RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443253.1

BBX-212, Transcript of BBX, HMG-box containing, humanhuman

TSL 5

Gene BBX, Length 238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBX-212ENST00000443253 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP-0.95□□□□□ -2.56
BBX-212ENST00000443253 MLH3Q9UHC1 1453 aa-0.95□□□□□ -2.56
BBX-212ENST00000443253 FAM135AQ9P2D6 1515 aa-0.95□□□□□ -2.56
BBX-212ENST00000443253 KNDC1Q76NI1 1749 aa-0.95□□□□□ -2.56
BBX-212ENST00000443253 SPRR2EP22531 72 aa-0.96□□□□□ -2.56
BBX-212ENST00000443253 TRGV9Q99603 122 aa-0.96□□□□□ -2.56
BBX-212ENST00000443253 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP-0.96□□□□□ -2.56
BBX-212ENST00000443253 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP-0.97□□□□□ -2.56
BBX-212ENST00000443253 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP-0.97□□□□□ -2.57
BBX-212ENST00000443253 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP-0.98□□□□□ -2.57
BBX-212ENST00000443253 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa-0.98□□□□□ -2.57
BBX-212ENST00000443253 DEFB112Q30KQ8 113 aa-0.98□□□□□ -2.57
BBX-212ENST00000443253 LELP1Q5T871 98 aa-0.98□□□□□ -2.57
BBX-212ENST00000443253 MPC2O95563 127 aa-0.99□□□□□ -2.57
BBX-212ENST00000443253 UQCRHP07919 91 aa-0.99□□□□□ -2.57
BBX-212ENST00000443253 LRRC37AA6NMS7 1700 aa-0.99□□□□□ -2.57
BBX-212ENST00000443253 ABCA3Q99758 1704 aa-0.99□□□□□ -2.57
BBX-212ENST00000443253 RNF213Q63HN8 5207 aa-1□□□□□ -2.57
BBX-212ENST00000443253 CCL22O00626 93 aa-1□□□□□ -2.57
BBX-212ENST00000443253 MT-ATP8P03928 68 aa-1□□□□□ -2.57
BBX-212ENST00000443253 HEPN1Q6WQI6 88 aa-1□□□□□ -2.57
BBX-212ENST00000443253 PMCHL2Q9BQD1 86 aa-1□□□□□ -2.57
BBX-212ENST00000443253 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa-1□□□□□ -2.57
BBX-212ENST00000443253 LAMA5O15230 3695 aa-1□□□□□ -2.57
BBX-212ENST00000443253 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa-1.01□□□□□ -2.57
BBX-212ENST00000443253 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa-1.01□□□□□ -2.57
BBX-212ENST00000443253 MT4P47944 62 aa-1.01□□□□□ -2.57
BBX-212ENST00000443253 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa-1.01□□□□□ -2.57
BBX-212ENST00000443253 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa-1.02□□□□□ -2.57
BBX-212ENST00000443253 TMEM218A2RU14 115 aa-1.02□□□□□ -2.57
BBX-212ENST00000443253 CUX1P39880 1505 aa-1.02□□□□□ -2.57
BBX-212ENST00000443253 SHPRHQ149N8 1683 aa-1.02□□□□□ -2.57
BBX-212ENST00000443253 NRXN1Q9ULB1 1477 aa-1.02□□□□□ -2.57
BBX-212ENST00000443253 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa-1.03□□□□□ -2.57
BBX-212ENST00000443253 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa-1.03□□□□□ -2.57
BBX-212ENST00000443253 TGP01266 2768 aa-1.03□□□□□ -2.57
BBX-212ENST00000443253 ATOX1O00244 68 aa-1.03□□□□□ -2.57
BBX-212ENST00000443253 SERP2Q8N6R1 65 aa-1.03□□□□□ -2.57
BBX-212ENST00000443253 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa-1.03□□□□□ -2.57
BBX-212ENST00000443253 AP4S1Q9Y587 144 aa-1.03□□□□□ -2.57
BBX-212ENST00000443253 SAMD9Q5K651 1589 aa-1.04□□□□□ -2.58
BBX-212ENST00000443253 STARD9Q9P2P6 4700 aa-1.04□□□□□ -2.58
BBX-212ENST00000443253 CLIP1P30622 1438 aa-1.04□□□□□ -2.58
BBX-212ENST00000443253 ANKRD36A6QL64 1941 aa-1.04□□□□□ -2.58
BBX-212ENST00000443253 S100A10P60903 97 aa-1.04□□□□□ -2.58
BBX-212ENST00000443253 WFDC13Q8IUB5 93 aa-1.04□□□□□ -2.58
BBX-212ENST00000443253 ABCC2Q92887 1545 aa-1.05□□□□□ -2.58
