RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484696.1

UBAP2L-215, Transcript of ubiquitin associated protein 2 like, human

TSL 2

Gene UBAP2L, Length 611 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBAP2L-215	ENST00000484696		M0QXV9	152 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBAP2L-215	ENST00000484696	SEC11A	P67812	179 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBAP2L-215	ENST00000484696	KIAA0087	Q14695	138 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBAP2L-215	ENST00000484696	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBAP2L-215	ENST00000484696	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBAP2L-215	ENST00000484696	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBAP2L-215	ENST00000484696	DIRC1	Q969H9	104 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBAP2L-215	ENST00000484696	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UBAP2L-215	ENST00000484696	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBAP2L-215	ENST00000484696	IGLV7-43	P04211	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBAP2L-215	ENST00000484696	KRTAP10-8	P60410	259 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBAP2L-215	ENST00000484696	HERVK_113	P63121	156 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBAP2L-215	ENST00000484696	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBAP2L-215	ENST00000484696	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBAP2L-215	ENST00000484696	AMELX	Q99217	191 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBAP2L-215	ENST00000484696	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBAP2L-215	ENST00000484696	IGIP	A6NJ69	53 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBAP2L-215	ENST00000484696	SCGB1D1	O95968	90 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBAP2L-215	ENST00000484696	PMCHL1	Q16048	86 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBAP2L-215	ENST00000484696		Q8IZM0	81 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBAP2L-215	ENST00000484696	PRO1933	Q9H354	126 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBAP2L-215	ENST00000484696	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBAP2L-215	ENST00000484696	TOMM6	Q96B49	74 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBAP2L-215	ENST00000484696	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBAP2L-215	ENST00000484696	TIMM17A	Q99595	171 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBAP2L-215	ENST00000484696	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBAP2L-215	ENST00000484696	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBAP2L-215	ENST00000484696	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBAP2L-215	ENST00000484696	LINC01549	A6NIU2	74 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBAP2L-215	ENST00000484696		H0Y9J4	135 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBAP2L-215	ENST00000484696	CXCL5	P42830	114 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBAP2L-215	ENST00000484696	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBAP2L-215	ENST00000484696	ERAS	Q7Z444	233 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBAP2L-215	ENST00000484696	VAMP8	Q9BV40	100 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBAP2L-215	ENST00000484696	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBAP2L-215	ENST00000484696		F8VRH5	84 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBAP2L-215	ENST00000484696	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBAP2L-215	ENST00000484696	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBAP2L-215	ENST00000484696	FA2H	Q7L5A8	372 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBAP2L-215	ENST00000484696	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBAP2L-215	ENST00000484696	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBAP2L-215	ENST00000484696	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBAP2L-215	ENST00000484696	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBAP2L-215	ENST00000484696	COX7B2	Q8TF08	81 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBAP2L-215	ENST00000484696	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBAP2L-215	ENST00000484696	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBAP2L-215	ENST00000484696	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBAP2L-215	ENST00000484696	UBE2V1	Q13404	147 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBAP2L-215	ENST00000484696	C22orf24	Q9Y442	160 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBAP2L-215	ENST00000484696	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBAP2L-215	ENST00000484696	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBAP2L-215	ENST00000484696		H3BRM9	83 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBAP2L-215	ENST00000484696	NUPR1	O60356	82 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBAP2L-215	ENST00000484696	SPINK8	P0C7L1	97 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBAP2L-215	ENST00000484696	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UBAP2L-215	ENST00000484696	PMVK	Q15126	192 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBAP2L-215	ENST00000484696	CST9L	Q9H4G1	147 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBAP2L-215	ENST00000484696	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UBAP2L-215	ENST00000484696	LINC01546	A6NGU7	62 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBAP2L-215	ENST00000484696		K7ERU9	68 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBAP2L-215	ENST00000484696	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
UBAP2L-215	ENST00000484696	BAGE3	Q86Y29	109 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBAP2L-215	ENST00000484696	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBAP2L-215	ENST00000484696	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBAP2L-215	ENST00000484696	TNXB	P22105	4242 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBAP2L-215	ENST00000484696	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBAP2L-215	ENST00000484696	ZNF861P	O60384	105 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBAP2L-215	ENST00000484696	ATP5L	O75964	103 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBAP2L-215	ENST00000484696	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
UBAP2L-215	ENST00000484696	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBAP2L-215	ENST00000484696	GAGE10	A6NGK3	116 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBAP2L-215	ENST00000484696	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBAP2L-215	ENST00000484696	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBAP2L-215	ENST00000484696	MTURN	Q8N3F0	131 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBAP2L-215	ENST00000484696	LINC00167	Q96N53	147 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBAP2L-215	ENST00000484696	LRP2	P98164	4655 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBAP2L-215	ENST00000484696	BCE1	O60756	84 aa		4.8	□□□□□ -1.64
UBAP2L-215	ENST00000484696	HBD	P02042	147 aa		4.8	□□□□□ -1.64
UBAP2L-215	ENST00000484696	PFN2	P35080	140 aa		4.8	□□□□□ -1.64
UBAP2L-215	ENST00000484696	IGLC3	P0DOY3	106 aa		4.79	□□□□□ -1.64
UBAP2L-215	ENST00000484696	SCGB1A1	P11684	91 aa		4.79	□□□□□ -1.64
UBAP2L-215	ENST00000484696	UBE2A	P49459	152 aa		4.79	□□□□□ -1.64
UBAP2L-215	ENST00000484696	PRR4	Q16378	134 aa		4.79	□□□□□ -1.64
UBAP2L-215	ENST00000484696	SPATA45	Q537H7	98 aa		4.79	□□□□□ -1.64
UBAP2L-215	ENST00000484696	GTF2H5	Q6ZYL4	71 aa		4.79	□□□□□ -1.64
UBAP2L-215	ENST00000484696	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		4.79	□□□□□ -1.64
UBAP2L-215	ENST00000484696	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
UBAP2L-215	ENST00000484696	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		4.78	□□□□□ -1.64
UBAP2L-215	ENST00000484696	VPS25	Q9BRG1	176 aa		4.78	□□□□□ -1.64
UBAP2L-215	ENST00000484696	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		4.78	□□□□□ -1.64
UBAP2L-215	ENST00000484696	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		4.77	□□□□□ -1.65
UBAP2L-215	ENST00000484696	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		4.77	□□□□□ -1.65
UBAP2L-215	ENST00000484696		A0A096LNJ9	63 aa		4.77	□□□□□ -1.65
UBAP2L-215	ENST00000484696	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		4.77	□□□□□ -1.65
UBAP2L-215	ENST00000484696		J3QR89	54 aa		4.77	□□□□□ -1.65
UBAP2L-215	ENST00000484696	IGKV2D-28	P01615	120 aa		4.77	□□□□□ -1.65
UBAP2L-215	ENST00000484696	CRYGA	P11844	174 aa		4.77	□□□□□ -1.65
UBAP2L-215	ENST00000484696	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
UBAP2L-215	ENST00000484696	VAMP3	Q15836	100 aa		4.77	□□□□□ -1.65
UBAP2L-215	ENST00000484696	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		4.77	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.1 ms