RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 HERC2O95714 4834 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 PMCHL1Q16048 86 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRANK1O15050 2925 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 LRRC37AA6NMS7 1700 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 LINC00587B1AMM8 73 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 ASIPP42127 132 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 STARD9Q9P2P6 4700 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 HEPN1Q6WQI6 88 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 MLH3Q9UHC1 1453 aa-0.91□□□□□ -2.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 USH2AO75445 5202 aa-0.91□□□□□ -2.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 CHD1O14646 1710 aa-0.91□□□□□ -2.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 MPC2O95563 127 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRGV9Q99603 122 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 HIVEP1P15822 2718 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 CLIP1P30622 1438 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 KNDC1Q76NI1 1749 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 PTPN23Q9H3S7 1636 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 UBR4Q5T4S7 5183 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 FASNP49327 2511 aaKnown RBP-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 H7BZZ5 65 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 GNGT2O14610 69 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 MT4P47944 62 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 LELP1Q5T871 98 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 HIGD1BQ9P298 99 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM135AQ9P2D6 1515 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 C20orf202A1L168 122 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 UQCRHP07919 91 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 WFDC13Q8IUB5 93 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 ADAMTS12P58397 1594 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 SHPRHQ149N8 1683 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 H0YGG7 62 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 SARNPP82979 210 aaKnown RBP-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 ABCC2Q92887 1545 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 HTTP42858 3142 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANKRD36A6QL64 1941 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 SAMD9Q5K651 1589 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 DNAH9Q9NYC9 4486 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 CUX1P39880 1505 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 ITPR3Q14573 2671 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 HMGN3Q15651 99 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 SERP2Q8N6R1 65 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPRR2FQ96RM1 72 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 AP4S1Q9Y587 144 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 MYO18BQ8IUG5 2567 aa-0.97□□□□□ -2.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAT3Q8TDW7 4589 aa-0.97□□□□□ -2.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 NRXN1Q9ULB1 1477 aa-0.97□□□□□ -2.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 ATOX1O00244 68 aa-0.97□□□□□ -2.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 ALKAL2Q6UX46 152 aa-0.97□□□□□ -2.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 PMCHL2Q9BQD1 86 aa-0.97□□□□□ -2.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 PSENENQ9NZ42 101 aa-0.97□□□□□ -2.56
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa-0.97□□□□□ -2.57
RNU6-552P-201ENST00000362869 AKAP9Q99996 3911 aa-0.97□□□□□ -2.57
RNU6-552P-201ENST00000362869 ABCA3Q99758 1704 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-552P-201ENST00000362869 MT-ATP8P03928 68 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGLC2P0DOY2 106 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGLC3P0DOY3 106 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-552P-201ENST00000362869 VPS13DQ5THJ4 4388 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-552P-201ENST00000362869 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM218A2RU14 115 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-552P-201ENST00000362869 MT1AP04731 61 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-552P-201ENST00000362869 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZZEF1O43149 2961 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-552P-201ENST00000362869 LYSTQ99698 3801 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-552P-201ENST00000362869 MON2Q7Z3U7 1717 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-552P-201ENST00000362869 D6R8Y8 96 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-552P-201ENST00000362869 ETDBQ3ZM63 59 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-552P-201ENST00000362869 NMSQ5H8A3 153 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-552P-201ENST00000362869 MUSTN1Q8IVN3 82 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-552P-201ENST00000362869 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-552P-201ENST00000362869 C5P01031 1676 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-552P-201ENST00000362869 DNAH3Q8TD57 4116 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-552P-201ENST00000362869 LEPROTL1O95214 131 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF720Q7Z2F6 126 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-552P-201ENST00000362869 MUC17Q685J3 4493 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-552P-201ENST00000362869 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-552P-201ENST00000362869 COX6B2Q6YFQ2 88 aa-1.02□□□□□ -2.57
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAGI2Q86UL8 1455 aa-1.02□□□□□ -2.57
RNU6-552P-201ENST00000362869 NEBP20929 6669 aa-1.02□□□□□ -2.57
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP-1.02□□□□□ -2.57
RNU6-552P-201ENST00000362869 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP-1.03□□□□□ -2.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.9 ms