RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384664.1

RNU6-1060P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1060, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1060P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1060P-201ENST00000384664 hADV29S1A0JD25 119 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-1060P-201ENST00000384664 CUX1P39880 1505 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-1060P-201ENST00000384664 MON2Q7Z3U7 1717 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-1060P-201ENST00000384664 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-1060P-201ENST00000384664 A0A1B0GV90 55 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1060P-201ENST00000384664 ARMS2P0C7Q2 107 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1060P-201ENST00000384664 CLIP1P30622 1438 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1060P-201ENST00000384664 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1060P-201ENST00000384664 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1060P-201ENST00000384664 UBR4Q5T4S7 5183 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1060P-201ENST00000384664 BCORQ6W2J9 1755 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-1060P-201ENST00000384664 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-1060P-201ENST00000384664 C5P01031 1676 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-1060P-201ENST00000384664 ABCC5O15440 1437 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-1060P-201ENST00000384664 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-1060P-201ENST00000384664 H0YGG7 62 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-1060P-201ENST00000384664 GNGT1P63211 74 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-1060P-201ENST00000384664 HEPN1Q6WQI6 88 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-1060P-201ENST00000384664 WFDC13Q8IUB5 93 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-1060P-201ENST00000384664 HIGD1BQ9P298 99 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-1060P-201ENST00000384664 CACFD1Q9UGQ2 172 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-1060P-201ENST00000384664 SAMD9Q5K651 1589 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-1060P-201ENST00000384664 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-1060P-201ENST00000384664 REV3LO60673 3130 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-1060P-201ENST00000384664 RGPD2P0DJD1 1756 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-1060P-201ENST00000384664 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-1060P-201ENST00000384664 PSMG4Q5JS54 123 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-1060P-201ENST00000384664 EPG5Q9HCE0 2579 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-1060P-201ENST00000384664 SPG11Q96JI7 2443 aa-1.57□□□□□ -2.66
RNU6-1060P-201ENST00000384664 KNL1Q8NG31 2342 aa-1.57□□□□□ -2.66
RNU6-1060P-201ENST00000384664 MUC17Q685J3 4493 aa-1.57□□□□□ -2.66
RNU6-1060P-201ENST00000384664 NDUFC1O43677 76 aa-1.57□□□□□ -2.66
RNU6-1060P-201ENST00000384664 S100A1P23297 94 aa-1.57□□□□□ -2.66
RNU6-1060P-201ENST00000384664 ASIPP42127 132 aa-1.57□□□□□ -2.66
RNU6-1060P-201ENST00000384664 KIF20BQ96Q89 1820 aa-1.57□□□□□ -2.66
RNU6-1060P-201ENST00000384664 MLH3Q9UHC1 1453 aa-1.57□□□□□ -2.66
RNU6-1060P-201ENST00000384664 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-1060P-201ENST00000384664 PMCHL1Q16048 86 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-1060P-201ENST00000384664 TACC2O95359 2948 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-1060P-201ENST00000384664 HIVEP1P15822 2718 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-1060P-201ENST00000384664 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-1060P-201ENST00000384664 ABCC2Q92887 1545 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-1060P-201ENST00000384664 H7BZZ5 65 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-1060P-201ENST00000384664 DNAH9Q9NYC9 4486 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-1060P-201ENST00000384664 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-1060P-201ENST00000384664 MPC2O95563 127 aa-1.6□□□□□ -2.67
RNU6-1060P-201ENST00000384664 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP-1.6□□□□□ -2.67
RNU6-1060P-201ENST00000384664 C2orf88Q9BSF0 95 aa-1.6□□□□□ -2.67
RNU6-1060P-201ENST00000384664 LYSTQ99698 3801 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-1060P-201ENST00000384664 AKAP13Q12802 2813 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-1060P-201ENST00000384664 HTTP42858 3142 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-1060P-201ENST00000384664 TMEM203Q969S6 136 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-1060P-201ENST00000384664 GNG8Q9UK08 70 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-1060P-201ENST00000384664 FAM135AQ9P2D6 1515 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-1060P-201ENST00000384664 QSER1Q2KHR3 1735 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1060P-201ENST00000384664 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1060P-201ENST00000384664 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1060P-201ENST00000384664 TRGV9Q99603 122 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1060P-201ENST00000384664 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1060P-201ENST00000384664 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1060P-201ENST00000384664 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1060P-201ENST00000384664 VPS13DQ5THJ4 4388 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1060P-201ENST00000384664 DNAH3Q8TD57 4116 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1060P-201ENST00000384664 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1060P-201ENST00000384664 UQCRHP07919 91 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1060P-201ENST00000384664 NRXN1Q9ULB1 1477 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1060P-201ENST00000384664 PREX1Q8TCU6 1659 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1060P-201ENST00000384664 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP-1.65□□□□□ -2.67
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RNU6-1060P-201ENST00000384664 LAMA1P25391 3075 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1060P-201ENST00000384664 AKAP9Q99996 3911 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-1060P-201ENST00000384664 GNGT2O14610 69 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-1060P-201ENST00000384664 AP4S1Q9Y587 144 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-1060P-201ENST00000384664 CUBNO60494 3623 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-1060P-201ENST00000384664 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-1060P-201ENST00000384664 TRANK1O15050 2925 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-1060P-201ENST00000384664 HMGN3Q15651 99 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-1060P-201ENST00000384664 NMSQ5H8A3 153 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-1060P-201ENST00000384664 PSENENQ9NZ42 101 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-1060P-201ENST00000384664 PKD1L3Q7Z443 1732 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-1060P-201ENST00000384664 LINC00587B1AMM8 73 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-1060P-201ENST00000384664 H3BNG1 76 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-1060P-201ENST00000384664 MAGI2Q86UL8 1455 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-1060P-201ENST00000384664 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-1060P-201ENST00000384664 RGPD5Q99666 1765 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-1060P-201ENST00000384664 IGLC2P0DOY2 106 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-1060P-201ENST00000384664 IGLC3P0DOY3 106 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-1060P-201ENST00000384664 ALKAL2Q6UX46 152 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-1060P-201ENST00000384664 COX6B2Q6YFQ2 88 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-1060P-201ENST00000384664 C4AP0C0L4 1744 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-1060P-201ENST00000384664 C4BP0C0L5 1744 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-1060P-201ENST00000384664 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-1060P-201ENST00000384664 UBR3Q6ZT12 1888 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-1060P-201ENST00000384664 SERP2Q8N6R1 65 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-1060P-201ENST00000384664 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa-1.71□□□□□ -2.68
RNU6-1060P-201ENST00000384664 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP-1.71□□□□□ -2.68
RNU6-1060P-201ENST00000384664 C9orf92A6NGG3 77 aa-1.71□□□□□ -2.68
RNU6-1060P-201ENST00000384664 ATOX1O00244 68 aa-1.71□□□□□ -2.68
RNU6-1060P-201ENST00000384664 ZZEF1O43149 2961 aa-1.72□□□□□ -2.68
RNU6-1060P-201ENST00000384664 C20orf202A1L168 122 aa-1.72□□□□□ -2.68
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