RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556616.5

PRMT5-223, Transcript of protein arginine methyltransferase 5, human

TSL 4

Gene PRMT5, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRMT5-223	ENST00000556616	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
PRMT5-223	ENST00000556616	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		5	□□□□□ -1.61
PRMT5-223	ENST00000556616	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		5	□□□□□ -1.61
PRMT5-223	ENST00000556616	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRMT5-223	ENST00000556616	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRMT5-223	ENST00000556616		A6NDN8	102 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRMT5-223	ENST00000556616	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PRMT5-223	ENST00000556616		K7EP13	123 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRMT5-223	ENST00000556616	CDK2AP2	O75956	126 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRMT5-223	ENST00000556616	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRMT5-223	ENST00000556616		Q6ZVH6	145 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRMT5-223	ENST00000556616	B9D2	Q9BPU9	175 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRMT5-223	ENST00000556616	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRMT5-223	ENST00000556616	SPANXC	Q9NY87	97 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRMT5-223	ENST00000556616	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRMT5-223	ENST00000556616	TMEM262	E9PQX1	116 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRMT5-223	ENST00000556616	HERV-K104	P63124	156 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRMT5-223	ENST00000556616	REG3A	Q06141	175 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRMT5-223	ENST00000556616	SS18	Q15532	418 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRMT5-223	ENST00000556616	HIST1H4G	Q99525	98 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRMT5-223	ENST00000556616	ANK2	Q01484	3957 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRMT5-223	ENST00000556616	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRMT5-223	ENST00000556616	TMEM238	C9JI98	176 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRMT5-223	ENST00000556616	ESRG	Q1W209	222 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRMT5-223	ENST00000556616	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRMT5-223	ENST00000556616	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRMT5-223	ENST00000556616	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRMT5-223	ENST00000556616	SMIM13	P0DJ93	91 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRMT5-223	ENST00000556616	IFITM1	P13164	125 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRMT5-223	ENST00000556616	MIA	Q16674	131 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRMT5-223	ENST00000556616	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRMT5-223	ENST00000556616	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRMT5-223	ENST00000556616	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRMT5-223	ENST00000556616	SFTA2	Q6UW10	78 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRMT5-223	ENST00000556616	ENHO	Q6UWT2	76 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRMT5-223	ENST00000556616	COX7B2	Q8TF08	81 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRMT5-223	ENST00000556616	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRMT5-223	ENST00000556616	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRMT5-223	ENST00000556616	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PRMT5-223	ENST00000556616	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRMT5-223	ENST00000556616	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
PRMT5-223	ENST00000556616	KIAA0087	Q14695	138 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRMT5-223	ENST00000556616	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRMT5-223	ENST00000556616		Q8IZM0	81 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRMT5-223	ENST00000556616	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PRMT5-223	ENST00000556616	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PRMT5-223	ENST00000556616	TENM3	Q9P273	2699 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRMT5-223	ENST00000556616	CMYA5	Q8N3K9	4069 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRMT5-223	ENST00000556616		A0A0B4J2C4	111 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRMT5-223	ENST00000556616	CFC1B	P0CG36	223 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRMT5-223	ENST00000556616	CFC1	P0CG37	223 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRMT5-223	ENST00000556616	XCL1	P47992	114 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRMT5-223	ENST00000556616	C5orf38	Q86SI9	138 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRMT5-223	ENST00000556616	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRMT5-223	ENST00000556616	UPK3B	Q9BT76	320 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRMT5-223	ENST00000556616	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PRMT5-223	ENST00000556616	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRMT5-223	ENST00000556616	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRMT5-223	ENST00000556616	IGLL5	B9A064	214 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRMT5-223	ENST00000556616		K7ERJ3	54 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRMT5-223	ENST00000556616	COX7A2L	O14548	114 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRMT5-223	ENST00000556616	CXCL5	P42830	114 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRMT5-223	ENST00000556616	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRMT5-223	ENST00000556616	KLK12	Q9UKR0	248 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRMT5-223	ENST00000556616	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PRMT5-223	ENST00000556616		A0A1W2PPM0	123 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PRMT5-223	ENST00000556616	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PRMT5-223	ENST00000556616	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PRMT5-223	ENST00000556616	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PRMT5-223	ENST00000556616	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PRMT5-223	ENST00000556616	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PRMT5-223	ENST00000556616	NOTCH1	P46531	2555 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PRMT5-223	ENST00000556616	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRMT5-223	ENST00000556616		H3BUT2	72 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRMT5-223	ENST00000556616	IGHV3-33	P01772	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRMT5-223	ENST00000556616	LCE3B	Q5TA77	95 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRMT5-223	ENST00000556616	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRMT5-223	ENST00000556616	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRMT5-223	ENST00000556616	COPS9	Q8WXC6	57 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRMT5-223	ENST00000556616	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PRMT5-223	ENST00000556616		K7EP34	96 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PRMT5-223	ENST00000556616	APOM	O95445	188 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PRMT5-223	ENST00000556616	TSPAN13	O95857	204 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PRMT5-223	ENST00000556616	COX17	Q14061	63 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PRMT5-223	ENST00000556616	MUC7	Q8TAX7	377 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PRMT5-223	ENST00000556616	RAB37	Q96AX2	223 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PRMT5-223	ENST00000556616	UBE2W	Q96B02	151 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PRMT5-223	ENST00000556616	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PRMT5-223	ENST00000556616	APLN	Q9ULZ1	77 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PRMT5-223	ENST00000556616	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PRMT5-223	ENST00000556616	CRP	P02741	224 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRMT5-223	ENST00000556616	CCL18	P55774	89 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRMT5-223	ENST00000556616	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRMT5-223	ENST00000556616	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRMT5-223	ENST00000556616	ERG28	Q9UKR5	140 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRMT5-223	ENST00000556616	FABP2	P12104	132 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRMT5-223	ENST00000556616	SPAG11B	Q08648	103 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRMT5-223	ENST00000556616	VAMP3	Q15836	100 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRMT5-223	ENST00000556616	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRMT5-223	ENST00000556616	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		4.88	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 133.2 ms