RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558836.5

CUX1-217, Transcript of cut like homeobox 1, humanhuman

TSL 5

Gene CUX1, Length 2,965 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1-217ENST00000558836 PFN2P35080 140 aa7.35□□□□□ -1.23
CUX1-217ENST00000558836 KRTAP10-11P60412 298 aa7.35□□□□□ -1.23
CUX1-217ENST00000558836 LYRM7Q5U5X0 104 aa7.35□□□□□ -1.23
CUX1-217ENST00000558836 TIMM17BO60830 172 aa7.34□□□□□ -1.23
CUX1-217ENST00000558836 SEC61GP60059 68 aa7.34□□□□□ -1.23
CUX1-217ENST00000558836 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa7.33□□□□□ -1.24
CUX1-217ENST00000558836 SLC25A20O43772 301 aa7.33□□□□□ -1.24
CUX1-217ENST00000558836 ANGP03950 147 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CUX1-217ENST00000558836 ATP5G1P05496 136 aa7.33□□□□□ -1.24
CUX1-217ENST00000558836 IFITM1P13164 125 aa7.33□□□□□ -1.24
CUX1-217ENST00000558836 LINC00158P58513 81 aa7.33□□□□□ -1.24
CUX1-217ENST00000558836 C2orf82Q6UX34 121 aa7.33□□□□□ -1.24
CUX1-217ENST00000558836 FOXI1Q12951 378 aa7.32□□□□□ -1.24
CUX1-217ENST00000558836 MGAM2Q2M2H8 2515 aa7.32□□□□□ -1.24
CUX1-217ENST00000558836 A0A087WZ39 114 aa7.32□□□□□ -1.24
CUX1-217ENST00000558836 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa7.32□□□□□ -1.24
CUX1-217ENST00000558836 SPART-AS1P0CW21 52 aa7.32□□□□□ -1.24
CUX1-217ENST00000558836 MIFP14174 115 aa7.32□□□□□ -1.24
CUX1-217ENST00000558836 ANKRD29Q8N6D5 301 aa7.32□□□□□ -1.24
CUX1-217ENST00000558836 CARD19Q96LW7 228 aa7.32□□□□□ -1.24
CUX1-217ENST00000558836 C6orf226Q5I0X4 101 aa7.31□□□□□ -1.24
CUX1-217ENST00000558836 C3orf56Q8N813 242 aa7.31□□□□□ -1.24
CUX1-217ENST00000558836 SS18Q15532 418 aa7.31□□□□□ -1.24
CUX1-217ENST00000558836 A0A1B0GUV1 79 aa7.3□□□□□ -1.24
CUX1-217ENST00000558836 CYSRT1A8MQ03 144 aa7.3□□□□□ -1.24
CUX1-217ENST00000558836 ATXN8Q156A1 80 aa7.3□□□□□ -1.24
CUX1-217ENST00000558836 LINC01620Q4KN68 170 aa7.3□□□□□ -1.24
CUX1-217ENST00000558836 TEN1Q86WV5 123 aa7.29□□□□□ -1.24
CUX1-217ENST00000558836 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CUX1-217ENST00000558836 MT-ATP8P03928 68 aa7.29□□□□□ -1.24
CUX1-217ENST00000558836 LINC00526Q96FQ7 95 aa7.29□□□□□ -1.24
CUX1-217ENST00000558836 ANAPC13Q9BS18 74 aa7.29□□□□□ -1.24
CUX1-217ENST00000558836 COX6CP09669 75 aa7.29□□□□□ -1.24
CUX1-217ENST00000558836 REG3AQ06141 175 aa7.29□□□□□ -1.24
CUX1-217ENST00000558836 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CUX1-217ENST00000558836 C1orf43Q9BWL3 253 aa7.28□□□□□ -1.24
CUX1-217ENST00000558836 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CUX1-217ENST00000558836 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa7.28□□□□□ -1.24
CUX1-217ENST00000558836 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa7.27□□□□□ -1.25
CUX1-217ENST00000558836 LINC00337Q8N6G1 96 aa7.27□□□□□ -1.25
CUX1-217ENST00000558836 CCL18P55774 89 aa7.27□□□□□ -1.25
CUX1-217ENST00000558836 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CUX1-217ENST00000558836 KLK12Q9UKR0 248 aa7.27□□□□□ -1.25
CUX1-217ENST00000558836 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa7.26□□□□□ -1.25
CUX1-217ENST00000558836 IGKV2D-28P01615 120 aa7.26□□□□□ -1.25
CUX1-217ENST00000558836 Q6ZTC4 211 aa7.26□□□□□ -1.25
CUX1-217ENST00000558836 PPDPFLQ8WWR9 84 aa7.26□□□□□ -1.25
CUX1-217ENST00000558836 MALP21145 153 aa7.26□□□□□ -1.25
CUX1-217ENST00000558836 XGP55808 180 aa7.26□□□□□ -1.25
CUX1-217ENST00000558836 PRR3P79522 188 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CUX1-217ENST00000558836 CDIP1Q9H305 208 aa7.25□□□□□ -1.25
CUX1-217ENST00000558836 LST1O00453 97 aa7.25□□□□□ -1.25
CUX1-217ENST00000558836 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa7.24□□□□□ -1.25
CUX1-217ENST00000558836 COX7A2LO14548 114 aa7.24□□□□□ -1.25
CUX1-217ENST00000558836 CD164L2Q6UWJ8 174 aa7.24□□□□□ -1.25
CUX1-217ENST00000558836 C6orf223Q8N319 242 aa7.24□□□□□ -1.25
CUX1-217ENST00000558836 COPS9Q8WXC6 57 aa7.24□□□□□ -1.25
CUX1-217ENST00000558836 FAM218AQ96MZ4 157 aa7.24□□□□□ -1.25
CUX1-217ENST00000558836 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa7.23□□□□□ -1.25
CUX1-217ENST00000558836 CRPP02741 224 aa7.23□□□□□ -1.25
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CUX1-217ENST00000558836 LELP1Q5T871 98 aa7.23□□□□□ -1.25
CUX1-217ENST00000558836 OR13C6PQ8NH95 151 aa7.23□□□□□ -1.25
CUX1-217ENST00000558836 DNAH3Q8TD57 4116 aa7.23□□□□□ -1.25
CUX1-217ENST00000558836 A0A0J9YWU9 116 aa7.23□□□□□ -1.25
CUX1-217ENST00000558836 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
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CUX1-217ENST00000558836 KIAA0087Q14695 138 aa7.22□□□□□ -1.25
CUX1-217ENST00000558836 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CUX1-217ENST00000558836 Q8IZM0 81 aa7.22□□□□□ -1.25
CUX1-217ENST00000558836 Q9HAA7 133 aa7.22□□□□□ -1.25
CUX1-217ENST00000558836 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa7.22□□□□□ -1.25
CUX1-217ENST00000558836 UBE2WQ96B02 151 aa7.22□□□□□ -1.25
CUX1-217ENST00000558836 C10orf25Q5T742 122 aa7.21□□□□□ -1.25
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CUX1-217ENST00000558836 SMIM11BQ8TCY0 68 aa7.21□□□□□ -1.26
CUX1-217ENST00000558836 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa7.2□□□□□ -1.26
CUX1-217ENST00000558836 MRAPQ8TCY5 172 aa7.2□□□□□ -1.26
CUX1-217ENST00000558836 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa7.2□□□□□ -1.26
CUX1-217ENST00000558836 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa7.2□□□□□ -1.26
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CUX1-217ENST00000558836 Q8NDZ9 215 aa7.18□□□□□ -1.26
CUX1-217ENST00000558836 ESRGQ1W209 222 aa7.17□□□□□ -1.26
CUX1-217ENST00000558836 COL7A1Q02388 2944 aa7.17□□□□□ -1.26
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CUX1-217ENST00000558836 H3BT86 120 aa7.17□□□□□ -1.26
CUX1-217ENST00000558836 DEFB121Q5J5C9 76 aa7.17□□□□□ -1.26
CUX1-217ENST00000558836 PRR34Q9NV39 138 aa7.17□□□□□ -1.26
CUX1-217ENST00000558836 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa7.16□□□□□ -1.26
CUX1-217ENST00000558836 HIGD2BQ4VC39 106 aa7.16□□□□□ -1.26
CUX1-217ENST00000558836 C11orf45Q8TAV5 145 aa7.16□□□□□ -1.26
CUX1-217ENST00000558836 TENM2Q9NT68 2774 aa7.16□□□□□ -1.26
CUX1-217ENST00000558836 CCDC179H3BU77 68 aa7.16□□□□□ -1.26
CUX1-217ENST00000558836 BAALC-AS2P0C853 105 aa7.16□□□□□ -1.26
CUX1-217ENST00000558836 NCR3O14931 201 aa7.15□□□□□ -1.26
CUX1-217ENST00000558836 SLPIP03973 132 aa7.15□□□□□ -1.26
CUX1-217ENST00000558836 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
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