RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 IGLV1-51P01701 117 aa6.27□□□□□ -1.4
PTPRM-202ENST00000400053 C1orf134Q5TEV5 83 aa6.27□□□□□ -1.4
PTPRM-202ENST00000400053 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.27□□□□□ -1.4
PTPRM-202ENST00000400053 VPREB1P12018 145 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-202ENST00000400053 CRYGAP11844 174 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-202ENST00000400053 ACYP2P14621 99 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-202ENST00000400053 H3BPC8 53 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-202ENST00000400053 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-202ENST00000400053 LINC01546A6NGU7 62 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-202ENST00000400053 PRO0628Q9UI54 55 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-202ENST00000400053 PTPRBP23467 1997 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP10-9P60411 292 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRM-202ENST00000400053 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRM-202ENST00000400053 ACANP16112 2415 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRM-202ENST00000400053 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRM-202ENST00000400053 FHL2Q14192 279 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRM-202ENST00000400053 Q6ZTC4 211 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRM-202ENST00000400053 CHD9Q3L8U1 2897 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRM-202ENST00000400053 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRM-202ENST00000400053 LINC00315P59091 139 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRM-202ENST00000400053 C4orf26Q17RF5 130 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRM-202ENST00000400053 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRM-202ENST00000400053 IGKV2-30P06310 120 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRM-202ENST00000400053 PLA2G2AP14555 144 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRM-202ENST00000400053 SBSPONQ8IVN8 264 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRM-202ENST00000400053 C5orf42Q9H799 3197 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRM-202ENST00000400053 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRM-202ENST00000400053 RETNLBQ9BQ08 111 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRM-202ENST00000400053 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRM-202ENST00000400053 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRM-202ENST00000400053 SMCR5Q8TEV8 140 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRM-202ENST00000400053 CDH23Q9H251 3354 aa6.21□□□□□ -1.41
PTPRM-202ENST00000400053 FAM19A4Q96LR4 140 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRM-202ENST00000400053 KLK9Q2XQG4 91 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRM-202ENST00000400053 C16orf95Q9H693 158 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRM-202ENST00000400053 Q9UF83 564 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRM-202ENST00000400053 FASNP49327 2511 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRM-202ENST00000400053 UNC80Q8N2C7 3258 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRM-202ENST00000400053 PRLHP81277 87 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRM-202ENST00000400053 LYPD5Q6UWN5 251 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRM-202ENST00000400053 C8orf87E5RJ46 101 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRM-202ENST00000400053 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRM-202ENST00000400053 C22orf24Q9Y442 160 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRM-202ENST00000400053 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
PTPRM-202ENST00000400053 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRM-202ENST00000400053 Q6ZRU5 148 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRM-202ENST00000400053 SPATA3Q8NHX4 192 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRM-202ENST00000400053 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRM-202ENST00000400053 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
PTPRM-202ENST00000400053 USP34Q70CQ2 3546 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRM-202ENST00000400053 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
PTPRM-202ENST00000400053 USP24Q9UPU5 2620 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRM-202ENST00000400053 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
PTPRM-202ENST00000400053 C11orf72Q8NBR9 251 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRM-202ENST00000400053 SMIM29Q86T20 159 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRM-202ENST00000400053 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.43
PTPRM-202ENST00000400053 TRANK1O15050 2925 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRM-202ENST00000400053 FHL3Q13643 280 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRM-202ENST00000400053 KIAA0087Q14695 138 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRM-202ENST00000400053 SPACA4Q8TDM5 124 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRM-202ENST00000400053 TRAV22A0A0B4J277 110 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRM-202ENST00000400053 SPINT4Q6UDR6 99 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRM-202ENST00000400053 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRM-202ENST00000400053 Q8NBF4 154 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRM-202ENST00000400053 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRM-202ENST00000400053 SMR3AQ99954 134 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRM-202ENST00000400053 FAM229AH3BQW9 127 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRM-202ENST00000400053 MOBPQ13875 183 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRM-202ENST00000400053 TM2D3Q9BRN9 247 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRM-202ENST00000400053 H3BNG1 76 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRM-202ENST00000400053 LINC00313P59037 77 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRM-202ENST00000400053 XIRP2A4UGR9 3374 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRM-202ENST00000400053 LINC00167Q96N53 147 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRM-202ENST00000400053 EYSQ5T1H1 3165 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRM-202ENST00000400053 LITAFQ99732 161 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRM-202ENST00000400053 REV3LO60673 3130 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRM-202ENST00000400053 Q6ZQT0 140 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRM-202ENST00000400053 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRM-202ENST00000400053 EPG5Q9HCE0 2579 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRM-202ENST00000400053 DNAH14Q0VDD8 3507 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRM-202ENST00000400053 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.09□□□□□ -1.44
PTPRM-202ENST00000400053 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.44
PTPRM-202ENST00000400053 Q6ZRP5 223 aa6.09□□□□□ -1.44
PTPRM-202ENST00000400053 SZT2Q5T011 3432 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRM-202ENST00000400053 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRM-202ENST00000400053 A0A0C4DFX4 3053 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRM-202ENST00000400053 VCANP13611 3396 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRM-202ENST00000400053 CRIPTQ9P021 101 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRM-202ENST00000400053 TYMSOSQ8TAI1 123 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRM-202ENST00000400053 UQCR11O14957 56 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRM-202ENST00000400053 Q6ZRX8 168 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRM-202ENST00000400053 MDFIQ99750 246 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRM-202ENST00000400053 LINC00476Q8WZB0 136 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-202ENST00000400053 LINC01600Q96MT4 127 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-202ENST00000400053 ERC2-IT1O76042 136 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-202ENST00000400053 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRM-202ENST00000400053 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-202ENST00000400053 MGAM2Q2M2H8 2515 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-202ENST00000400053 ATRQ13535 2644 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-202ENST00000400053 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa6.03□□□□□ -1.44
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