BBX-212ENST00000443253 HIVEP1P15822 2718 aa-1.05□□□□□ -2.58
BBX-212ENST00000443253 S100PP25815 95 aa-1.05□□□□□ -2.58
BBX-212ENST00000443253 C14orf144Q96I85 54 aa-1.05□□□□□ -2.58
BBX-212ENST00000443253 HIGD1BQ9P298 99 aa-1.05□□□□□ -2.58
BBX-212ENST00000443253 PSENENQ9NZ42 101 aa-1.06□□□□□ -2.58
BBX-212ENST00000443253 MON2Q7Z3U7 1717 aa-1.06□□□□□ -2.58
BBX-212ENST00000443253 KNL1Q8NG31 2342 aa-1.07□□□□□ -2.58
BBX-212ENST00000443253 IGLC2P0DOY2 106 aa-1.07□□□□□ -2.58
BBX-212ENST00000443253 IGLC3P0DOY3 106 aa-1.07□□□□□ -2.58
BBX-212ENST00000443253 HMGN3Q15651 99 aa-1.07□□□□□ -2.58
BBX-212ENST00000443253 ETDBQ3ZM63 59 aa-1.07□□□□□ -2.58
BBX-212ENST00000443253 ADAMTS12P58397 1594 aa-1.08□□□□□ -2.58
BBX-212ENST00000443253 MXRA5Q9NR99 2828 aa-1.08□□□□□ -2.58
BBX-212ENST00000443253 D6R8Y8 96 aa-1.08□□□□□ -2.58
BBX-212ENST00000443253 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa-1.08□□□□□ -2.58
BBX-212ENST00000443253 MUSTN1Q8IVN3 82 aa-1.08□□□□□ -2.58
BBX-212ENST00000443253 C5P01031 1676 aa-1.08□□□□□ -2.58
BBX-212ENST00000443253 PTPN23Q9H3S7 1636 aa-1.08□□□□□ -2.58
BBX-212ENST00000443253 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP-1.09□□□□□ -2.58
BBX-212ENST00000443253 RYR2Q92736 4967 aa-1.09□□□□□ -2.58
BBX-212ENST00000443253 SONP18583 2426 aaKnown RBP-1.09□□□□□ -2.58
BBX-212ENST00000443253 SPTBN4Q9H254 2564 aa-1.09□□□□□ -2.58
BBX-212ENST00000443253 F8WEM9 126 aa-1.09□□□□□ -2.58
BBX-212ENST00000443253 LEPROTL1O95214 131 aa-1.09□□□□□ -2.58
BBX-212ENST00000443253 ALKAL2Q6UX46 152 aa-1.09□□□□□ -2.58
BBX-212ENST00000443253 NBASA2RRP1 2371 aa-1.1□□□□□ -2.58
BBX-212ENST00000443253 H0YGG7 62 aa-1.1□□□□□ -2.59
BBX-212ENST00000443253 ZNF720Q7Z2F6 126 aa-1.1□□□□□ -2.59
BBX-212ENST00000443253 TCEAL7Q9BRU2 100 aa-1.1□□□□□ -2.59
BBX-212ENST00000443253 REV3LO60673 3130 aa-1.1□□□□□ -2.59
BBX-212ENST00000443253 PKD1P98161 4303 aa-1.11□□□□□ -2.59
BBX-212ENST00000443253 UQCRHLA0A096LP55 91 aa-1.11□□□□□ -2.59
BBX-212ENST00000443253 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa-1.11□□□□□ -2.59
BBX-212ENST00000443253 LINC00032P0C843 101 aa-1.11□□□□□ -2.59
BBX-212ENST00000443253 FAUP35544 74 aaKnown RBP-1.11□□□□□ -2.59
BBX-212ENST00000443253 FYCO1Q9BQS8 1478 aa-1.12□□□□□ -2.59
BBX-212ENST00000443253 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP-1.12□□□□□ -2.59
BBX-212ENST00000443253 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP-1.12□□□□□ -2.59
BBX-212ENST00000443253 TEX14Q8IWB6 1497 aa-1.12□□□□□ -2.59
BBX-212ENST00000443253 DPY30Q9C005 99 aa-1.13□□□□□ -2.59
BBX-212ENST00000443253 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP-1.14□□□□□ -2.59
BBX-212ENST00000443253 RBP2P50120 134 aa-1.14□□□□□ -2.59
BBX-212ENST00000443253 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa-1.14□□□□□ -2.59
BBX-212ENST00000443253 MAGI2Q86UL8 1455 aa-1.14□□□□□ -2.59
BBX-212ENST00000443253 CNTLNQ9NXG0 1405 aa-1.15□□□□□ -2.59
BBX-212ENST00000443253 BCORQ6W2J9 1755 aa-1.15□□□□□ -2.59
BBX-212ENST00000443253 NMSQ5H8A3 153 aa-1.15□□□□□ -2.59
BBX-212ENST00000443253 DNAH6Q9C0G6 4158 aa-1.15□□□□□ -2.59
BBX-212ENST00000443253 COX7BP24311 80 aa-1.16□□□□□ -2.6
BBX-212ENST00000443253 ACBD7Q8N6N7 88 aa-1.16□□□□□ -2.6
BBX-212ENST00000443253 SPG11Q96JI7 2443 aa-1.16□□□□□ -2.6
BBX-212ENST00000443253 KIF20BQ96Q89 1820 aa-1.17□□□□□ -2.6
BBX-212ENST00000443253 AKAP13Q12802 2813 aa-1.17□□□□□ -2.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 152 ms