RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566882.5

CCNDBP1-210, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 2,746 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-210ENST00000566882 TRIAP1O43715 76 aa7.04□□□□□ -1.28
CCNDBP1-210ENST00000566882 TTC32Q5I0X7 151 aa7.04□□□□□ -1.28
CCNDBP1-210ENST00000566882 ANKRD29Q8N6D5 301 aa7.04□□□□□ -1.28
CCNDBP1-210ENST00000566882 CDIP1Q9H305 208 aa7.04□□□□□ -1.28
CCNDBP1-210ENST00000566882 NDUFA1O15239 70 aa7.03□□□□□ -1.28
CCNDBP1-210ENST00000566882 C3orf56Q8N813 242 aa7.03□□□□□ -1.28
CCNDBP1-210ENST00000566882 DNAH3Q8TD57 4116 aa7.03□□□□□ -1.28
CCNDBP1-210ENST00000566882 A0A0B4J2C4 111 aa7.03□□□□□ -1.28
CCNDBP1-210ENST00000566882 C4orf26Q17RF5 130 aa7.03□□□□□ -1.28
CCNDBP1-210ENST00000566882 C5orf38Q86SI9 138 aa7.03□□□□□ -1.28
CCNDBP1-210ENST00000566882 PRO0628Q9UI54 55 aa7.03□□□□□ -1.28
CCNDBP1-210ENST00000566882 MIAQ16674 131 aa7.02□□□□□ -1.29
CCNDBP1-210ENST00000566882 HRCT1Q6UXD1 115 aa7.02□□□□□ -1.29
CCNDBP1-210ENST00000566882 CLEC2BQ92478 149 aa7.02□□□□□ -1.29
CCNDBP1-210ENST00000566882 TOMM7Q9P0U1 55 aa7.02□□□□□ -1.29
CCNDBP1-210ENST00000566882 SLC25A20O43772 301 aa7.01□□□□□ -1.29
CCNDBP1-210ENST00000566882 H7C423 109 aa7.01□□□□□ -1.29
CCNDBP1-210ENST00000566882 IFITM1P13164 125 aa7.01□□□□□ -1.29
CCNDBP1-210ENST00000566882 MIFP14174 115 aa7.01□□□□□ -1.29
CCNDBP1-210ENST00000566882 MALP21145 153 aa7.01□□□□□ -1.29
CCNDBP1-210ENST00000566882 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa7.01□□□□□ -1.29
CCNDBP1-210ENST00000566882 SPANXDQ9BXN6 97 aa7.01□□□□□ -1.29
CCNDBP1-210ENST00000566882 SPANXCQ9NY87 97 aa7.01□□□□□ -1.29
CCNDBP1-210ENST00000566882 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa7□□□□□ -1.29
CCNDBP1-210ENST00000566882 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa7□□□□□ -1.29
CCNDBP1-210ENST00000566882 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CCNDBP1-210ENST00000566882 XCL1P47992 114 aa7□□□□□ -1.29
CCNDBP1-210ENST00000566882 TEN1Q86WV5 123 aa7□□□□□ -1.29
CCNDBP1-210ENST00000566882 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CCNDBP1-210ENST00000566882 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CCNDBP1-210ENST00000566882 ATP5G1P05496 136 aa6.99□□□□□ -1.29
CCNDBP1-210ENST00000566882 LYRM7Q5U5X0 104 aa6.99□□□□□ -1.29
CCNDBP1-210ENST00000566882 ICOSQ9Y6W8 199 aa6.99□□□□□ -1.29
CCNDBP1-210ENST00000566882 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa6.99□□□□□ -1.29
CCNDBP1-210ENST00000566882 SPART-AS1P0CW21 52 aa6.99□□□□□ -1.29
CCNDBP1-210ENST00000566882 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CCNDBP1-210ENST00000566882 GAGE2BQ13066 116 aa6.99□□□□□ -1.29
CCNDBP1-210ENST00000566882 GAGE2EQ4V326 116 aa6.99□□□□□ -1.29
CCNDBP1-210ENST00000566882 LINC00269Q8N2A0 174 aa6.99□□□□□ -1.29
CCNDBP1-210ENST00000566882 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.99□□□□□ -1.29
CCNDBP1-210ENST00000566882 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.98□□□□□ -1.29
CCNDBP1-210ENST00000566882 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CCNDBP1-210ENST00000566882 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa6.98□□□□□ -1.29
CCNDBP1-210ENST00000566882 A0A1B0GX51 115 aa6.98□□□□□ -1.29
CCNDBP1-210ENST00000566882 LINC01620Q4KN68 170 aa6.98□□□□□ -1.29
CCNDBP1-210ENST00000566882 COX7B2Q8TF08 81 aa6.98□□□□□ -1.29
CCNDBP1-210ENST00000566882 PPDPFLQ8WWR9 84 aa6.98□□□□□ -1.29
CCNDBP1-210ENST00000566882 TIMM17BO60830 172 aa6.97□□□□□ -1.29
CCNDBP1-210ENST00000566882 A0A087WZ39 114 aa6.96□□□□□ -1.29
CCNDBP1-210ENST00000566882 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.96□□□□□ -1.29
CCNDBP1-210ENST00000566882 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa6.96□□□□□ -1.29
