RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588707.5

GTF3C2-AS1-205, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene GTF3C2-AS1, Length 607 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa4.81□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PKIGQ9Y2B9 76 aa4.81□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa4.8□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 NDUFC2O95298 119 aa4.8□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 NPC2P61916 151 aa4.8□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CARD19Q96LW7 228 aa4.8□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 C6orf48Q9UBA6 75 aa4.8□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa4.79□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 K7ERJ3 54 aa4.79□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 KRTAP10-2P60368 255 aa4.79□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 C10orf25Q5T742 122 aa4.79□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 Q6ZRU5 148 aa4.79□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 LINC00526Q96FQ7 95 aa4.79□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa4.79□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 H3BUT2 72 aa4.78□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 COX6CP09669 75 aa4.78□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TLX1NBP0CAT3 122 aa4.78□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 FABP2P12104 132 aa4.78□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 Q1RN00 199 aa4.78□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa4.78□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PCLOQ9Y6V0 5065 aa4.77□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 A0A1B0GV90 55 aa4.77□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 A0A1W2PPM0 123 aa4.77□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CDK2AP2O75956 126 aa4.77□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PSMB2P49721 201 aa4.77□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CNBPP62633 177 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 VAMP3Q15836 100 aa4.77□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa4.77□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa4.77□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CBY1Q9Y3M2 126 aa4.77□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 RYR1P21817 5038 aa4.76□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa4.76□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa4.76□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 LECT2O14960 151 aa4.76□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TSPAN13O95857 204 aa4.76□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP4.76□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TMEM126AQ9H061 195 aa4.76□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 LRP1BQ9NZR2 4599 aa4.76□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa4.75□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 LRCOL1A6NCL2 159 aa4.75□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 GAGE10A6NGK3 116 aa4.75□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 H7C2G1 150 aa4.75□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SCGB1C2P0DMR2 95 aa4.75□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 OR13C6PQ8NH95 151 aa4.75□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SPCS1Q9Y6A9 102 aa4.75□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 HSPG2P98160 4391 aa4.74□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa4.74□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 A0A087WTM6 91 aa4.74□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 IGKV2D-28P01615 120 aa4.74□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SLPIP03973 132 aa4.74□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 GAGE2EQ4V326 116 aa4.74□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 S100A7L2Q5SY68 101 aa4.74□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 Q6ZRP5 223 aa4.74□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 Q8N814 137 aa4.74□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 XAGE1AQ9HD64 81 aa4.74□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 GAGE2DQ9UEU5 116 aa4.74□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa4.74□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 K7EP34 96 aa4.73□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 RPL28P46779 137 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 UBE2V1Q13404 147 aa4.73□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 WFDC2Q14508 124 aa4.73□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 LINC00337Q8N6G1 96 aa4.73□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 LINC00474Q9P2X8 69 aa4.73□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 DNAH5Q8TE73 4624 aa4.73□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 APOBP04114 4563 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ABCA13Q86UQ4 5058 aa4.72□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 H0YGX0 51 aa4.72□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 M0R378 163 aa4.72□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 Q8N1X5 172 aa4.72□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 C9orf163Q8N9P6 203 aa4.72□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 NKAPP1Q8N9T2 125 aa4.72□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 NCR3O14931 201 aa4.71□□□□□ -1.66
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TRIAP1O43715 76 aa4.71□□□□□ -1.66
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SNCGO76070 127 aa4.71□□□□□ -1.66
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 VPREB1P12018 145 aa4.71□□□□□ -1.66
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 GAGE2BQ13066 116 aa4.71□□□□□ -1.66
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa4.7□□□□□ -1.66
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 IGLV6-57P01721 117 aa4.7□□□□□ -1.66
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 KRTAP10-1P60331 282 aa4.7□□□□□ -1.66
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PRR3P79522 188 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ATXN8Q156A1 80 aa4.7□□□□□ -1.66
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SMIM11BQ8TCY0 68 aa4.7□□□□□ -1.66
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 F8W1H4 67 aa4.69□□□□□ -1.66
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 XGP55808 180 aa4.69□□□□□ -1.66
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa4.68□□□□□ -1.66
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa4.68□□□□□ -1.66
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 A0A1B0GX51 115 aa4.68□□□□□ -1.66
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 H3BMG7 143 aa4.68□□□□□ -1.66
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TCL1BO95988 128 aa4.68□□□□□ -1.66
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 A0A096LNI7 61 aa4.67□□□□□ -1.66
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa4.67□□□□□ -1.66
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa4.67□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms