RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527333.5

CKAP5-208, Transcript of cytoskeleton associated protein 5, humanhuman

TSL 5

Gene CKAP5, Length 498 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5-208ENST00000527333 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa5.98□□□□□ -1.45
CKAP5-208ENST00000527333 VAMP3Q15836 100 aa5.98□□□□□ -1.45
CKAP5-208ENST00000527333 C10orf25Q5T742 122 aa5.98□□□□□ -1.45
CKAP5-208ENST00000527333 SFTA2Q6UW10 78 aa5.98□□□□□ -1.45
CKAP5-208ENST00000527333 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa5.98□□□□□ -1.45
CKAP5-208ENST00000527333 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
CKAP5-208ENST00000527333 A0A0U1RRA0 63 aa5.97□□□□□ -1.45
CKAP5-208ENST00000527333 LY6G6CO95867 125 aa5.97□□□□□ -1.45
CKAP5-208ENST00000527333 CRPP02741 224 aa5.97□□□□□ -1.45
CKAP5-208ENST00000527333 PRSS2P07478 247 aa5.97□□□□□ -1.45
CKAP5-208ENST00000527333 CXCL5P42830 114 aa5.97□□□□□ -1.45
CKAP5-208ENST00000527333 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
CKAP5-208ENST00000527333 C6orf226Q5I0X4 101 aa5.97□□□□□ -1.45
CKAP5-208ENST00000527333 C6orf223Q8N319 242 aa5.97□□□□□ -1.45
CKAP5-208ENST00000527333 C15orf56Q8N910 161 aa5.97□□□□□ -1.45
CKAP5-208ENST00000527333 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa5.97□□□□□ -1.45
CKAP5-208ENST00000527333 ERG28Q9UKR5 140 aa5.97□□□□□ -1.45
CKAP5-208ENST00000527333 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa5.96□□□□□ -1.46
CKAP5-208ENST00000527333 GAGE10A6NGK3 116 aa5.96□□□□□ -1.46
CKAP5-208ENST00000527333 IGKV2D-28P01615 120 aa5.96□□□□□ -1.46
CKAP5-208ENST00000527333 NPC2P61916 151 aa5.96□□□□□ -1.46
CKAP5-208ENST00000527333 MEIG1Q5JSS6 88 aa5.96□□□□□ -1.46
CKAP5-208ENST00000527333 Q6ZR54 194 aa5.96□□□□□ -1.46
CKAP5-208ENST00000527333 PRO0461Q9UI25 63 aa5.96□□□□□ -1.46
CKAP5-208ENST00000527333 SPCS1Q9Y6A9 102 aa5.96□□□□□ -1.46
CKAP5-208ENST00000527333 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa5.95□□□□□ -1.46
CKAP5-208ENST00000527333 LCE6AA0A183 80 aa5.95□□□□□ -1.46
CKAP5-208ENST00000527333 FABP2P12104 132 aa5.95□□□□□ -1.46
CKAP5-208ENST00000527333 SPAG11BQ08648 103 aa5.95□□□□□ -1.46
CKAP5-208ENST00000527333 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa5.95□□□□□ -1.46
CKAP5-208ENST00000527333 RMI2Q96E14 147 aa5.95□□□□□ -1.46
CKAP5-208ENST00000527333 DNAH10Q8IVF4 4471 aa5.95□□□□□ -1.46
CKAP5-208ENST00000527333 DNAH17Q9UFH2 4485 aa5.95□□□□□ -1.46
CKAP5-208ENST00000527333 COX17Q14061 63 aa5.94□□□□□ -1.46
CKAP5-208ENST00000527333 Q8NDZ9 215 aa5.94□□□□□ -1.46
CKAP5-208ENST00000527333 SVIPQ8NHG7 77 aa5.94□□□□□ -1.46
CKAP5-208ENST00000527333 LINC00526Q96FQ7 95 aa5.94□□□□□ -1.46
CKAP5-208ENST00000527333 C6orf48Q9UBA6 75 aa5.94□□□□□ -1.46
CKAP5-208ENST00000527333 FRAS1Q86XX4 4008 aa5.93□□□□□ -1.46
CKAP5-208ENST00000527333 LINC00158P58513 81 aa5.93□□□□□ -1.46
CKAP5-208ENST00000527333 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
CKAP5-208ENST00000527333 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa5.93□□□□□ -1.46
CKAP5-208ENST00000527333 LINC00337Q8N6G1 96 aa5.93□□□□□ -1.46
CKAP5-208ENST00000527333 C2orf48Q96LS8 159 aa5.93□□□□□ -1.46
CKAP5-208ENST00000527333 Q9HAA7 133 aa5.93□□□□□ -1.46
CKAP5-208ENST00000527333 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa5.92□□□□□ -1.46
CKAP5-208ENST00000527333 TCL1BO95988 128 aa5.92□□□□□ -1.46
CKAP5-208ENST00000527333 PFN2P35080 140 aa5.92□□□□□ -1.46
CKAP5-208ENST00000527333 LINC01600Q96MT4 127 aa5.92□□□□□ -1.46
CKAP5-208ENST00000527333 F8WDY8 70 aa5.91□□□□□ -1.46
CKAP5-208ENST00000527333 M0R2N4 97 aa5.91□□□□□ -1.46
CKAP5-208ENST00000527333 CKS1BP61024 79 aa5.91□□□□□ -1.46
CKAP5-208ENST00000527333 CFAP161Q6P656 301 aa5.91□□□□□ -1.46
CKAP5-208ENST00000527333 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
CKAP5-208ENST00000527333 COPS9Q8WXC6 57 aa5.91□□□□□ -1.46
CKAP5-208ENST00000527333 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa5.91□□□□□ -1.46
CKAP5-208ENST00000527333 HYDINQ4G0P3 5121 aa5.91□□□□□ -1.46
CKAP5-208ENST00000527333 NDUFC2O95298 119 aa5.9□□□□□ -1.46
CKAP5-208ENST00000527333 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
CKAP5-208ENST00000527333 Q6ZRU5 148 aa5.9□□□□□ -1.46
CKAP5-208ENST00000527333 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
CKAP5-208ENST00000527333 FAT2Q9NYQ8 4349 aa5.9□□□□□ -1.47
CKAP5-208ENST00000527333 H3BMG7 143 aa5.89□□□□□ -1.47
CKAP5-208ENST00000527333 HIGD2BQ4VC39 106 aa5.89□□□□□ -1.47
CKAP5-208ENST00000527333 C1orf134Q5TEV5 83 aa5.89□□□□□ -1.47
CKAP5-208ENST00000527333 RYR2Q92736 4967 aa5.88□□□□□ -1.47
CKAP5-208ENST00000527333 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa5.88□□□□□ -1.47
CKAP5-208ENST00000527333 RPL28P46779 137 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
CKAP5-208ENST00000527333 WFDC2Q14508 124 aa5.88□□□□□ -1.47
CKAP5-208ENST00000527333 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa5.87□□□□□ -1.47
CKAP5-208ENST00000527333 F8W1H4 67 aa5.87□□□□□ -1.47
CKAP5-208ENST00000527333 H7C2G1 150 aa5.87□□□□□ -1.47
CKAP5-208ENST00000527333 PSCAO43653 123 aa5.87□□□□□ -1.47
CKAP5-208ENST00000527333 PRR3P79522 188 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
CKAP5-208ENST00000527333 LST1O00453 97 aa5.86□□□□□ -1.47
CKAP5-208ENST00000527333 PRYO14603 147 aa5.86□□□□□ -1.47
CKAP5-208ENST00000527333 TLX1NBP0CAT3 122 aa5.86□□□□□ -1.47
CKAP5-208ENST00000527333 PSMB2P49721 201 aa5.86□□□□□ -1.47
CKAP5-208ENST00000527333 LYRM7Q5U5X0 104 aa5.86□□□□□ -1.47
CKAP5-208ENST00000527333 SMIM11BQ8TCY0 68 aa5.86□□□□□ -1.47
CKAP5-208ENST00000527333 CAMK2N2Q96S95 79 aa5.86□□□□□ -1.47
CKAP5-208ENST00000527333 DNAH11Q96DT5 4516 aa5.86□□□□□ -1.47
CKAP5-208ENST00000527333 LRCOL1A6NCL2 159 aa5.85□□□□□ -1.47
CKAP5-208ENST00000527333 USP17L23D6RBM5 183 aa5.85□□□□□ -1.47
CKAP5-208ENST00000527333 M0QXV9 152 aa5.85□□□□□ -1.47
CKAP5-208ENST00000527333 RTL8CO15255 209 aa5.85□□□□□ -1.47
CKAP5-208ENST00000527333 VPREB1P12018 145 aa5.85□□□□□ -1.47
CKAP5-208ENST00000527333 LINC01620Q4KN68 170 aa5.85□□□□□ -1.47
CKAP5-208ENST00000527333 FAM218AQ96MZ4 157 aa5.85□□□□□ -1.47
CKAP5-208ENST00000527333 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa5.84□□□□□ -1.47
CKAP5-208ENST00000527333 SYCNQ0VAF6 134 aa5.84□□□□□ -1.47
CKAP5-208ENST00000527333 C14orf177Q52M58 125 aa5.84□□□□□ -1.47
CKAP5-208ENST00000527333 CLEC2BQ92478 149 aa5.84□□□□□ -1.47
CKAP5-208ENST00000527333 PKD1P98161 4303 aa5.83□□□□□ -1.48
CKAP5-208ENST00000527333 A0A087WTM6 91 aa5.83□□□□□ -1.48
CKAP5-208ENST00000527333 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa5.83□□□□□ -1.48
CKAP5-208ENST00000527333 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa5.83□□□□□ -1.48
CKAP5-208ENST00000527333 IGLV6-57P01721 117 aa5.83□□□□□ -1.48
CKAP5-208ENST00000527333 SCGB1C2P0DMR2 95 aa5.83□□□□□ -1.48
CKAP5-208ENST00000527333 Q1RN00 199 aa5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.2 ms