RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567479.1

KIFC3-231, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-231	ENST00000567479	PMVK	Q15126	192 aa		5.73	□□□□□ -1.49
KIFC3-231	ENST00000567479	SPATA45	Q537H7	98 aa		5.73	□□□□□ -1.49
KIFC3-231	ENST00000567479	IGLC3	P0DOY3	106 aa		5.72	□□□□□ -1.49
KIFC3-231	ENST00000567479	CXCL5	P42830	114 aa		5.72	□□□□□ -1.49
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTDAP	P60985	99 aa		5.72	□□□□□ -1.49
KIFC3-231	ENST00000567479	BATF	Q16520	125 aa		5.72	□□□□□ -1.49
KIFC3-231	ENST00000567479	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		5.72	□□□□□ -1.49
KIFC3-231	ENST00000567479	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		5.71	□□□□□ -1.5
KIFC3-231	ENST00000567479	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		5.71	□□□□□ -1.5
KIFC3-231	ENST00000567479	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		5.71	□□□□□ -1.5
KIFC3-231	ENST00000567479		H0Y9J4	135 aa		5.71	□□□□□ -1.5
KIFC3-231	ENST00000567479	COX7B2	Q8TF08	81 aa		5.71	□□□□□ -1.5
KIFC3-231	ENST00000567479	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		5.71	□□□□□ -1.5
KIFC3-231	ENST00000567479	C22orf24	Q9Y442	160 aa		5.71	□□□□□ -1.5
KIFC3-231	ENST00000567479		H3BRM9	83 aa		5.7	□□□□□ -1.5
KIFC3-231	ENST00000567479		K7ERU9	68 aa		5.7	□□□□□ -1.5
KIFC3-231	ENST00000567479	HSBP1	O75506	76 aa		5.7	□□□□□ -1.5
KIFC3-231	ENST00000567479	SPINK8	P0C7L1	97 aa		5.7	□□□□□ -1.5
KIFC3-231	ENST00000567479	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		5.69	□□□□□ -1.5
KIFC3-231	ENST00000567479	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
KIFC3-231	ENST00000567479	TNXB	P22105	4242 aa		5.68	□□□□□ -1.5
KIFC3-231	ENST00000567479	NUPR1	O60356	82 aa		5.68	□□□□□ -1.5
KIFC3-231	ENST00000567479	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
KIFC3-231	ENST00000567479	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		5.68	□□□□□ -1.5
KIFC3-231	ENST00000567479	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		5.68	□□□□□ -1.5
KIFC3-231	ENST00000567479		A0A096LNJ9	63 aa		5.67	□□□□□ -1.5
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF861P	O60384	105 aa		5.67	□□□□□ -1.5
KIFC3-231	ENST00000567479	ATP5L	O75964	103 aa		5.67	□□□□□ -1.5
KIFC3-231	ENST00000567479	HBD	P02042	147 aa		5.67	□□□□□ -1.5
KIFC3-231	ENST00000567479	C3orf79	P0CE67	100 aa		5.67	□□□□□ -1.5
KIFC3-231	ENST00000567479	LINC00310	P59036	64 aa		5.67	□□□□□ -1.5
KIFC3-231	ENST00000567479	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		5.67	□□□□□ -1.5
KIFC3-231	ENST00000567479	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		5.66	□□□□□ -1.5
KIFC3-231	ENST00000567479	VAMP3	Q15836	100 aa		5.66	□□□□□ -1.5
KIFC3-231	ENST00000567479	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		5.66	□□□□□ -1.5
KIFC3-231	ENST00000567479	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		5.65	□□□□□ -1.5
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		5.65	□□□□□ -1.5
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	5.65	□□□□□ -1.5
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC25A34	Q6PIV7	304 aa		5.65	□□□□□ -1.5
KIFC3-231	ENST00000567479	GTF2H5	Q6ZYL4	71 aa		5.65	□□□□□ -1.5
KIFC3-231	ENST00000567479	LINC00167	Q96N53	147 aa		5.65	□□□□□ -1.5
KIFC3-231	ENST00000567479	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		5.64	□□□□□ -1.51
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		5.64	□□□□□ -1.51
KIFC3-231	ENST00000567479	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		5.64	□□□□□ -1.51
KIFC3-231	ENST00000567479	PFN2	P35080	140 aa		5.64	□□□□□ -1.51
KIFC3-231	ENST00000567479	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		5.64	□□□□□ -1.51
KIFC3-231	ENST00000567479	VPS25	Q9BRG1	176 aa		5.64	□□□□□ -1.51
KIFC3-231	ENST00000567479	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		5.64	□□□□□ -1.51
KIFC3-231	ENST00000567479	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		5.63	□□□□□ -1.51
KIFC3-231	ENST00000567479		A6NDN8	102 aa		5.63	□□□□□ -1.51
KIFC3-231	ENST00000567479	GAGE10	A6NGK3	116 aa		5.63	□□□□□ -1.51
KIFC3-231	ENST00000567479	BCE1	O60756	84 aa		5.63	□□□□□ -1.51
KIFC3-231	ENST00000567479	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
KIFC3-231	ENST00000567479	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
KIFC3-231	ENST00000567479	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	5.63	□□□□□ -1.51
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		5.63	□□□□□ -1.51
KIFC3-231	ENST00000567479	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		5.63	□□□□□ -1.51
KIFC3-231	ENST00000567479	C11orf86	A6NJI1	115 aa		5.62	□□□□□ -1.51
KIFC3-231	ENST00000567479	SMCP	P49901	116 aa	Predicted RBP	5.62	□□□□□ -1.51
KIFC3-231	ENST00000567479	COX17	Q14061	63 aa		5.62	□□□□□ -1.51
KIFC3-231	ENST00000567479	OCIAD2	Q56VL3	154 aa		5.62	□□□□□ -1.51
KIFC3-231	ENST00000567479	ERG28	Q9UKR5	140 aa		5.62	□□□□□ -1.51
KIFC3-231	ENST00000567479	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
KIFC3-231	ENST00000567479	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		5.61	□□□□□ -1.51
KIFC3-231	ENST00000567479	LEPROTL1	O95214	131 aa		5.61	□□□□□ -1.51
KIFC3-231	ENST00000567479	SFTA2	Q6UW10	78 aa		5.61	□□□□□ -1.51
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	5.61	□□□□□ -1.51
KIFC3-231	ENST00000567479	SCGB1A1	P11684	91 aa		5.6	□□□□□ -1.51
KIFC3-231	ENST00000567479	UBE2A	P49459	152 aa		5.6	□□□□□ -1.51
KIFC3-231	ENST00000567479	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	5.6	□□□□□ -1.51
KIFC3-231	ENST00000567479	BVES-AS1	Q5T3Y7	98 aa		5.6	□□□□□ -1.51
KIFC3-231	ENST00000567479	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		5.6	□□□□□ -1.51
KIFC3-231	ENST00000567479	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		5.6	□□□□□ -1.51
KIFC3-231	ENST00000567479	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		5.59	□□□□□ -1.51
KIFC3-231	ENST00000567479	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		5.59	□□□□□ -1.51
KIFC3-231	ENST00000567479		J3QR89	54 aa		5.59	□□□□□ -1.51
KIFC3-231	ENST00000567479	IGKV2D-28	P01615	120 aa		5.59	□□□□□ -1.51
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM223	A0PJW6	202 aa		5.58	□□□□□ -1.52
KIFC3-231	ENST00000567479	TAX1BP3	O14907	124 aa		5.58	□□□□□ -1.52
KIFC3-231	ENST00000567479	COX8A	P10176	69 aa		5.58	□□□□□ -1.52
KIFC3-231	ENST00000567479	VPREB1	P12018	145 aa		5.58	□□□□□ -1.52
KIFC3-231	ENST00000567479	LINC00158	P58513	81 aa		5.58	□□□□□ -1.52
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		5.58	□□□□□ -1.52
KIFC3-231	ENST00000567479	CRYGA	P11844	174 aa		5.57	□□□□□ -1.52
KIFC3-231	ENST00000567479	HSD52	Q0P140	79 aa		5.57	□□□□□ -1.52
KIFC3-231	ENST00000567479	LINC01545	Q5VT33	79 aa		5.57	□□□□□ -1.52
KIFC3-231	ENST00000567479	LRP2	P98164	4655 aa		5.57	□□□□□ -1.52
KIFC3-231	ENST00000567479		A0A0U1RRA0	63 aa		5.56	□□□□□ -1.52
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP13-1	Q8IUC0	172 aa		5.56	□□□□□ -1.52
KIFC3-231	ENST00000567479	ATOH7	Q8N100	152 aa		5.56	□□□□□ -1.52
KIFC3-231	ENST00000567479	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		5.56	□□□□□ -1.52
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM126A	Q9H061	195 aa		5.56	□□□□□ -1.52
KIFC3-231	ENST00000567479		A0A087X002	238 aa		5.55	□□□□□ -1.52
KIFC3-231	ENST00000567479	C9orf118	A6NHY6	69 aa		5.55	□□□□□ -1.52
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM238	C9JI98	176 aa		5.55	□□□□□ -1.52
KIFC3-231	ENST00000567479	TSPAN13	O95857	204 aa		5.55	□□□□□ -1.52
KIFC3-231	ENST00000567479	PRR4	Q16378	134 aa		5.55	□□□□□ -1.52
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		5.55	□□□□□ -1.52
KIFC3-231	ENST00000567479	MTURN	Q8N3F0	131 aa		5.55	□□□□□ -1.52
KIFC3-231	ENST00000567479	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		5.55	□□□□□ -1.52

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