RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549355.1

PTPRQ-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Q, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRQ, Length 567 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQ-204ENST00000549355 ATP5LO75964 103 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRQ-204ENST00000549355 RPL28P46779 137 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
PTPRQ-204ENST00000549355 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
PTPRQ-204ENST00000549355 S100A12P80511 92 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRQ-204ENST00000549355 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP2.67□□□□□ -1.98
PTPRQ-204ENST00000549355 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRQ-204ENST00000549355 SVBPQ8N300 66 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRQ-204ENST00000549355 A0A1B0GVG6 124 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRQ-204ENST00000549355 M0QXV9 152 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRQ-204ENST00000549355 SNAPINO95295 136 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRQ-204ENST00000549355 IGLV7-43P04211 117 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRQ-204ENST00000549355 DSCR10P59022 87 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRQ-204ENST00000549355 PMVKQ15126 192 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRQ-204ENST00000549355 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
PTPRQ-204ENST00000549355 C1orf137Q5JT78 98 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRQ-204ENST00000549355 LINC00469Q8N7U9 141 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRQ-204ENST00000549355 H0Y9J4 135 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 IFITM2Q01629 132 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 FABP9Q0Z7S8 132 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 KIAA0087Q14695 138 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 GAGE2EQ4V326 116 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 NKAPP1Q8N9T2 125 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 CST9LQ9H4G1 147 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 TOMM7Q9P0U1 55 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 C6orf48Q9UBA6 75 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 GAGE2DQ9UEU5 116 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 CBY1Q9Y3M2 126 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 DNAH8Q96JB1 4490 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 A0A1W2PNN7 141 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 ZNF861PO60384 105 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 HBDP02042 147 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 LINC00614P0C842 121 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 C10orf91Q5T1B1 145 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 COX7B2Q8TF08 81 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 RPS10P5Q9NQ39 176 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 HMCN2Q8NDA2 5059 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 BCE1O60756 84 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 ATP6V1G1O75348 118 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 MT1HL1P0DM35 61 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 HERV-K104P63124 156 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 LINC00173Q6ZV60 143 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 COMMD7Q86VX2 200 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 FAM104AQ969W3 186 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 C22orf24Q9Y442 160 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 UBR4Q5T4S7 5183 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 A0A0U1RQV1 116 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 IGLC3P0DOY3 106 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 CRYGAP11844 174 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 AKR1D1P51857 326 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 NDUFA6P56556 154 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 FAM229BQ4G0N7 80 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 C2orf82Q6UX34 121 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP2.62□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa2.61□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 APOC3P02656 99 aa2.61□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 ADCYAP1P18509 176 aa2.61□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 PLNP26678 52 aa2.61□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 UBE2AP49459 152 aa2.61□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 HERVK_113P61574 105 aa2.61□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 KIAA1644Q3SXP7 199 aa2.61□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 TMEM170BQ5T4T1 132 aa2.61□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 Q75L30 129 aa2.61□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 HSPB8Q9UJY1 196 aa2.61□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 NDUFAF8A1L188 74 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 HSBP1O75506 76 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 NMUP48645 174 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 SPAG11AQ6PDA7 123 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 BAGE3Q86Y29 109 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 C18orf32Q8TCD1 76 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 XAGE1AQ9HD64 81 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 ERG28Q9UKR5 140 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 A0A087X002 238 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 FAM168BA1KXE4 195 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 C5orf52A6NGY3 159 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 SPINK8P0C7L1 97 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 COPS9Q8WXC6 57 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 IFI27L1Q96BM0 104 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 MIEN1Q9BRT3 115 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRQ-204ENST00000549355 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa2.58□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 C11orf86A6NJI1 115 aa2.58□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 M0R378 163 aa2.58□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 LEPROTL1O95214 131 aa2.58□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.1 ms