RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553253.5

TMEM117-208, Transcript of transmembrane protein 117, human

TSL 3

Gene TMEM117, Length 809 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM117-208	ENST00000553253	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TMEM117-208	ENST00000553253	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TMEM117-208	ENST00000553253	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TMEM117-208	ENST00000553253	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TMEM117-208	ENST00000553253		Q6ZSA8	131 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TMEM117-208	ENST00000553253	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TMEM117-208	ENST00000553253	PRO0255	Q9UI72	69 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TMEM117-208	ENST00000553253	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TMEM117-208	ENST00000553253		A8MWL6	223 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMEM117-208	ENST00000553253		F2Z2F3	143 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMEM117-208	ENST00000553253	MT-ATP8	P03928	68 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMEM117-208	ENST00000553253	LINC00313	P59037	77 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMEM117-208	ENST00000553253		Q0VG73	95 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMEM117-208	ENST00000553253	FHL2	Q14192	279 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMEM117-208	ENST00000553253	C9orf153	Q5TBE3	101 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMEM117-208	ENST00000553253	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMEM117-208	ENST00000553253	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMEM117-208	ENST00000553253	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMEM117-208	ENST00000553253		Q8N814	137 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMEM117-208	ENST00000553253	CNFN	Q9BYD5	112 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMEM117-208	ENST00000553253	OSTC	Q9NRP0	149 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMEM117-208	ENST00000553253	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMEM117-208	ENST00000553253	HIGD1C	A8MV81	97 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMEM117-208	ENST00000553253	UBE2L6	O14933	153 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMEM117-208	ENST00000553253	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TMEM117-208	ENST00000553253	FABP2	P12104	132 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMEM117-208	ENST00000553253	ADCYAP1	P18509	176 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMEM117-208	ENST00000553253	RHOH	Q15669	191 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMEM117-208	ENST00000553253	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TMEM117-208	ENST00000553253	SLC25A34	Q6PIV7	304 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMEM117-208	ENST00000553253	LCA10	Q71F78	164 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMEM117-208	ENST00000553253	TSKU	Q8WUA8	353 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMEM117-208	ENST00000553253	GTSF1	Q8WW33	167 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMEM117-208	ENST00000553253	TOMM6	Q96B49	74 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMEM117-208	ENST00000553253	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMEM117-208	ENST00000553253	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMEM117-208	ENST00000553253	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMEM117-208	ENST00000553253	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMEM117-208	ENST00000553253		V9GYV3	84 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMEM117-208	ENST00000553253		A0A096LPF7	62 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TMEM117-208	ENST00000553253	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TMEM117-208	ENST00000553253	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TMEM117-208	ENST00000553253	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TMEM117-208	ENST00000553253	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TMEM117-208	ENST00000553253		K7EQD1	137 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TMEM117-208	ENST00000553253	COX7A2L	O14548	114 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TMEM117-208	ENST00000553253	PRSS1	P07477	247 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TMEM117-208	ENST00000553253	PRSS2	P07478	247 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TMEM117-208	ENST00000553253	TRGC1	P0CF51	173 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TMEM117-208	ENST00000553253	CRYGA	P11844	174 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TMEM117-208	ENST00000553253	LINC00310	P59036	64 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TMEM117-208	ENST00000553253	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TMEM117-208	ENST00000553253	ZNF56	Q15929	161 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TMEM117-208	ENST00000553253	C10orf25	Q5T742	122 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TMEM117-208	ENST00000553253	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TMEM117-208	ENST00000553253	SCX	Q7RTU7	201 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TMEM117-208	ENST00000553253	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TMEM117-208	ENST00000553253	YPEL4	Q96NS1	127 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TMEM117-208	ENST00000553253	TMEM243	Q9BU79	118 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TMEM117-208	ENST00000553253	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TMEM117-208	ENST00000553253	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TMEM117-208	ENST00000553253		H3BMG7	143 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TMEM117-208	ENST00000553253		M0R378	163 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TMEM117-208	ENST00000553253	MT1HL1	P0DM35	61 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TMEM117-208	ENST00000553253	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TMEM117-208	ENST00000553253	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TMEM117-208	ENST00000553253	RAB37	Q96AX2	223 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TMEM117-208	ENST00000553253	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TMEM117-208	ENST00000553253	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TMEM117-208	ENST00000553253	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMEM117-208	ENST00000553253		A0A1B0GUT8	65 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMEM117-208	ENST00000553253	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMEM117-208	ENST00000553253	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMEM117-208	ENST00000553253	MGP	P08493	103 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMEM117-208	ENST00000553253	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TMEM117-208	ENST00000553253	TWIST1	Q15672	202 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMEM117-208	ENST00000553253	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMEM117-208	ENST00000553253	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TMEM117-208	ENST00000553253	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMEM117-208	ENST00000553253	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMEM117-208	ENST00000553253	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TMEM117-208	ENST00000553253	HIST1H2BK	O60814	126 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMEM117-208	ENST00000553253	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMEM117-208	ENST00000553253	HIST1H2BO	P23527	126 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMEM117-208	ENST00000553253	HIST1H2BB	P33778	126 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMEM117-208	ENST00000553253	HIST1H2BD	P58876	126 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMEM117-208	ENST00000553253	HIST1H2BC	P62807	126 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMEM117-208	ENST00000553253	KIAA0087	Q14695	138 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMEM117-208	ENST00000553253	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMEM117-208	ENST00000553253	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TMEM117-208	ENST00000553253	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMEM117-208	ENST00000553253	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMEM117-208	ENST00000553253	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMEM117-208	ENST00000553253	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TMEM117-208	ENST00000553253	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMEM117-208	ENST00000553253		F8W1H4	67 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMEM117-208	ENST00000553253	SCGB1C2	P0DMR2	95 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMEM117-208	ENST00000553253	CXCL5	P42830	114 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMEM117-208	ENST00000553253	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TMEM117-208	ENST00000553253	REG3A	Q06141	175 aa		4.56	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms