RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGEF1-209ENST00000607882 TRACP01848 142 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGEF1-209ENST00000607882 GYPEP15421 78 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGEF1-209ENST00000607882 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGEF1-209ENST00000607882 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGEF1-209ENST00000607882 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-209ENST00000607882 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-209ENST00000607882 CCL18P55774 89 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-209ENST00000607882 MIAQ16674 131 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-209ENST00000607882 ICOSQ9Y6W8 199 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-209ENST00000607882 SS18Q15532 418 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-209ENST00000607882 SPANXDQ9BXN6 97 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-209ENST00000607882 SPANXCQ9NY87 97 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-209ENST00000607882 NDUFC2O95298 119 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-209ENST00000607882 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-209ENST00000607882 KIAA1109Q2LD37 5005 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-209ENST00000607882 PRO0255Q9UI72 69 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-209ENST00000607882 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM258P61165 79 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-209ENST00000607882 K7EQD1 137 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-209ENST00000607882 CLEC2BQ92478 149 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-209ENST00000607882 Q9H8V8 135 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-209ENST00000607882 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-209ENST00000607882 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-209ENST00000607882 DNAH6Q9C0G6 4158 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-209ENST00000607882 RTL8CO15255 209 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-209ENST00000607882 COX6A2Q02221 97 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-209ENST00000607882 C2orf82Q6UX34 121 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-209ENST00000607882 Q8N3U1 123 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-209ENST00000607882 COX6CP09669 75 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-209ENST00000607882 CRYGAP11844 174 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-209ENST00000607882 USP17L23D6RBM5 183 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-209ENST00000607882 WFDC10BQ8IUB3 73 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-209ENST00000607882 PKD1P98161 4303 aa8.52□□□□□ -1.04
RABGEF1-209ENST00000607882 H7C423 109 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-209ENST00000607882 UBE2WQ96B02 151 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-209ENST00000607882 LYPD5Q6UWN5 251 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-209ENST00000607882 NDUFA1O15239 70 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-209ENST00000607882 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-209ENST00000607882 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-209ENST00000607882 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-209ENST00000607882 COX7CP15954 63 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-209ENST00000607882 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-209ENST00000607882 LINC00242Q5T6M2 205 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-209ENST00000607882 Q6ZR54 194 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-209ENST00000607882 DNAH17Q9UFH2 4485 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A0A0MQY5 61 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-209ENST00000607882 LST1O00453 97 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-209ENST00000607882 TIMM17BO60830 172 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-209ENST00000607882 TNP2Q05952 138 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-209ENST00000607882 C1orf134Q5TEV5 83 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-209ENST00000607882 LINC00308Q8TCZ7 52 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-209ENST00000607882 C8orf87E5RJ46 101 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-209ENST00000607882 H3BT86 120 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-209ENST00000607882 LINC01600Q96MT4 127 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-209ENST00000607882 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-209ENST00000607882 SMIM1B2RUZ4 78 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-209ENST00000607882 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa8.47□□□□□ -1.05
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RABGEF1-209ENST00000607882 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-209ENST00000607882 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-209ENST00000607882 CD164L2Q6UWJ8 174 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-209ENST00000607882 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGEF1-209ENST00000607882 DNAH11Q96DT5 4516 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGEF1-209ENST00000607882 H3BNG1 76 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-209ENST00000607882 Q9HAA7 133 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-209ENST00000607882 C6orf223Q8N319 242 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-209ENST00000607882 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-209ENST00000607882 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-209ENST00000607882 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-209ENST00000607882 DNAH10OSP0CZ25 163 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-209ENST00000607882 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-209ENST00000607882 COX7A2LO14548 114 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-209ENST00000607882 UBE2L6O14933 153 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-209ENST00000607882 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-209ENST00000607882 Q6ZRU5 148 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-209ENST00000607882 UPK3BQ9BT76 320 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-209ENST00000607882 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM243Q9BU79 118 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-209ENST00000607882 LINC00474Q9P2X8 69 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-209ENST00000607882 LRP1BQ9NZR2 4599 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A1B0GVY2 172 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-209ENST00000607882 COPS9Q8WXC6 57 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-209ENST00000607882 TOMM7Q9P0U1 55 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-209ENST00000607882 DNAH5Q8TE73 4624 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-209ENST00000607882 LECT2O14960 151 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-209ENST00000607882 KRTAP10-2P60368 255 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-209ENST00000607882 S100A7L2Q5SY68 101 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM218AQ96MZ4 157 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-209ENST00000607882 CLPSL2Q6UWE3 100 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-209ENST00000607882 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-209ENST00000607882 PCLOQ9Y6V0 5065 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-209ENST00000607882 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-209ENST00000607882 HAMPP81172 84 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-209ENST00000607882 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-209ENST00000607882 PRR15Q8IV56 129 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-209ENST00000607882 COX7B2Q8TF08 81 aa8.35□□□□□ -1.07
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