RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261443.9

CSDE1-201, Transcript of cold shock domain containing E1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CSDE1, Length 3,228 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1-201ENST00000261443 COX17Q14061 63 aa4.96□□□□□ -1.62
CSDE1-201ENST00000261443 SPATA3Q8NHX4 192 aa4.96□□□□□ -1.62
CSDE1-201ENST00000261443 ZNF702PQ9H963 129 aa4.96□□□□□ -1.62
CSDE1-201ENST00000261443 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa4.96□□□□□ -1.62
CSDE1-201ENST00000261443 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CSDE1-201ENST00000261443 B4DSR2 109 aa4.95□□□□□ -1.62
CSDE1-201ENST00000261443 GNLYP22749 145 aa4.95□□□□□ -1.62
CSDE1-201ENST00000261443 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CSDE1-201ENST00000261443 Q8NDZ9 215 aa4.95□□□□□ -1.62
CSDE1-201ENST00000261443 ERC2-IT1O76042 136 aa4.95□□□□□ -1.62
CSDE1-201ENST00000261443 ESRGQ1W209 222 aa4.95□□□□□ -1.62
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CSDE1-201ENST00000261443 PRYO14603 147 aa4.95□□□□□ -1.62
CSDE1-201ENST00000261443 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP4.95□□□□□ -1.622e-9■□□□□ 9
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CSDE1-201ENST00000261443 H3BQ85 93 aa4.94□□□□□ -1.62
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CSDE1-201ENST00000261443 C4orf3Q8WVX3 66 aa4.93□□□□□ -1.62
CSDE1-201ENST00000261443 Q8N9L7 120 aa4.92□□□□□ -1.62
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CSDE1-201ENST00000261443 DAD1P61803 113 aa4.91□□□□□ -1.62
CSDE1-201ENST00000261443 HIGD2AQ9BW72 106 aa4.91□□□□□ -1.62
CSDE1-201ENST00000261443 OCR1Q9BZK8 76 aa4.91□□□□□ -1.62
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CSDE1-201ENST00000261443 IGLV6-57P01721 117 aa4.9□□□□□ -1.62
CSDE1-201ENST00000261443 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.62
CSDE1-201ENST00000261443 CD164L2Q6UWJ8 174 aa4.9□□□□□ -1.62
CSDE1-201ENST00000261443 IGKV4-1P06312 121 aa4.9□□□□□ -1.63
CSDE1-201ENST00000261443 HECTD1Q9ULT8 2610 aa4.89□□□□□ -1.63
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CSDE1-201ENST00000261443 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
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CSDE1-201ENST00000261443 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CSDE1-201ENST00000261443 DIRC1Q969H9 104 aa4.89□□□□□ -1.63
CSDE1-201ENST00000261443 A0A096LPF7 62 aa4.89□□□□□ -1.63
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CSDE1-201ENST00000261443 hDV103S1A0JD37 113 aa4.87□□□□□ -1.63
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CSDE1-201ENST00000261443 REG3AQ06141 175 aa4.86□□□□□ -1.63
CSDE1-201ENST00000261443 SPAG11BQ08648 103 aa4.86□□□□□ -1.63
CSDE1-201ENST00000261443 FAM30AQ9NZY2 134 aa4.86□□□□□ -1.63
CSDE1-201ENST00000261443 CYSRT1A8MQ03 144 aa4.85□□□□□ -1.63
CSDE1-201ENST00000261443 Q6ZRU5 148 aa4.85□□□□□ -1.63
CSDE1-201ENST00000261443 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa4.85□□□□□ -1.63
CSDE1-201ENST00000261443 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
CSDE1-201ENST00000261443 Q1T7F1 81 aa4.85□□□□□ -1.63
CSDE1-201ENST00000261443 HIGD2BQ4VC39 106 aa4.85□□□□□ -1.63
CSDE1-201ENST00000261443 Q6ZRP5 223 aa4.85□□□□□ -1.63
CSDE1-201ENST00000261443 CELA1Q9UNI1 258 aa4.85□□□□□ -1.63
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CSDE1-201ENST00000261443 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
CSDE1-201ENST00000261443 C1orf64Q8NEQ6 169 aa4.85□□□□□ -1.63
CSDE1-201ENST00000261443 XAGE1AQ9HD64 81 aa4.85□□□□□ -1.63
CSDE1-201ENST00000261443 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
CSDE1-201ENST00000261443 KLK12Q9UKR0 248 aa4.84□□□□□ -1.63
CSDE1-201ENST00000261443 A0A0J9YWU9 116 aa4.84□□□□□ -1.63
CSDE1-201ENST00000261443 PSPHP1O15172 72 aa4.84□□□□□ -1.63
CSDE1-201ENST00000261443 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa4.84□□□□□ -1.63
CSDE1-201ENST00000261443 DSCR9P59020 149 aa4.84□□□□□ -1.63
CSDE1-201ENST00000261443 SMIM29Q86T20 159 aa4.84□□□□□ -1.63
CSDE1-201ENST00000261443 PRO0255Q9UI72 69 aa4.84□□□□□ -1.64
CSDE1-201ENST00000261443 LINC00612Q8N6U2 182 aa4.83□□□□□ -1.64
CSDE1-201ENST00000261443 FSHBP01225 129 aa4.82□□□□□ -1.64
CSDE1-201ENST00000261443 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
CSDE1-201ENST00000261443 TRAV22A0A0B4J277 110 aa4.81□□□□□ -1.64
CSDE1-201ENST00000261443 KRTAP10-9P60411 292 aa4.81□□□□□ -1.64
CSDE1-201ENST00000261443 C19orf73Q9NVV2 129 aa4.81□□□□□ -1.64
CSDE1-201ENST00000261443 ATRQ13535 2644 aa4.81□□□□□ -1.64
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