RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366197.9

ZNF548-202, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF548, Length 4,955 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-202ENST00000366197 Q6ZVQ6 151 aa7.17□□□□□ -1.26
ZNF548-202ENST00000366197 X6R8D5 127 aa7.17□□□□□ -1.26
ZNF548-202ENST00000366197 H3BNG1 76 aa7.17□□□□□ -1.26
ZNF548-202ENST00000366197 SBSPONQ8IVN8 264 aa7.17□□□□□ -1.26
ZNF548-202ENST00000366197 LAMA3Q16787 3333 aa7.16□□□□□ -1.26
ZNF548-202ENST00000366197 HTTP42858 3142 aa7.16□□□□□ -1.26
ZNF548-202ENST00000366197 TRAV7A0A075B6U4 112 aa7.16□□□□□ -1.26
ZNF548-202ENST00000366197 Q8N3U1 123 aa7.15□□□□□ -1.26
ZNF548-202ENST00000366197 SMCR5Q8TEV8 140 aa7.15□□□□□ -1.26
ZNF548-202ENST00000366197 Q6Q795 121 aa7.15□□□□□ -1.27
ZNF548-202ENST00000366197 A0A087WVE0 104 aa7.15□□□□□ -1.27
ZNF548-202ENST00000366197 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
ZNF548-202ENST00000366197 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
ZNF548-202ENST00000366197 CHD9Q3L8U1 2897 aa7.12□□□□□ -1.27
ZNF548-202ENST00000366197 A6NED7 52 aa7.12□□□□□ -1.27
ZNF548-202ENST00000366197 Q9UF83 564 aa7.12□□□□□ -1.27
ZNF548-202ENST00000366197 DEFB116Q30KQ4 102 aa7.11□□□□□ -1.27
ZNF548-202ENST00000366197 ZNF292O60281 2723 aa7.11□□□□□ -1.27
ZNF548-202ENST00000366197 LINC00167Q96N53 147 aa7.11□□□□□ -1.27
ZNF548-202ENST00000366197 LIMD2Q9BT23 127 aa7.11□□□□□ -1.27
ZNF548-202ENST00000366197 CCDC179H3BU77 68 aa7.11□□□□□ -1.27
ZNF548-202ENST00000366197 C6orf48Q9UBA6 75 aa7.11□□□□□ -1.27
ZNF548-202ENST00000366197 LINC01546A6NGU7 62 aa7.1□□□□□ -1.27
ZNF548-202ENST00000366197 Q8NAQ8 132 aa7.1□□□□□ -1.27
ZNF548-202ENST00000366197 ITPR3Q14573 2671 aa7.1□□□□□ -1.27
ZNF548-202ENST00000366197 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa7.09□□□□□ -1.27
ZNF548-202ENST00000366197 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
ZNF548-202ENST00000366197 BAHCC1Q9P281 2608 aa7.09□□□□□ -1.27
ZNF548-202ENST00000366197 LINC00846Q9NV44 126 aa7.09□□□□□ -1.27
ZNF548-202ENST00000366197 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa7.08□□□□□ -1.28
ZNF548-202ENST00000366197 KLK9Q2XQG4 91 aa7.08□□□□□ -1.28
ZNF548-202ENST00000366197 KIAA0087Q14695 138 aa7.08□□□□□ -1.28
ZNF548-202ENST00000366197 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa7.07□□□□□ -1.28
ZNF548-202ENST00000366197 STAB1Q9NY15 2570 aa7.07□□□□□ -1.28
ZNF548-202ENST00000366197 C5orf42Q9H799 3197 aa7.07□□□□□ -1.28
ZNF548-202ENST00000366197 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
ZNF548-202ENST00000366197 RETNLBQ9BQ08 111 aa7.07□□□□□ -1.28
ZNF548-202ENST00000366197 PCOTHQ58A44 107 aa7.07□□□□□ -1.28
ZNF548-202ENST00000366197 BRCA2P51587 3418 aa7.06□□□□□ -1.28
ZNF548-202ENST00000366197 SMIM26A0A096LP01 95 aa7.06□□□□□ -1.28
ZNF548-202ENST00000366197 LINC00588Q9Y4M8 146 aa7.06□□□□□ -1.28
ZNF548-202ENST00000366197 HCG22E2RYF7 251 aa7.05□□□□□ -1.28
ZNF548-202ENST00000366197 H0Y9P7 68 aa7.05□□□□□ -1.28
ZNF548-202ENST00000366197 A0A0U1RQV1 116 aa7.05□□□□□ -1.28
ZNF548-202ENST00000366197 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa7.04□□□□□ -1.28
ZNF548-202ENST00000366197 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa7.04□□□□□ -1.28
ZNF548-202ENST00000366197 MOBPQ13875 183 aa7.03□□□□□ -1.28
ZNF548-202ENST00000366197 SPACA4Q8TDM5 124 aa7.03□□□□□ -1.28
ZNF548-202ENST00000366197 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa7.03□□□□□ -1.28
ZNF548-202ENST00000366197 SPATA3Q8NHX4 192 aa7.03□□□□□ -1.28
ZNF548-202ENST00000366197 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa7.03□□□□□ -1.28
ZNF548-202ENST00000366197 TMEM254Q8TBM7 123 aa7.02□□□□□ -1.28
ZNF548-202ENST00000366197 SPINK1P00995 79 aa7.02□□□□□ -1.29
ZNF548-202ENST00000366197 RTL8CO15255 209 aa7.02□□□□□ -1.29
ZNF548-202ENST00000366197 FAM229AH3BQW9 127 aa7.01□□□□□ -1.29
ZNF548-202ENST00000366197 CXCL6P80162 114 aa7.01□□□□□ -1.29
ZNF548-202ENST00000366197 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
ZNF548-202ENST00000366197 CRYGAP11844 174 aa7.01□□□□□ -1.29
ZNF548-202ENST00000366197 C16orf90A8MZG2 172 aa7.01□□□□□ -1.29
ZNF548-202ENST00000366197 PCSK5Q92824 1860 aa7□□□□□ -1.29
ZNF548-202ENST00000366197 Q6ZRP5 223 aa7□□□□□ -1.29
ZNF548-202ENST00000366197 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
ZNF548-202ENST00000366197 DNAH10OSP0CZ25 163 aa7□□□□□ -1.29
ZNF548-202ENST00000366197 Q6ZRX8 168 aa7□□□□□ -1.29
ZNF548-202ENST00000366197 AKAP13Q12802 2813 aa6.99□□□□□ -1.29
ZNF548-202ENST00000366197 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.99□□□□□ -1.29
ZNF548-202ENST00000366197 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
ZNF548-202ENST00000366197 IGKV2-30P06310 120 aa6.99□□□□□ -1.29
ZNF548-202ENST00000366197 A0A1B0GW54 56 aa6.99□□□□□ -1.29
ZNF548-202ENST00000366197 hDV103S1A0JD37 113 aa6.99□□□□□ -1.29
ZNF548-202ENST00000366197 A0A096LNT2 108 aa6.98□□□□□ -1.29
ZNF548-202ENST00000366197 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.98□□□□□ -1.29
ZNF548-202ENST00000366197 EPM2AB3EWF7 344 aa6.97□□□□□ -1.29
ZNF548-202ENST00000366197 Q8NBF4 154 aa6.97□□□□□ -1.29
ZNF548-202ENST00000366197 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa6.97□□□□□ -1.29
ZNF548-202ENST00000366197 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.97□□□□□ -1.29
ZNF548-202ENST00000366197 CHTF8P0CG12 524 aa6.96□□□□□ -1.29
ZNF548-202ENST00000366197 CHD6Q8TD26 2715 aa6.96□□□□□ -1.3
ZNF548-202ENST00000366197 K7EIL1 84 aa6.96□□□□□ -1.3
ZNF548-202ENST00000366197 LINC00476Q8WZB0 136 aa6.96□□□□□ -1.3
ZNF548-202ENST00000366197 TRANK1O15050 2925 aa6.95□□□□□ -1.3
ZNF548-202ENST00000366197 TYMSOSQ8TAI1 123 aa6.95□□□□□ -1.3
ZNF548-202ENST00000366197 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa6.95□□□□□ -1.3
ZNF548-202ENST00000366197 DSPP15924 2871 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
ZNF548-202ENST00000366197 SMIM29Q86T20 159 aa6.94□□□□□ -1.3
ZNF548-202ENST00000366197 BCE1O60756 84 aa6.93□□□□□ -1.3
ZNF548-202ENST00000366197 CDIP1Q9H305 208 aa6.93□□□□□ -1.3
ZNF548-202ENST00000366197 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
ZNF548-202ENST00000366197 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.92□□□□□ -1.3
ZNF548-202ENST00000366197 MGAQ8IWI9 3026 aa6.92□□□□□ -1.3
ZNF548-202ENST00000366197 VPREB1P12018 145 aa6.92□□□□□ -1.3
ZNF548-202ENST00000366197 C19orf73Q9NVV2 129 aa6.92□□□□□ -1.3
ZNF548-202ENST00000366197 COL6A5A8TX70 2615 aa6.91□□□□□ -1.3
ZNF548-202ENST00000366197 KRTAP10-11P60412 298 aa6.91□□□□□ -1.3
ZNF548-202ENST00000366197 Q6ZQT0 140 aa6.91□□□□□ -1.3
ZNF548-202ENST00000366197 PSPHP1O15172 72 aa6.9□□□□□ -1.31
ZNF548-202ENST00000366197 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.89□□□□□ -1.31
ZNF548-202ENST00000366197 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa6.89□□□□□ -1.31
ZNF548-202ENST00000366197 UNC79Q9P2D8 2635 aa6.89□□□□□ -1.31
ZNF548-202ENST00000366197 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms