RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462130.1

HDLBP-230, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 4

Gene HDLBP, Length 464 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-230ENST00000462130 HSBP1L1C9JCN9 74 aa6.05□□□□□ -1.44
HDLBP-230ENST00000462130 M0R378 163 aa6.05□□□□□ -1.44
HDLBP-230ENST00000462130 IGKV2D-28P01615 120 aa6.05□□□□□ -1.44
HDLBP-230ENST00000462130 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
HDLBP-230ENST00000462130 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.05□□□□□ -1.44
HDLBP-230ENST00000462130 LITAFQ99732 161 aa6.05□□□□□ -1.44
HDLBP-230ENST00000462130 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.04□□□□□ -1.44
HDLBP-230ENST00000462130 NCR3O14931 201 aa6.04□□□□□ -1.44
HDLBP-230ENST00000462130 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.04□□□□□ -1.44
HDLBP-230ENST00000462130 SCGB1D4Q6XE38 83 aa6.04□□□□□ -1.44
HDLBP-230ENST00000462130 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.04□□□□□ -1.44
HDLBP-230ENST00000462130 TMEM238C9JI98 176 aa6.03□□□□□ -1.44
HDLBP-230ENST00000462130 TIMM17BO60830 172 aa6.03□□□□□ -1.44
HDLBP-230ENST00000462130 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.03□□□□□ -1.44
HDLBP-230ENST00000462130 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
HDLBP-230ENST00000462130 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.02□□□□□ -1.45
HDLBP-230ENST00000462130 ZNF861PO60384 105 aa6.01□□□□□ -1.45
HDLBP-230ENST00000462130 BCE1O60756 84 aa6.01□□□□□ -1.45
HDLBP-230ENST00000462130 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.01□□□□□ -1.45
HDLBP-230ENST00000462130 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6□□□□□ -1.45
HDLBP-230ENST00000462130 A0A0U1RQV1 116 aa6□□□□□ -1.45
HDLBP-230ENST00000462130 C14orf144Q96I85 54 aa6□□□□□ -1.45
HDLBP-230ENST00000462130 TMEM126AQ9H061 195 aa6□□□□□ -1.45
HDLBP-230ENST00000462130 NDUFC2O95298 119 aa5.99□□□□□ -1.45
HDLBP-230ENST00000462130 TSPAN13O95857 204 aa5.99□□□□□ -1.45
HDLBP-230ENST00000462130 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa5.99□□□□□ -1.45
HDLBP-230ENST00000462130 PAM16Q9Y3D7 125 aa5.99□□□□□ -1.45
HDLBP-230ENST00000462130 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa5.98□□□□□ -1.45
HDLBP-230ENST00000462130 DDTP30046 118 aa5.98□□□□□ -1.45
HDLBP-230ENST00000462130 UBE2AP49459 152 aa5.98□□□□□ -1.45
HDLBP-230ENST00000462130 SPATA45Q537H7 98 aa5.98□□□□□ -1.45
HDLBP-230ENST00000462130 PYY3Q5JQD4 70 aa5.98□□□□□ -1.45
HDLBP-230ENST00000462130 S100A7L2Q5SY68 101 aa5.98□□□□□ -1.45
HDLBP-230ENST00000462130 OR13C6PQ8NH95 151 aa5.98□□□□□ -1.45
HDLBP-230ENST00000462130 SPANXDQ9BXN6 97 aa5.98□□□□□ -1.45
HDLBP-230ENST00000462130 SPANXCQ9NY87 97 aa5.98□□□□□ -1.45
HDLBP-230ENST00000462130 COX8AP10176 69 aa5.97□□□□□ -1.45
HDLBP-230ENST00000462130 RPL28P46779 137 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
HDLBP-230ENST00000462130 PRLHP81277 87 aa5.97□□□□□ -1.45
HDLBP-230ENST00000462130 VAMP8Q9BV40 100 aa5.97□□□□□ -1.45
HDLBP-230ENST00000462130 KCNQ1DNQ9H478 68 aa5.97□□□□□ -1.45
HDLBP-230ENST00000462130 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
HDLBP-230ENST00000462130 IFITM1P13164 125 aa5.96□□□□□ -1.46
HDLBP-230ENST00000462130 MUC2Q02817 5179 aa5.96□□□□□ -1.46
HDLBP-230ENST00000462130 PRYO14603 147 aa5.95□□□□□ -1.46
HDLBP-230ENST00000462130 IGLV6-57P01721 117 aa5.95□□□□□ -1.46
HDLBP-230ENST00000462130 CRYGAP11844 174 aa5.95□□□□□ -1.46
HDLBP-230ENST00000462130 Q6ZVH6 145 aa5.95□□□□□ -1.46
HDLBP-230ENST00000462130 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa5.95□□□□□ -1.46
HDLBP-230ENST00000462130 LINC00518Q8N0U6 118 aa5.95□□□□□ -1.46
HDLBP-230ENST00000462130 TYMSOSQ8TAI1 123 aa5.95□□□□□ -1.46
HDLBP-230ENST00000462130 A0A087X002 238 aa5.94□□□□□ -1.46
HDLBP-230ENST00000462130 DLEU1O43261 78 aa5.94□□□□□ -1.46
HDLBP-230ENST00000462130 S100A12P80511 92 aa5.94□□□□□ -1.46
HDLBP-230ENST00000462130 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.94□□□□□ -1.46
HDLBP-230ENST00000462130 ANAPC11Q9NYG5 84 aa5.94□□□□□ -1.46
HDLBP-230ENST00000462130 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa5.93□□□□□ -1.46
HDLBP-230ENST00000462130 A6NDN8 102 aa5.93□□□□□ -1.46
HDLBP-230ENST00000462130 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
HDLBP-230ENST00000462130 SPRR1AP35321 89 aa5.93□□□□□ -1.46
HDLBP-230ENST00000462130 SLC25A34Q6PIV7 304 aa5.93□□□□□ -1.46
HDLBP-230ENST00000462130 LINC00337Q8N6G1 96 aa5.93□□□□□ -1.46
HDLBP-230ENST00000462130 SMCR5Q8TEV8 140 aa5.93□□□□□ -1.46
HDLBP-230ENST00000462130 COPS9Q8WXC6 57 aa5.93□□□□□ -1.46
HDLBP-230ENST00000462130 HIGD2AQ9BW72 106 aa5.93□□□□□ -1.46
HDLBP-230ENST00000462130 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa5.92□□□□□ -1.46
HDLBP-230ENST00000462130 B5MCH6 92 aa5.92□□□□□ -1.46
HDLBP-230ENST00000462130 HIST1H4GQ99525 98 aa5.92□□□□□ -1.46
HDLBP-230ENST00000462130 A4D1N5 150 aa5.91□□□□□ -1.46
HDLBP-230ENST00000462130 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
HDLBP-230ENST00000462130 PPDPFQ9H3Y8 114 aa5.9□□□□□ -1.46
HDLBP-230ENST00000462130 ERC2-IT1O76042 136 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-230ENST00000462130 C2orf91Q6ZV80 131 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-230ENST00000462130 HIGD1BQ9P298 99 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-230ENST00000462130 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
HDLBP-230ENST00000462130 LINC00304Q8N9R0 145 aa5.88□□□□□ -1.47
HDLBP-230ENST00000462130 C12orf57Q99622 126 aa5.88□□□□□ -1.47
HDLBP-230ENST00000462130 RETNLBQ9BQ08 111 aa5.88□□□□□ -1.47
HDLBP-230ENST00000462130 Q9BRP9 147 aa5.88□□□□□ -1.47
HDLBP-230ENST00000462130 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa5.87□□□□□ -1.47
HDLBP-230ENST00000462130 C6orf99Q4VX62 202 aa5.87□□□□□ -1.47
HDLBP-230ENST00000462130 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa5.87□□□□□ -1.47
HDLBP-230ENST00000462130 CDIP1Q9H305 208 aa5.87□□□□□ -1.47
HDLBP-230ENST00000462130 CBY1Q9Y3M2 126 aa5.87□□□□□ -1.47
HDLBP-230ENST00000462130 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa5.86□□□□□ -1.47
HDLBP-230ENST00000462130 COX7BP24311 80 aa5.86□□□□□ -1.47
HDLBP-230ENST00000462130 FAM229BQ4G0N7 80 aa5.86□□□□□ -1.47
HDLBP-230ENST00000462130 Q6ZRX8 168 aa5.86□□□□□ -1.47
HDLBP-230ENST00000462130 SMIM11BQ8TCY0 68 aa5.86□□□□□ -1.47
HDLBP-230ENST00000462130 SPRR4Q96PI1 79 aa5.86□□□□□ -1.47
HDLBP-230ENST00000462130 PRO1933Q9H354 126 aa5.86□□□□□ -1.47
HDLBP-230ENST00000462130 CFC1BP0CG36 223 aa5.85□□□□□ -1.47
HDLBP-230ENST00000462130 CFC1P0CG37 223 aa5.85□□□□□ -1.47
HDLBP-230ENST00000462130 GAGE2AQ6NT46 116 aa5.85□□□□□ -1.47
HDLBP-230ENST00000462130 TAL2Q16559 108 aa5.84□□□□□ -1.47
HDLBP-230ENST00000462130 CEND1Q8N111 149 aa5.84□□□□□ -1.47
HDLBP-230ENST00000462130 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa5.84□□□□□ -1.47
HDLBP-230ENST00000462130 UQCR10Q9UDW1 63 aa5.84□□□□□ -1.47
HDLBP-230ENST00000462130 FAT4Q6V0I7 4981 aa5.83□□□□□ -1.48
HDLBP-230ENST00000462130 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa5.83□□□□□ -1.48
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