RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAT4Q6V0I7 4981 aa7.82□□□□□ -1.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATP5LO75964 103 aa7.81□□□□□ -1.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa7.81□□□□□ -1.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HSBP1L1C9JCN9 74 aa7.81□□□□□ -1.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LINC01561Q8N1V8 128 aa7.81□□□□□ -1.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM141Q96I45 108 aa7.81□□□□□ -1.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MIEN1Q9BRT3 115 aa7.81□□□□□ -1.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MUC17Q685J3 4493 aa7.8□□□□□ -1.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LINC01549A6NIU2 74 aa7.8□□□□□ -1.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TSPAN13O95857 204 aa7.79□□□□□ -1.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C2orf88Q9BSF0 95 aa7.79□□□□□ -1.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C22orf24Q9Y442 160 aa7.79□□□□□ -1.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRSS2P07478 247 aa7.78□□□□□ -1.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa7.78□□□□□ -1.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LINC00469Q8N7U9 141 aa7.78□□□□□ -1.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TOMM6Q96B49 74 aa7.78□□□□□ -1.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PMCHL2Q9BQD1 86 aa7.78□□□□□ -1.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UQCR10Q9UDW1 63 aa7.78□□□□□ -1.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A087X002 238 aa7.77□□□□□ -1.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGLC3P0DOY3 106 aa7.77□□□□□ -1.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 Q6ZN92 141 aa7.77□□□□□ -1.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C14orf144Q96I85 54 aa7.77□□□□□ -1.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TOMM7Q9P0U1 55 aa7.77□□□□□ -1.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CYSLTR1Q9Y271 337 aa7.77□□□□□ -1.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CKS1BP61024 79 aa7.76□□□□□ -1.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa7.76□□□□□ -1.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C2orf66Q6UXQ4 117 aa7.76□□□□□ -1.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 Q8IZM0 81 aa7.76□□□□□ -1.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SCGB3A1Q96QR1 104 aa7.76□□□□□ -1.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 XAGE1AQ9HD64 81 aa7.76□□□□□ -1.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa7.75□□□□□ -1.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AMELXQ99217 191 aa7.75□□□□□ -1.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDIP1Q9H305 208 aa7.75□□□□□ -1.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPL28P46779 137 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C6orf226Q5I0X4 101 aa7.75□□□□□ -1.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TYMSOSQ8TAI1 123 aa7.75□□□□□ -1.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TP73-AS1Q9UF72 201 aa7.75□□□□□ -1.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BCE1O60756 84 aa7.74□□□□□ -1.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NPSP0C0P6 89 aa7.74□□□□□ -1.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CRYGAP11844 174 aa7.74□□□□□ -1.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ERASQ7Z444 233 aa7.74□□□□□ -1.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa7.73□□□□□ -1.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DPM2O94777 84 aa7.73□□□□□ -1.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa7.73□□□□□ -1.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VCX2Q9H322 139 aa7.73□□□□□ -1.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 F8VRH5 84 aa7.72□□□□□ -1.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGKCP01834 107 aa7.72□□□□□ -1.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 M0R143 59 aa7.71□□□□□ -1.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC25A34Q6PIV7 304 aa7.71□□□□□ -1.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGIPA6NJ69 53 aa7.7□□□□□ -1.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLNP26678 52 aa7.7□□□□□ -1.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CXCL5P42830 114 aa7.7□□□□□ -1.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HERVK_113P63121 156 aa7.7□□□□□ -1.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CTAG1AP78358 180 aa7.7□□□□□ -1.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TIMM17AQ99595 171 aa7.7□□□□□ -1.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa7.7□□□□□ -1.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COX8AP10176 69 aa7.69□□□□□ -1.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SEC11AP67812 179 aa7.69□□□□□ -1.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LINC00167Q96N53 147 aa7.69□□□□□ -1.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPL37AP8A6NKH3 93 aa7.68□□□□□ -1.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa7.68□□□□□ -1.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RETNLBQ9BQ08 111 aa7.68□□□□□ -1.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SNHG12Q9BXW3 62 aa7.68□□□□□ -1.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANAPC11Q9NYG5 84 aa7.68□□□□□ -1.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PMVKQ15126 192 aa7.68□□□□□ -1.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa7.67□□□□□ -1.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GAGE10A6NGK3 116 aa7.66□□□□□ -1.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SMIM1B2RUZ4 78 aa7.66□□□□□ -1.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NMUP48645 174 aa7.66□□□□□ -1.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM229BQ4G0N7 80 aa7.66□□□□□ -1.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LINC00304Q8N9R0 145 aa7.66□□□□□ -1.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CST9LQ9H4G1 147 aa7.66□□□□□ -1.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa7.65□□□□□ -1.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DLEU1O43261 78 aa7.65□□□□□ -1.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UBE2AP49459 152 aa7.65□□□□□ -1.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TPRXLQ17RH7 258 aa7.65□□□□□ -1.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BOD1L2Q8IYS8 172 aa7.65□□□□□ -1.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa7.64□□□□□ -1.19
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BATFQ16520 125 aa7.64□□□□□ -1.19
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COX7B2Q8TF08 81 aa7.64□□□□□ -1.19
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NKAPP1Q8N9T2 125 aa7.63□□□□□ -1.19
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCP2Q8IVA1 136 aa7.62□□□□□ -1.19
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa7.62□□□□□ -1.19
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa7.62□□□□□ -1.19
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HERVK_113P61574 105 aa7.62□□□□□ -1.19
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa7.62□□□□□ -1.19
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C2orf91Q6ZV80 131 aa7.62□□□□□ -1.19
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa7.61□□□□□ -1.19
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa7.61□□□□□ -1.19
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa7.61□□□□□ -1.19
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C11orf86A6NJI1 115 aa7.61□□□□□ -1.19
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGKV2D-28P01615 120 aa7.61□□□□□ -1.19
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 E9PLD3 99 aa7.6□□□□□ -1.19
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRLHP81277 87 aa7.6□□□□□ -1.19
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPINK8P0C7L1 97 aa7.59□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms