RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395211.6

TMOD1-203, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,259 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-203ENST00000395211 H3BS24 57 aa6.5□□□□□ -1.37
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
TMOD1-203ENST00000395211 IGLV1-40P01703 118 aa6.5□□□□□ -1.37
TMOD1-203ENST00000395211 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.5□□□□□ -1.37
TMOD1-203ENST00000395211 SLURP1P55000 103 aa6.49□□□□□ -1.37
TMOD1-203ENST00000395211 ADORA2A-AS1P86434 159 aa6.49□□□□□ -1.37
TMOD1-203ENST00000395211 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
TMOD1-203ENST00000395211 COX7BP24311 80 aa6.49□□□□□ -1.37
TMOD1-203ENST00000395211 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa6.49□□□□□ -1.37
TMOD1-203ENST00000395211 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.49□□□□□ -1.37
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TMOD1-203ENST00000395211 LYRM9A8MSI8 78 aa6.48□□□□□ -1.37
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TMOD1-203ENST00000395211 SPTBN4Q9H254 2564 aa6.48□□□□□ -1.37
TMOD1-203ENST00000395211 Q8IZM0 81 aa6.47□□□□□ -1.37
TMOD1-203ENST00000395211 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.47□□□□□ -1.37
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TMOD1-203ENST00000395211 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.46□□□□□ -1.37
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TMOD1-203ENST00000395211 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
TMOD1-203ENST00000395211 A6NDX4 124 aa6.45□□□□□ -1.38
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TMOD1-203ENST00000395211 C11orf71Q6IPW1 123 aa6.44□□□□□ -1.38
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TMOD1-203ENST00000395211 IGHV4-31P0DP07 118 aa6.42□□□□□ -1.38
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TMOD1-203ENST00000395211 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.4□□□□□ -1.38
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TMOD1-203ENST00000395211 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
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TMOD1-203ENST00000395211 USP24Q9UPU5 2620 aa6.38□□□□□ -1.39
TMOD1-203ENST00000395211 NCOR2Q9Y618 2525 aa6.38□□□□□ -1.39
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TMOD1-203ENST00000395211 MP68P56378 58 aa6.37□□□□□ -1.39
TMOD1-203ENST00000395211 PRAC1Q96KF2 57 aa6.37□□□□□ -1.39
TMOD1-203ENST00000395211 K7EQZ3 153 aa6.37□□□□□ -1.39
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TMOD1-203ENST00000395211 WFDC10BQ8IUB3 73 aa6.37□□□□□ -1.39
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TMOD1-203ENST00000395211 CCL24O00175 119 aa6.35□□□□□ -1.39
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TMOD1-203ENST00000395211 REG3AQ06141 175 aa6.33□□□□□ -1.4
TMOD1-203ENST00000395211 VPS13CQ709C8 3753 aa6.33□□□□□ -1.4
TMOD1-203ENST00000395211 MOBPQ13875 183 aa6.33□□□□□ -1.4
TMOD1-203ENST00000395211 DEFB114Q30KQ6 69 aa6.33□□□□□ -1.4
TMOD1-203ENST00000395211 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
TMOD1-203ENST00000395211 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa6.32□□□□□ -1.4
TMOD1-203ENST00000395211 LCE6AA0A183 80 aa6.32□□□□□ -1.4
TMOD1-203ENST00000395211 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.32□□□□□ -1.4
TMOD1-203ENST00000395211 C16orf74Q96GX8 76 aa6.31□□□□□ -1.4
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF462Q96JM2 2506 aa6.31□□□□□ -1.4
TMOD1-203ENST00000395211 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa6.31□□□□□ -1.4
TMOD1-203ENST00000395211 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa6.31□□□□□ -1.4
TMOD1-203ENST00000395211 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.31□□□□□ -1.4
TMOD1-203ENST00000395211 PKD1L2Q7Z442 2459 aa6.31□□□□□ -1.4
TMOD1-203ENST00000395211 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
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