RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462212.5

ITSN1-222, Transcript of intersectin 1, human

TSL 1 (best)

Gene ITSN1, Length 1,102 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ITSN1-222	ENST00000462212	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ITSN1-222	ENST00000462212	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ITSN1-222	ENST00000462212	PRY	O14603	147 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ITSN1-222	ENST00000462212	NCR3	O14931	201 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ITSN1-222	ENST00000462212	COL5A1-AS1	Q5SY13	56 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ITSN1-222	ENST00000462212	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ITSN1-222	ENST00000462212	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ITSN1-222	ENST00000462212	LRP2	P98164	4655 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ITSN1-222	ENST00000462212	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ITSN1-222	ENST00000462212	C20orf202	A1L168	122 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ITSN1-222	ENST00000462212	NDUFC2	O95298	119 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ITSN1-222	ENST00000462212	CRYGA	P11844	174 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ITSN1-222	ENST00000462212	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ITSN1-222	ENST00000462212	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ITSN1-222	ENST00000462212	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ITSN1-222	ENST00000462212	LITAF	Q99732	161 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ITSN1-222	ENST00000462212		A6NJY4	79 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ITSN1-222	ENST00000462212	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ITSN1-222	ENST00000462212	KRTDAP	P60985	99 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ITSN1-222	ENST00000462212	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ITSN1-222	ENST00000462212	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ITSN1-222	ENST00000462212	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ITSN1-222	ENST00000462212	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ITSN1-222	ENST00000462212	TIMM17B	O60830	172 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ITSN1-222	ENST00000462212	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ITSN1-222	ENST00000462212	ZNF815P	A8K554	130 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ITSN1-222	ENST00000462212	IGLV6-57	P01721	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ITSN1-222	ENST00000462212	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ITSN1-222	ENST00000462212	HIGD2A	Q9BW72	106 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ITSN1-222	ENST00000462212	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ITSN1-222	ENST00000462212	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITSN1-222	ENST00000462212	SPRR4	Q96PI1	79 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITSN1-222	ENST00000462212	ETDC	A0A1B0GVM5	59 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITSN1-222	ENST00000462212		B5MCH6	92 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITSN1-222	ENST00000462212	NPC2	P61916	151 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITSN1-222	ENST00000462212	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITSN1-222	ENST00000462212	SPANXC	Q9NY87	97 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITSN1-222	ENST00000462212	UBE2V1	Q13404	147 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ITSN1-222	ENST00000462212	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ITSN1-222	ENST00000462212		Q6ZRX8	168 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ITSN1-222	ENST00000462212	ATOH7	Q8N100	152 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ITSN1-222	ENST00000462212	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ITSN1-222	ENST00000462212	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ITSN1-222	ENST00000462212		K7ERU9	68 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ITSN1-222	ENST00000462212	SCGB1D1	O95968	90 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ITSN1-222	ENST00000462212	LINC00483	Q53H64	154 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ITSN1-222	ENST00000462212	VPS25	Q9BRG1	176 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ITSN1-222	ENST00000462212		Q9BRP9	147 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ITSN1-222	ENST00000462212	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ITSN1-222	ENST00000462212	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ITSN1-222	ENST00000462212	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ITSN1-222	ENST00000462212	ERC2-IT1	O76042	136 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ITSN1-222	ENST00000462212	PCP2	Q8IVA1	136 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ITSN1-222	ENST00000462212	C3orf22	Q8N5N4	141 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ITSN1-222	ENST00000462212	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ITSN1-222	ENST00000462212	LPA	P08519	4548 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ITSN1-222	ENST00000462212	TSPAN13	O95857	204 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ITSN1-222	ENST00000462212	SCGB1A1	P11684	91 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ITSN1-222	ENST00000462212	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ITSN1-222	ENST00000462212		Q6ZVH6	145 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ITSN1-222	ENST00000462212	VAMP8	Q9BV40	100 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ITSN1-222	ENST00000462212	KRTAP4-8	Q9BYQ9	185 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ITSN1-222	ENST00000462212	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ITSN1-222	ENST00000462212	IFITM1	P13164	125 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ITSN1-222	ENST00000462212	PRR4	Q16378	134 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ITSN1-222	ENST00000462212	COPS9	Q8WXC6	57 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ITSN1-222	ENST00000462212	RNF213	Q63HN8	5207 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ITSN1-222	ENST00000462212	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ITSN1-222	ENST00000462212	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ITSN1-222	ENST00000462212	OR13C6P	Q8NH95	151 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ITSN1-222	ENST00000462212		A0A1B0GV72	72 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ITSN1-222	ENST00000462212	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ITSN1-222	ENST00000462212	BATF	Q16520	125 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ITSN1-222	ENST00000462212	OCIAD2	Q56VL3	154 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ITSN1-222	ENST00000462212	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ITSN1-222	ENST00000462212	MTURN	Q8N3F0	131 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ITSN1-222	ENST00000462212	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ITSN1-222	ENST00000462212		Q8NBF4	154 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ITSN1-222	ENST00000462212	DHRS4-AS1	Q9P1J3	65 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ITSN1-222	ENST00000462212	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ITSN1-222	ENST00000462212	SPRR1B	P22528	89 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ITSN1-222	ENST00000462212	C6orf99	Q4VX62	202 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ITSN1-222	ENST00000462212	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ITSN1-222	ENST00000462212	ST20-AS1	Q8NBB2	130 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ITSN1-222	ENST00000462212	RETNLB	Q9BQ08	111 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ITSN1-222	ENST00000462212	SPINK1	P00995	79 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ITSN1-222	ENST00000462212	COX7B	P24311	80 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ITSN1-222	ENST00000462212	MOBP	Q13875	183 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ITSN1-222	ENST00000462212	VAMP3	Q15836	100 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ITSN1-222	ENST00000462212	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ITSN1-222	ENST00000462212	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ITSN1-222	ENST00000462212		A0A1B0GWB2	263 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ITSN1-222	ENST00000462212		A6NDN8	102 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ITSN1-222	ENST00000462212	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ITSN1-222	ENST00000462212	RPS29	P62273	56 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ITSN1-222	ENST00000462212	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ITSN1-222	ENST00000462212	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ITSN1-222	ENST00000462212	COX8A	P10176	69 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ITSN1-222	ENST00000462212	TPRXL	Q17RH7	258 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ITSN1-222	ENST00000462212	SPATA45	Q537H7	98 aa		4.75	□□□□□ -1.65

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