RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364877.1

RNU6-534P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 534, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-534P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-534P-201ENST00000364877 ADAMTS12P58397 1594 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-534P-201ENST00000364877 PKD1L3Q7Z443 1732 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-534P-201ENST00000364877 PCLOQ9Y6V0 5065 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-534P-201ENST00000364877 RGPD1P0DJD0 1748 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-534P-201ENST00000364877 LINC00158P58513 81 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-534P-201ENST00000364877 COX6B2Q6YFQ2 88 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-534P-201ENST00000364877 KNL1Q8NG31 2342 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-534P-201ENST00000364877 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-534P-201ENST00000364877 PRO3102Q9H379 93 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-534P-201ENST00000364877 PTPN23Q9H3S7 1636 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-534P-201ENST00000364877 SPTBN4Q9H254 2564 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-534P-201ENST00000364877 STARD9Q9P2P6 4700 aa-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-534P-201ENST00000364877 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-534P-201ENST00000364877 CEBPZOSA8MTT3 80 aa-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-534P-201ENST00000364877 ACYP1P07311 99 aa-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-534P-201ENST00000364877 MT4P47944 62 aa-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-534P-201ENST00000364877 PYY3Q5JQD4 70 aa-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-534P-201ENST00000364877 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-534P-201ENST00000364877 FAT1Q14517 4588 aa-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-534P-201ENST00000364877 SONP18583 2426 aaKnown RBP-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-534P-201ENST00000364877 PEG3Q9GZU2 1588 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-534P-201ENST00000364877 REV3LO60673 3130 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-534P-201ENST00000364877 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-534P-201ENST00000364877 FANCAO15360 1455 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-534P-201ENST00000364877 ATP7BP35670 1465 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-534P-201ENST00000364877 C3orf79P0CE67 100 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-534P-201ENST00000364877 QSER1Q2KHR3 1735 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-534P-201ENST00000364877 NF1P21359 2839 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-534P-201ENST00000364877 C4AP0C0L4 1744 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-534P-201ENST00000364877 C4BP0C0L5 1744 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-534P-201ENST00000364877 K7EP34 96 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-534P-201ENST00000364877 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-534P-201ENST00000364877 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-534P-201ENST00000364877 SPRR2FQ96RM1 72 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-534P-201ENST00000364877 PREX1Q8TCU6 1659 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-534P-201ENST00000364877 TGP01266 2768 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-534P-201ENST00000364877 FAT3Q8TDW7 4589 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-534P-201ENST00000364877 STAB2Q8WWQ8 2551 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-534P-201ENST00000364877 MXRA5Q9NR99 2828 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-534P-201ENST00000364877 NBASA2RRP1 2371 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-534P-201ENST00000364877 MT1AP04731 61 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-534P-201ENST00000364877 LINC00643Q86TS7 51 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-534P-201ENST00000364877 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-534P-201ENST00000364877 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-534P-201ENST00000364877 AKAP12Q02952 1782 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-534P-201ENST00000364877 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-534P-201ENST00000364877 RGPD5Q99666 1765 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-534P-201ENST00000364877 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-534P-201ENST00000364877 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-534P-201ENST00000364877 VPS8Q8N3P4 1428 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-534P-201ENST00000364877 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-534P-201ENST00000364877 PLIN4Q96Q06 1357 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-534P-201ENST00000364877 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-534P-201ENST00000364877 AKAP9Q99996 3911 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-534P-201ENST00000364877 AKAP13Q12802 2813 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-534P-201ENST00000364877 V9GYS6 101 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-534P-201ENST00000364877 SCN11AQ9UI33 1791 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-534P-201ENST00000364877 UBR1Q8IWV7 1749 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-534P-201ENST00000364877 DNAH6Q9C0G6 4158 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-534P-201ENST00000364877 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-534P-201ENST00000364877 CCNB3Q8WWL7 1395 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-534P-201ENST00000364877 PKD1P98161 4303 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-534P-201ENST00000364877 C9orf92A6NGG3 77 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-534P-201ENST00000364877 NDUFB1O75438 58 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-534P-201ENST00000364877 IFI6P09912 130 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-534P-201ENST00000364877 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-534P-201ENST00000364877 NCOA2Q15596 1464 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-534P-201ENST00000364877 ALKQ9UM73 1620 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-534P-201ENST00000364877 CREBBPQ92793 2442 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-534P-201ENST00000364877 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-534P-201ENST00000364877 DNAH9Q9NYC9 4486 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-534P-201ENST00000364877 UMAD1C9J7I0 102 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-534P-201ENST00000364877 TDRG1Q3Y452 100 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-534P-201ENST00000364877 RABAC1Q9UI14 185 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-534P-201ENST00000364877 USP32Q8NFA0 1604 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-534P-201ENST00000364877 UBR4Q5T4S7 5183 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-534P-201ENST00000364877 CEP162Q5TB80 1403 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-534P-201ENST00000364877 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-534P-201ENST00000364877 DOT1LQ8TEK3 1739 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-534P-201ENST00000364877 ZNF831Q5JPB2 1677 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-534P-201ENST00000364877 MYO3AQ8NEV4 1616 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-534P-201ENST00000364877 TRANK1O15050 2925 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-534P-201ENST00000364877 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-534P-201ENST00000364877 H0YAA0 97 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-534P-201ENST00000364877 DEFB130BP0DP73 79 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-534P-201ENST00000364877 DEFB130AP0DP74 79 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-534P-201ENST00000364877 S4R3F8 94 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-534P-201ENST00000364877 USH2AO75445 5202 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-534P-201ENST00000364877 LTN1O94822 1766 aa-0.6□□□□□ -2.5
RNU6-534P-201ENST00000364877 DMXL1Q9Y485 3027 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-534P-201ENST00000364877 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-534P-201ENST00000364877 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-534P-201ENST00000364877 NDUFA4O00483 81 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-534P-201ENST00000364877 PRLHP81277 87 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-534P-201ENST00000364877 VPS13DQ5THJ4 4388 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-534P-201ENST00000364877 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-534P-201ENST00000364877 NWD1Q149M9 1564 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-534P-201ENST00000364877 HTTP42858 3142 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-534P-201ENST00000364877 HIVEP1P15822 2718 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-534P-201ENST00000364877 SPG11Q96JI7 2443 aa-0.61□□□□□ -2.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.5 ms