CCNDBP1-210ENST00000566882 A0A1B0GUV1 79 aa6.96□□□□□ -1.3
CCNDBP1-210ENST00000566882 ANGP03950 147 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CCNDBP1-210ENST00000566882 ATXN8Q156A1 80 aa6.96□□□□□ -1.3
CCNDBP1-210ENST00000566882 C1orf195Q5TG92 126 aa6.95□□□□□ -1.3
CCNDBP1-210ENST00000566882 C2orf82Q6UX34 121 aa6.95□□□□□ -1.3
CCNDBP1-210ENST00000566882 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CCNDBP1-210ENST00000566882 Q6ZTC4 211 aa6.95□□□□□ -1.3
CCNDBP1-210ENST00000566882 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CCNDBP1-210ENST00000566882 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa6.94□□□□□ -1.3
CCNDBP1-210ENST00000566882 FAM236CP0DP71 79 aa6.94□□□□□ -1.3
CCNDBP1-210ENST00000566882 PFN2P35080 140 aa6.94□□□□□ -1.3
CCNDBP1-210ENST00000566882 COL7A1Q02388 2944 aa6.94□□□□□ -1.3
CCNDBP1-210ENST00000566882 MGAM2Q2M2H8 2515 aa6.93□□□□□ -1.3
CCNDBP1-210ENST00000566882 SS18Q15532 418 aa6.93□□□□□ -1.3
CCNDBP1-210ENST00000566882 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.93□□□□□ -1.3
CCNDBP1-210ENST00000566882 A0A0J9YWU9 116 aa6.93□□□□□ -1.3
CCNDBP1-210ENST00000566882 REG3AQ06141 175 aa6.93□□□□□ -1.3
CCNDBP1-210ENST00000566882 LINC00336Q6ZUF6 198 aa6.92□□□□□ -1.3
CCNDBP1-210ENST00000566882 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CCNDBP1-210ENST00000566882 SNCGO76070 127 aa6.92□□□□□ -1.3
CCNDBP1-210ENST00000566882 LINC00158P58513 81 aa6.92□□□□□ -1.3
CCNDBP1-210ENST00000566882 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CCNDBP1-210ENST00000566882 LYPD5Q6UWN5 251 aa6.92□□□□□ -1.3
CCNDBP1-210ENST00000566882 LINC00526Q96FQ7 95 aa6.92□□□□□ -1.3
CCNDBP1-210ENST00000566882 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.92□□□□□ -1.3
CCNDBP1-210ENST00000566882 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa6.91□□□□□ -1.3
CCNDBP1-210ENST00000566882 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa6.91□□□□□ -1.3
CCNDBP1-210ENST00000566882 KLK12Q9UKR0 248 aa6.91□□□□□ -1.3
CCNDBP1-210ENST00000566882 LST1O00453 97 aa6.91□□□□□ -1.3
CCNDBP1-210ENST00000566882 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CCNDBP1-210ENST00000566882 COX6CP09669 75 aa6.9□□□□□ -1.3
CCNDBP1-210ENST00000566882 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CCNDBP1-210ENST00000566882 LELP1Q5T871 98 aa6.9□□□□□ -1.3
CCNDBP1-210ENST00000566882 WFDC10BQ8IUB3 73 aa6.9□□□□□ -1.3
CCNDBP1-210ENST00000566882 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa6.9□□□□□ -1.31
CCNDBP1-210ENST00000566882 IGKV2D-28P01615 120 aa6.9□□□□□ -1.31
CCNDBP1-210ENST00000566882 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.9□□□□□ -1.31
CCNDBP1-210ENST00000566882 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-210ENST00000566882 CCL18P55774 89 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-210ENST00000566882 KIAA0087Q14695 138 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-210ENST00000566882 C9orf153Q5TBE3 101 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-210ENST00000566882 ENHOQ6UWT2 76 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-210ENST00000566882 C6orf223Q8N319 242 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-210ENST00000566882 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-210ENST00000566882 LINC00337Q8N6G1 96 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-210ENST00000566882 UBE2WQ96B02 151 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-210ENST00000566882 COX7A2LO14548 114 aa6.88□□□□□ -1.31
CCNDBP1-210ENST00000566882 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.88□□□□□ -1.31
CCNDBP1-210ENST00000566882 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa6.87□□□□□ -1.31
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