RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619939.4

LHX1-204, Transcript of LIM homeobox 1, humanhuman

TSL 2

Gene LHX1, Length 1,840 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1-204ENST00000619939 C3orf22Q8N5N4 141 aa10.09□□□□□ -0.79
LHX1-204ENST00000619939 ANKRD29Q8N6D5 301 aa10.09□□□□□ -0.79
LHX1-204ENST00000619939 C9orf153Q5TBE3 101 aa10.08□□□□□ -0.8
LHX1-204ENST00000619939 Q8IZM0 81 aa10.08□□□□□ -0.8
LHX1-204ENST00000619939 LINC00526Q96FQ7 95 aa10.08□□□□□ -0.8
LHX1-204ENST00000619939 NDUFA1O15239 70 aa10.07□□□□□ -0.8
LHX1-204ENST00000619939 KMT2AQ03164 3969 aa10.07□□□□□ -0.8
LHX1-204ENST00000619939 SPAG11BQ08648 103 aa10.06□□□□□ -0.8
LHX1-204ENST00000619939 M0R2N4 97 aa10.05□□□□□ -0.8
LHX1-204ENST00000619939 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
LHX1-204ENST00000619939 A0A0J9YXY3 114 aa10.05□□□□□ -0.8
LHX1-204ENST00000619939 PSCAO43653 123 aa10.05□□□□□ -0.8
LHX1-204ENST00000619939 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa10.04□□□□□ -0.8
LHX1-204ENST00000619939 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa10.04□□□□□ -0.8
LHX1-204ENST00000619939 KIAA0087Q14695 138 aa10.04□□□□□ -0.8
LHX1-204ENST00000619939 SFTA2Q6UW10 78 aa10.04□□□□□ -0.8
LHX1-204ENST00000619939 ARL17AQ8IVW1 177 aa10.04□□□□□ -0.8
LHX1-204ENST00000619939 DNAH10Q8IVF4 4471 aa10.04□□□□□ -0.8
LHX1-204ENST00000619939 SLC25A20O43772 301 aa10.03□□□□□ -0.8
LHX1-204ENST00000619939 CXCL5P42830 114 aa10.03□□□□□ -0.8
LHX1-204ENST00000619939 HIGD2BQ4VC39 106 aa10.03□□□□□ -0.8
LHX1-204ENST00000619939 VPS13DQ5THJ4 4388 aa10.03□□□□□ -0.8
LHX1-204ENST00000619939 ACYP1P07311 99 aa10.03□□□□□ -0.8
LHX1-204ENST00000619939 C2orf82Q6UX34 121 aa10.03□□□□□ -0.8
LHX1-204ENST00000619939 C15orf56Q8N910 161 aa10.03□□□□□ -0.8
LHX1-204ENST00000619939 FRAS1Q86XX4 4008 aa10.02□□□□□ -0.81
LHX1-204ENST00000619939 TMEM258P61165 79 aa10.01□□□□□ -0.81
LHX1-204ENST00000619939 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP10.01□□□□□ -0.81
LHX1-204ENST00000619939 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
LHX1-204ENST00000619939 DNAH6Q9C0G6 4158 aa10.01□□□□□ -0.81
LHX1-204ENST00000619939 USP17L23D6RBM5 183 aa10□□□□□ -0.81
LHX1-204ENST00000619939 CRYGAP11844 174 aa10□□□□□ -0.81
LHX1-204ENST00000619939 C6orf223Q8N319 242 aa10□□□□□ -0.81
LHX1-204ENST00000619939 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa10□□□□□ -0.81
LHX1-204ENST00000619939 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
LHX1-204ENST00000619939 A0A0U1RRA0 63 aa9.99□□□□□ -0.81
LHX1-204ENST00000619939 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
LHX1-204ENST00000619939 PRO0628Q9UI54 55 aa9.99□□□□□ -0.81
LHX1-204ENST00000619939 LECT2O14960 151 aa9.98□□□□□ -0.81
LHX1-204ENST00000619939 TCL1BO95988 128 aa9.98□□□□□ -0.81
LHX1-204ENST00000619939 GAGE2AQ6NT46 116 aa9.98□□□□□ -0.81
LHX1-204ENST00000619939 CAMK2N2Q96S95 79 aa9.98□□□□□ -0.81
LHX1-204ENST00000619939 TIMM17BO60830 172 aa9.98□□□□□ -0.81
LHX1-204ENST00000619939 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa9.98□□□□□ -0.81
LHX1-204ENST00000619939 Q6ZR54 194 aa9.98□□□□□ -0.81
LHX1-204ENST00000619939 A0A1B0GVY2 172 aa9.96□□□□□ -0.81
LHX1-204ENST00000619939 PFN2P35080 140 aa9.96□□□□□ -0.81
LHX1-204ENST00000619939 LINC00158P58513 81 aa9.96□□□□□ -0.81
LHX1-204ENST00000619939 ATXN8Q156A1 80 aa9.96□□□□□ -0.81
LHX1-204ENST00000619939 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa9.96□□□□□ -0.81
LHX1-204ENST00000619939 C2orf48Q96LS8 159 aa9.96□□□□□ -0.81
LHX1-204ENST00000619939 LITAFQ99732 161 aa9.96□□□□□ -0.81
LHX1-204ENST00000619939 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa9.96□□□□□ -0.82
LHX1-204ENST00000619939 COX7CP15954 63 aa9.96□□□□□ -0.82
LHX1-204ENST00000619939 C10orf25Q5T742 122 aa9.96□□□□□ -0.82
LHX1-204ENST00000619939 HERC2O95714 4834 aa9.95□□□□□ -0.82
LHX1-204ENST00000619939 DAND5Q8N907 189 aa9.95□□□□□ -0.82
LHX1-204ENST00000619939 H3BT86 120 aa9.94□□□□□ -0.82
LHX1-204ENST00000619939 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
LHX1-204ENST00000619939 SYCNQ0VAF6 134 aa9.93□□□□□ -0.82
LHX1-204ENST00000619939 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
LHX1-204ENST00000619939 Q6ZRU5 148 aa9.93□□□□□ -0.82
LHX1-204ENST00000619939 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa9.93□□□□□ -0.82
LHX1-204ENST00000619939 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa9.93□□□□□ -0.82
LHX1-204ENST00000619939 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa9.93□□□□□ -0.82
LHX1-204ENST00000619939 RTL8CO15255 209 aa9.93□□□□□ -0.82
LHX1-204ENST00000619939 TRACP01848 142 aa9.93□□□□□ -0.82
LHX1-204ENST00000619939 NPC2P61916 151 aa9.93□□□□□ -0.82
LHX1-204ENST00000619939 C1orf134Q5TEV5 83 aa9.93□□□□□ -0.82
LHX1-204ENST00000619939 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa9.93□□□□□ -0.82
LHX1-204ENST00000619939 C6orf48Q9UBA6 75 aa9.93□□□□□ -0.82
LHX1-204ENST00000619939 ATOX1O00244 68 aa9.92□□□□□ -0.82
LHX1-204ENST00000619939 COX17Q14061 63 aa9.92□□□□□ -0.82
LHX1-204ENST00000619939 C14orf177Q52M58 125 aa9.92□□□□□ -0.82
LHX1-204ENST00000619939 MUSTN1Q8IVN3 82 aa9.92□□□□□ -0.82
LHX1-204ENST00000619939 PRO1854Q9UHT4 67 aa9.92□□□□□ -0.82
LHX1-204ENST00000619939 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa9.91□□□□□ -0.82
LHX1-204ENST00000619939 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa9.91□□□□□ -0.82
LHX1-204ENST00000619939 COPS9Q8WXC6 57 aa9.9□□□□□ -0.82
LHX1-204ENST00000619939 LRCOL1A6NCL2 159 aa9.89□□□□□ -0.83
LHX1-204ENST00000619939 LINC00308Q8TCZ7 52 aa9.89□□□□□ -0.83
LHX1-204ENST00000619939 SEC61GP60059 68 aa9.89□□□□□ -0.83
LHX1-204ENST00000619939 LINC01620Q4KN68 170 aa9.89□□□□□ -0.83
LHX1-204ENST00000619939 LINC00643Q86TS7 51 aa9.89□□□□□ -0.83
LHX1-204ENST00000619939 SLPIP03973 132 aa9.88□□□□□ -0.83
LHX1-204ENST00000619939 DPH3Q96FX2 82 aa9.88□□□□□ -0.83
LHX1-204ENST00000619939 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
LHX1-204ENST00000619939 A0A0B4J2C4 111 aa9.87□□□□□ -0.83
LHX1-204ENST00000619939 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa9.87□□□□□ -0.83
LHX1-204ENST00000619939 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
LHX1-204ENST00000619939 DNAH17Q9UFH2 4485 aa9.86□□□□□ -0.83
LHX1-204ENST00000619939 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
LHX1-204ENST00000619939 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa9.86□□□□□ -0.83
LHX1-204ENST00000619939 V9GYY9 64 aa9.85□□□□□ -0.83
LHX1-204ENST00000619939 A0A087WTM6 91 aa9.84□□□□□ -0.83
LHX1-204ENST00000619939 CNBPP62633 177 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
LHX1-204ENST00000619939 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa9.84□□□□□ -0.83
LHX1-204ENST00000619939 CFC1BP0CG36 223 aa9.83□□□□□ -0.84
LHX1-204ENST00000619939 CFC1P0CG37 223 aa9.83□□□□□ -0.84
LHX1-204ENST00000619939 Q8N814 137 aa9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms