RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423048.5

ALMS1-201, Transcript of ALMS1, centrosome and basal body associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ALMS1, Length 5,194 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALMS1-201ENST00000423048 KRTAP1-1Q07627 177 aa4.61□□□□□ -1.67
ALMS1-201ENST00000423048 A0A087WTM6 91 aa4.61□□□□□ -1.67
ALMS1-201ENST00000423048 IGLV7-43P04211 117 aa4.61□□□□□ -1.67
ALMS1-201ENST00000423048 PCOTHQ58A44 107 aa4.6□□□□□ -1.67
ALMS1-201ENST00000423048 K7EQZ3 153 aa4.6□□□□□ -1.67
ALMS1-201ENST00000423048 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa4.6□□□□□ -1.67
ALMS1-201ENST00000423048 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
ALMS1-201ENST00000423048 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
ALMS1-201ENST00000423048 TNP2Q05952 138 aa4.59□□□□□ -1.67
ALMS1-201ENST00000423048 POLQO75417 2590 aa4.59□□□□□ -1.68
ALMS1-201ENST00000423048 Q75L30 129 aa4.59□□□□□ -1.68
ALMS1-201ENST00000423048 HECTD1Q9ULT8 2610 aa4.58□□□□□ -1.68
ALMS1-201ENST00000423048 RPS29P62273 56 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
ALMS1-201ENST00000423048 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa4.58□□□□□ -1.68
ALMS1-201ENST00000423048 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.58□□□□□ -1.68
ALMS1-201ENST00000423048 A0A1W2PNM2 257 aa4.58□□□□□ -1.68
ALMS1-201ENST00000423048 LCA10Q71F78 164 aa4.58□□□□□ -1.68
ALMS1-201ENST00000423048 MUC4Q99102 2169 aa4.58□□□□□ -1.68
ALMS1-201ENST00000423048 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
ALMS1-201ENST00000423048 LINC00304Q8N9R0 145 aa4.58□□□□□ -1.68
ALMS1-201ENST00000423048 K7EIL1 84 aa4.57□□□□□ -1.68
ALMS1-201ENST00000423048 PLAC8Q9NZF1 115 aa4.57□□□□□ -1.68
ALMS1-201ENST00000423048 MAST4O15021 2626 aa4.57□□□□□ -1.68
ALMS1-201ENST00000423048 LRCOL1A6NCL2 159 aa4.57□□□□□ -1.68
ALMS1-201ENST00000423048 PSPHP1O15172 72 aa4.57□□□□□ -1.68
ALMS1-201ENST00000423048 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa4.57□□□□□ -1.68
ALMS1-201ENST00000423048 SMR3AQ99954 134 aa4.57□□□□□ -1.68
ALMS1-201ENST00000423048 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa4.56□□□□□ -1.68
ALMS1-201ENST00000423048 Q9UF83 564 aa4.55□□□□□ -1.68
ALMS1-201ENST00000423048 MED13LQ71F56 2210 aa4.55□□□□□ -1.68
ALMS1-201ENST00000423048 SONP18583 2426 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
ALMS1-201ENST00000423048 PRR4Q16378 134 aa4.55□□□□□ -1.68
ALMS1-201ENST00000423048 LINC00483Q53H64 154 aa4.54□□□□□ -1.68
ALMS1-201ENST00000423048 MIR22HGQ0VDD5 57 aa4.54□□□□□ -1.68
ALMS1-201ENST00000423048 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa4.53□□□□□ -1.68
ALMS1-201ENST00000423048 IGKV2-30P06310 120 aa4.53□□□□□ -1.68
ALMS1-201ENST00000423048 KRTAP10-11P60412 298 aa4.53□□□□□ -1.68
ALMS1-201ENST00000423048 C4orf26Q17RF5 130 aa4.53□□□□□ -1.68
ALMS1-201ENST00000423048 SPACA4Q8TDM5 124 aa4.53□□□□□ -1.68
ALMS1-201ENST00000423048 KRTAP10-3P60369 221 aa4.51□□□□□ -1.69
ALMS1-201ENST00000423048 Q5XG85 94 aa4.51□□□□□ -1.69
ALMS1-201ENST00000423048 CEP295Q9C0D2 2601 aa4.51□□□□□ -1.69
ALMS1-201ENST00000423048 SORL1Q92673 2214 aa4.5□□□□□ -1.69
ALMS1-201ENST00000423048 DSCR10P59022 87 aa4.5□□□□□ -1.69
ALMS1-201ENST00000423048 JMJD1CQ15652 2540 aa4.5□□□□□ -1.69
ALMS1-201ENST00000423048 EP400Q96L91 3159 aa4.5□□□□□ -1.69
ALMS1-201ENST00000423048 Q96NJ1 140 aa4.49□□□□□ -1.69
ALMS1-201ENST00000423048 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
ALMS1-201ENST00000423048 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
ALMS1-201ENST00000423048 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa4.48□□□□□ -1.69
ALMS1-201ENST00000423048 LCE6AA0A183 80 aa4.48□□□□□ -1.69
ALMS1-201ENST00000423048 LINC00472Q9H8W2 130 aa4.48□□□□□ -1.69
ALMS1-201ENST00000423048 Q6ZR54 194 aa4.47□□□□□ -1.69
ALMS1-201ENST00000423048 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa4.47□□□□□ -1.69
ALMS1-201ENST00000423048 DEFB116Q30KQ4 102 aa4.46□□□□□ -1.7
ALMS1-201ENST00000423048 A0A1W2PNN7 141 aa4.45□□□□□ -1.7
ALMS1-201ENST00000423048 FAM168BA1KXE4 195 aa4.45□□□□□ -1.7
ALMS1-201ENST00000423048 DMAC1Q96GE9 116 aa4.45□□□□□ -1.7
ALMS1-201ENST00000423048 CRIPTQ9P021 101 aa4.45□□□□□ -1.7
ALMS1-201ENST00000423048 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
ALMS1-201ENST00000423048 USP24Q9UPU5 2620 aa4.43□□□□□ -1.7
ALMS1-201ENST00000423048 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
ALMS1-201ENST00000423048 WNK1Q9H4A3 2382 aa4.43□□□□□ -1.7
ALMS1-201ENST00000423048 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
ALMS1-201ENST00000423048 CHTF8P0CG12 524 aa4.41□□□□□ -1.7
ALMS1-201ENST00000423048 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP4.41□□□□□ -1.7
ALMS1-201ENST00000423048 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa4.4□□□□□ -1.71
ALMS1-201ENST00000423048 CEP350Q5VT06 3117 aa4.4□□□□□ -1.71
ALMS1-201ENST00000423048 HRES1P13985 223 aa4.4□□□□□ -1.71
ALMS1-201ENST00000423048 ITPR3Q14573 2671 aa4.39□□□□□ -1.71
ALMS1-201ENST00000423048 COX6B2Q6YFQ2 88 aa4.39□□□□□ -1.71
ALMS1-201ENST00000423048 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
ALMS1-201ENST00000423048 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
ALMS1-201ENST00000423048 CHD6Q8TD26 2715 aa4.38□□□□□ -1.71
ALMS1-201ENST00000423048 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
ALMS1-201ENST00000423048 A0A1B0GU33 70 aa4.34□□□□□ -1.71
ALMS1-201ENST00000423048 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa4.33□□□□□ -1.72
ALMS1-201ENST00000423048 NOTCH3Q9UM47 2321 aa4.32□□□□□ -1.72
ALMS1-201ENST00000423048 CR1P17927 2039 aa4.32□□□□□ -1.72
ALMS1-201ENST00000423048 OXTP01178 125 aa4.32□□□□□ -1.72
ALMS1-201ENST00000423048 Q5W150 140 aa4.31□□□□□ -1.72
ALMS1-201ENST00000423048 ATRQ13535 2644 aa4.31□□□□□ -1.72
ALMS1-201ENST00000423048 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
ALMS1-201ENST00000423048 Q5VV11 94 aa4.3□□□□□ -1.72
ALMS1-201ENST00000423048 CSAG1Q6PB30 78 aa4.3□□□□□ -1.72
ALMS1-201ENST00000423048 PRR26Q8N8Z3 221 aa4.3□□□□□ -1.72
ALMS1-201ENST00000423048 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
ALMS1-201ENST00000423048 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa4.29□□□□□ -1.72
ALMS1-201ENST00000423048 TRANK1O15050 2925 aa4.29□□□□□ -1.72
ALMS1-201ENST00000423048 TLN2Q9Y4G6 2542 aa4.29□□□□□ -1.72
ALMS1-201ENST00000423048 CASC10Q5T4H9 136 aa4.29□□□□□ -1.72
ALMS1-201ENST00000423048 SPINT4Q6UDR6 99 aa4.28□□□□□ -1.72
ALMS1-201ENST00000423048 SPATA8Q6RVD6 105 aa4.28□□□□□ -1.72
ALMS1-201ENST00000423048 J3QL48 77 aa4.27□□□□□ -1.73
ALMS1-201ENST00000423048 NOTCH1P46531 2555 aa4.27□□□□□ -1.73
ALMS1-201ENST00000423048 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
ALMS1-201ENST00000423048 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa4.26□□□□□ -1.73
ALMS1-201ENST00000423048 Q8NDZ9 215 aa4.26□□□□□ -1.73
ALMS1-201ENST00000423048 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
ALMS1-201ENST00000423048 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa4.26□□□□□ -1.73
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