RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 PIEZO1Q92508 2521 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRB-208ENST00000550358 FAM30AQ9NZY2 134 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRB-208ENST00000550358 A8MTW9 85 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRB-208ENST00000550358 X6R8D5 127 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRB-208ENST00000550358 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
PTPRB-208ENST00000550358 SMCR5Q8TEV8 140 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRB-208ENST00000550358 ROS1P08922 2347 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRB-208ENST00000550358 CHD9Q3L8U1 2897 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRB-208ENST00000550358 MUC6Q6W4X9 2439 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRB-208ENST00000550358 HCFC1P51610 2035 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRB-208ENST00000550358 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRB-208ENST00000550358 XGP55808 180 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRB-208ENST00000550358 TANC2Q9HCD6 1990 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRB-208ENST00000550358 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRB-208ENST00000550358 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
PTPRB-208ENST00000550358 Q8NBF4 154 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRB-208ENST00000550358 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
PTPRB-208ENST00000550358 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
PTPRB-208ENST00000550358 CELA1Q9UNI1 258 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRB-208ENST00000550358 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRB-208ENST00000550358 C16orf90A8MZG2 172 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRB-208ENST00000550358 A6NED7 52 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRB-208ENST00000550358 H0Y9P7 68 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRB-208ENST00000550358 MPLKIPQ8TAP9 179 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRB-208ENST00000550358 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRB-208ENST00000550358 Q6ZRP5 223 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRB-208ENST00000550358 LINC00208Q96KT6 92 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRB-208ENST00000550358 SNURFQ9Y675 71 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRB-208ENST00000550358 TRANK1O15050 2925 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRB-208ENST00000550358 A0A087WSZ3 146 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRB-208ENST00000550358 FAM229AH3BQW9 127 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRB-208ENST00000550358 DNAH10OSP0CZ25 163 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRB-208ENST00000550358 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRB-208ENST00000550358 Q8NAQ8 132 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRB-208ENST00000550358 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRB-208ENST00000550358 C8orf87E5RJ46 101 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRB-208ENST00000550358 SBSPONQ8IVN8 264 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRB-208ENST00000550358 Q8N3U1 123 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRB-208ENST00000550358 LINC00337Q8N6G1 96 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRB-208ENST00000550358 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRB-208ENST00000550358 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
PTPRB-208ENST00000550358 C6orf48Q9UBA6 75 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRB-208ENST00000550358 EML5Q05BV3 1969 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRB-208ENST00000550358 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRB-208ENST00000550358 SVIPQ8NHG7 77 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRB-208ENST00000550358 LINC00167Q96N53 147 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRB-208ENST00000550358 SPTBN2O15020 2390 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRB-208ENST00000550358 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRB-208ENST00000550358 SPATA3Q8NHX4 192 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRB-208ENST00000550358 Q6ZRX8 168 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-208ENST00000550358 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-208ENST00000550358 RTL8CO15255 209 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-208ENST00000550358 CRYGAP11844 174 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-208ENST00000550358 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-208ENST00000550358 PRR3P79522 188 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-208ENST00000550358 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM254Q8TBM7 123 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-208ENST00000550358 CCDC179H3BU77 68 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRB-208ENST00000550358 KIAA0087Q14695 138 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRB-208ENST00000550358 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
PTPRB-208ENST00000550358 CEP350Q5VT06 3117 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRB-208ENST00000550358 PCNX1Q96RV3 2341 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRB-208ENST00000550358 MOBPQ13875 183 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRB-208ENST00000550358 C19orf73Q9NVV2 129 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRB-208ENST00000550358 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRB-208ENST00000550358 ACYP2P14621 99 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRB-208ENST00000550358 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
PTPRB-208ENST00000550358 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRB-208ENST00000550358 PRLHP81277 87 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRB-208ENST00000550358 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
PTPRB-208ENST00000550358 LINC00588Q9Y4M8 146 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRB-208ENST00000550358 C1orf64Q8NEQ6 169 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-208ENST00000550358 LINC00846Q9NV44 126 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-208ENST00000550358 SPAG11AQ6PDA7 123 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-208ENST00000550358 LINC00612Q8N6U2 182 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-208ENST00000550358 PTPRBP23467 1997 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-208ENST00000550358 CACNA1GO43497 2377 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRB-208ENST00000550358 Q6ZQT0 140 aa5.78□□□□□ -1.48
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PTPRB-208ENST00000550358 ERC2-IT1O76042 136 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRB-208ENST00000550358 PLCE1Q9P212 2302 aa5.78□□□□□ -1.48
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PTPRB-208ENST00000550358 TLX1NBP0CAT3 122 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRB-208ENST00000550358 IGLV6-57P01721 117 aa5.77□□□□□ -1.48
PTPRB-208ENST00000550358 CACNA1AO00555 2505 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-208ENST00000550358 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-208ENST00000550358 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-208ENST00000550358 PCSK5Q92824 1860 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-208ENST00000550358 LINC00336Q6ZUF6 198 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-208ENST00000550358 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-208ENST00000550358 EPM2AB3EWF7 344 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRB-208ENST00000550358 LINC00313P59037 77 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRB-208ENST00000550358 TYMSOSQ8TAI1 123 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRB-208ENST00000550358 KCNQ1DNQ9H478 68 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRB-208ENST00000550358 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRB-208ENST00000550358 LINC00476Q8WZB0 136 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRB-208ENST00000550358 A0A087WVE0 104 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRB-208ENST00000550358 PRR34Q9NV39 138 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRB-208ENST00000550358 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa5.74□□□□□ -1.49
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