RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411257.1

RNU6-177P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 177, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-177P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-177P-201ENST00000411257 STAB2Q8WWQ8 2551 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 UBR3Q6ZT12 1888 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 ABCC2Q92887 1545 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 LRRC7Q96NW7 1537 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 CHD1O14646 1710 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 S100PP25815 95 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 RBP2P50120 134 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 PRLHP81277 87 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 COX6B2Q6YFQ2 88 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 DEFB106AQ8N104 65 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 C14orf144Q96I85 54 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 TCEAL7Q9BRU2 100 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 NEBP20929 6669 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 RGPD2P0DJD1 1756 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 ALKQ9UM73 1620 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 ABCA3Q99758 1704 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 KIF20BQ96Q89 1820 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 H0YAA0 97 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 K7EP34 96 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 M0R143 59 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 IFI6P09912 130 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 DEFB130BP0DP73 79 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 DEFB130AP0DP74 79 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 DEFB1P60022 68 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 C20orf78Q9BR46 151 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 SHPRHQ149N8 1683 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 SCN11AQ9UI33 1791 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 DNAH2Q9P225 4427 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 AKAP13Q12802 2813 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 HIVEP1P15822 2718 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 C4AP0C0L4 1744 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 C4BP0C0L5 1744 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 CNTLNQ9NXG0 1405 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 TACC2O95359 2948 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 PREX1Q8TCU6 1659 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 CCNB3Q8WWL7 1395 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 PLIN4Q96Q06 1357 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 CEBPZOSA8MTT3 80 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 IAPPP10997 89 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 MAP3K1Q13233 1512 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 DMXL1Q9Y485 3027 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 FYCO1Q9BQS8 1478 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 UMAD1C9J7I0 102 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 GYPAP02724 150 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 MT1HP80294 61 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 ACBD7Q8N6N7 88 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 Q9H521 79 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 DNAH11Q96DT5 4516 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 DNAH1Q9P2D7 4330 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 ATP10BO94823 1461 aa-0.41□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 ATP7BP35670 1465 aa-0.41□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 NCOA2Q15596 1464 aa-0.41□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 TEX14Q8IWB6 1497 aa-0.41□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 LAMA1P25391 3075 aa-0.41□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 RGPD1P0DJD0 1748 aa-0.41□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 PKD1L3Q7Z443 1732 aa-0.41□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 NBASA2RRP1 2371 aa-0.41□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 USP32Q8NFA0 1604 aa-0.41□□□□□ -2.47
RNU6-177P-201ENST00000411257 NDUFA4O00483 81 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-177P-201ENST00000411257 NDUFB1O75438 58 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-177P-201ENST00000411257 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-177P-201ENST00000411257 SNHG12Q9BXW3 62 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-177P-201ENST00000411257 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-177P-201ENST00000411257 KNL1Q8NG31 2342 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-177P-201ENST00000411257 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-177P-201ENST00000411257 FASNP49327 2511 aaKnown RBP-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-177P-201ENST00000411257 SPG11Q96JI7 2443 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-177P-201ENST00000411257 HTTP42858 3142 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-177P-201ENST00000411257 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-177P-201ENST00000411257 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-177P-201ENST00000411257 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-177P-201ENST00000411257 RGPD5Q99666 1765 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-177P-201ENST00000411257 A0A087WXM4 84 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-177P-201ENST00000411257 PKIAP61925 76 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-177P-201ENST00000411257 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-177P-201ENST00000411257 EPG5Q9HCE0 2579 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-177P-201ENST00000411257 QSER1Q2KHR3 1735 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-177P-201ENST00000411257 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-177P-201ENST00000411257 HECTD1Q9ULT8 2610 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-177P-201ENST00000411257 TRIOO75962 3097 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-177P-201ENST00000411257 ABCC10Q5T3U5 1492 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-177P-201ENST00000411257 HYDINQ4G0P3 5121 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-177P-201ENST00000411257 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-177P-201ENST00000411257 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-177P-201ENST00000411257 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP-0.43□□□□□ -2.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.2 ms