RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551984.5

FGD4-215, Transcript of FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4, human

TSL 5

Gene FGD4, Length 2,435 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FGD4-215	ENST00000551984	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984	STH	Q8IWL8	128 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984		Q8NAQ8	132 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984		A0A0J9YX75	114 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984		A0A0J9YXY3	114 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984		I3L3M4	83 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984	LY6G6C	O95867	125 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984	TMEM141	Q96I45	108 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984	TIMM17A	Q99595	171 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984	LITAF	Q99732	161 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984	MGP	P08493	103 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984	RHOH	Q15669	191 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984	UPK3B	Q9BT76	320 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984	MUC4	Q99102	2169 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984	KNCN	A6PVL3	124 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984	BUB3	O43684	328 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984	JPT2	Q9H910	190 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984	PRSS2	P07478	247 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984	RBMY1A1	P0DJD3	496 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984	MIF	P14174	115 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984	RBMY1F	Q15415	496 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984	PRR9	Q5T870	116 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984		X6R8D5	127 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984	DNAH2	Q9P225	4427 aa		4.59	□□□□□ -1.68
FGD4-215	ENST00000551984		F8WDY8	70 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FGD4-215	ENST00000551984	PPP1R17	O96001	155 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FGD4-215	ENST00000551984	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
FGD4-215	ENST00000551984	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FGD4-215	ENST00000551984	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FGD4-215	ENST00000551984	LINC00477	Q96M19	166 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FGD4-215	ENST00000551984	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FGD4-215	ENST00000551984	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FGD4-215	ENST00000551984	DEFB4A	O15263	64 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FGD4-215	ENST00000551984	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
FGD4-215	ENST00000551984	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
FGD4-215	ENST00000551984	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FGD4-215	ENST00000551984	MAL	P21145	153 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FGD4-215	ENST00000551984	NPC2	P61916	151 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FGD4-215	ENST00000551984	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FGD4-215	ENST00000551984	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FGD4-215	ENST00000551984	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FGD4-215	ENST00000551984	SERP2	Q8N6R1	65 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FGD4-215	ENST00000551984	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FGD4-215	ENST00000551984	APLN	Q9ULZ1	77 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FGD4-215	ENST00000551984	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FGD4-215	ENST00000551984	SOCS3	O14543	225 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FGD4-215	ENST00000551984	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FGD4-215	ENST00000551984	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FGD4-215	ENST00000551984	PRO0628	Q9UI54	55 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FGD4-215	ENST00000551984		A0A0J9YXV3	536 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-215	ENST00000551984	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-215	ENST00000551984	TIRAP	P58753	221 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-215	ENST00000551984	LINC00315	P59091	139 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-215	ENST00000551984	MIA	Q16674	131 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-215	ENST00000551984	DAND5	Q8N907	189 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-215	ENST00000551984	C22orf24	Q9Y442	160 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-215	ENST00000551984	HERC2	O95714	4834 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-215	ENST00000551984	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-215	ENST00000551984	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-215	ENST00000551984	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-215	ENST00000551984	CELA1	Q9UNI1	258 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-215	ENST00000551984	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-215	ENST00000551984	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-215	ENST00000551984		A8MTW9	85 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-215	ENST00000551984	VCY	O14598	125 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-215	ENST00000551984	RS1	O15537	224 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-215	ENST00000551984		Q6ZTC4	211 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-215	ENST00000551984	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-215	ENST00000551984	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-215	ENST00000551984	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-215	ENST00000551984	PFN2	P35080	140 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-215	ENST00000551984	C20orf173	Q96LM9	149 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-215	ENST00000551984	XCL2	Q9UBD3	114 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-215	ENST00000551984	COX7A2L	O14548	114 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FGD4-215	ENST00000551984	DEFB1	P60022	68 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FGD4-215	ENST00000551984	FHL2	Q14192	279 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FGD4-215	ENST00000551984	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FGD4-215	ENST00000551984	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FGD4-215	ENST00000551984	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
FGD4-215	ENST00000551984	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FGD4-215	ENST00000551984	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FGD4-215	ENST00000551984		A0A087WVE0	104 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FGD4-215	ENST00000551984	BAALC-AS2	P0C853	105 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FGD4-215	ENST00000551984	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FGD4-215	ENST00000551984	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FGD4-215	ENST00000551984	USP17L23	D6RBM5	183 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FGD4-215	ENST00000551984	GNRH2	O43555	120 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FGD4-215	ENST00000551984	NXPH4	O95158	308 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FGD4-215	ENST00000551984	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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