□□□ -1.65
VWA3B-208	ENST00000463635	C9orf118	A6NHY6	69 aa		4.74	□□□□□ -1.65
VWA3B-208	ENST00000463635	CFC1B	P0CG36	223 aa		4.74	□□□□□ -1.65
VWA3B-208	ENST00000463635	CFC1	P0CG37	223 aa		4.74	□□□□□ -1.65
VWA3B-208	ENST00000463635	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		4.74	□□□□□ -1.65
VWA3B-208	ENST00000463635	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		4.74	□□□□□ -1.65
VWA3B-208	ENST00000463635	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		4.73	□□□□□ -1.65
VWA3B-208	ENST00000463635		H3BUT2	72 aa		4.73	□□□□□ -1.65
VWA3B-208	ENST00000463635	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
VWA3B-208	ENST00000463635	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		4.73	□□□□□ -1.65
VWA3B-208	ENST00000463635	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		4.73	□□□□□ -1.65
VWA3B-208	ENST00000463635		A0A0B4J2C4	111 aa		4.72	□□□□□ -1.65
VWA3B-208	ENST00000463635	GAGE10	A6NGK3	116 aa		4.72	□□□□□ -1.65
VWA3B-208	ENST00000463635	VAMP3	Q15836	100 aa		4.72	□□□□□ -1.65
VWA3B-208	ENST00000463635	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		4.72	□□□□□ -1.65
VWA3B-208	ENST00000463635	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
VWA3B-208	ENST00000463635	CDIP1	Q9H305	208 aa		4.72	□□□□□ -1.65
VWA3B-208	ENST00000463635	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		4.72	□□□□□ -1.65
VWA3B-208	ENST00000463635	FSIP2	Q5CZC0	6907 aa		4.72	□□□□□ -1.65
VWA3B-208	ENST00000463635	C3orf22	Q8N5N4	141 aa		4.71	□□□□□ -1.66
VWA3B-208	ENST00000463635		A0A1W2PPM0	123 aa		4.7	□□□□□ -1.66
VWA3B-208	ENST00000463635		H7C2G1	150 aa		4.7	□□□□□ -1.66
VWA3B-208	ENST00000463635	FABP2	P12104	132 aa		4.7	□□□□□ -1.66
VWA3B-208	ENST00000463635		Q1RN00	199 aa		4.7	□□□□□ -1.66
VWA3B-208	ENST00000463635	LCE2C	Q5TA81	110 aa		4.7	□□□□□ -1.66
VWA3B-208	ENST00000463635		Q8NDZ9	215 aa		4.7	□□□□□ -1.66
VWA3B-208	ENST00000463635	CRCT1	Q9UGL9	99 aa		4.7	□□□□□ -1.66
VWA3B-208	ENST00000463635	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		4.69	□□□□□ -1.66
VWA3B-208	ENST00000463635	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		4.69	□□□□□ -1.66
VWA3B-208	ENST00000463635	PSMB2	P49721	201 aa		4.69	□□□□□ -1.66
VWA3B-208	ENST00000463635	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		4.69	□□□□□ -1.66
VWA3B-208	ENST00000463635	ASB16-AS1	Q495Z4	193 aa		4.69	□□□□□ -1.66
VWA3B-208	ENST00000463635	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		4.69	□□□□□ -1.66
VWA3B-208	ENST00000463635		M0R378	163 aa		4.68	□□□□□ -1.66
VWA3B-208	ENST00000463635	NDUFC2	O95298	119 aa		4.68	□□□□□ -1.66
VWA3B-208	ENST00000463635	SCGB1C2	P0DMR2	95 aa		4.68	□□□□□ -1.66
VWA3B-208	ENST00000463635	VPREB1	P12018	145 aa		4.68	□□□□□ -1.66
VWA3B-208	ENST00000463635	PRLH	P81277	87 aa		4.68	□□□□□ -1.66
VWA3B-208	ENST00000463635	GTF2H5	Q6ZYL4	71 aa		4.68	□□□□□ -1.66
VWA3B-208	ENST00000463635	SPCS1	Q9Y6A9	102 aa		4.68	□□□□□ -1.66
VWA3B-208	ENST00000463635	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		4.67	□□□□□ -1.66
VWA3B-208	ENST00000463635	IGKV2D-28	P01615	120 aa		4.67	□□□□□ -1.66
VWA3B-208	ENST00000463635	UBE2A	P49459	152 aa		4.67	□□□□□ -1.66
VWA3B-208	ENST00000463635	UBE2V1	Q13404	147 aa		4.67	□□□□□ -1.66
VWA3B-208	ENST00000463635	KRTAP19-2	Q3LHN2	52 aa		4.67	□□□□□ -1.66
VWA3B-208	ENST00000463635	OR13C6P	Q8NH95	151 aa		4.67	□□□□□ -1.66
VWA3B-208	ENST00000463635	TMEM126A	Q9H061	195 aa		4.67	□□□□□ -1.66
VWA3B-208	ENST00000463635		K7EP34	96 aa		4.66	□□□□□ -1.66
VWA3B-208	ENST00000463635	COX6C	P09669	75 aa		4.66	□□□□□ -1.66
VWA3B-208	ENST00000463635	LYRM7	Q5U5X0	104 aa		4.66	□□□□□ -1.66
VWA3B-208	ENST00000463635	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		4.66	□□□□□ -1.66
VWA3B-208	ENST00000463635	NCR3	O14931	201 aa		4.65	□□□□□ -1.67
VWA3B-208	ENST00000463635	TRIAP1	O43715	76 aa		4.65	□□□□□ -1.67
VWA3B-208	ENST00000463635	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		4.65	□□□□□ -1.67
VWA3B-208	ENST00000463635	TRBV20-1	A0A075B6N2	111 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VWA3B-208	ENST00000463635	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VWA3B-208	ENST00000463635	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
VWA3B-208	ENST00000463635	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VWA3B-208	ENST00000463635	SPRR4	Q96PI1	79 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VWA3B-208	ENST00000463635	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VWA3B-208	ENST00000463635	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VWA3B-208	ENST00000463635	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VWA3B-208	ENST00000463635	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VWA3B-208	ENST00000463635		H3BMG7	143 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VWA3B-208	ENST00000463635	TCL1B	O95988	128 aa		4.62	□□□□□ -1.67

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