RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549107.5

PTPRR-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRR, Length 862 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-208ENST00000549107 PRSS2P07478 247 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRR-208ENST00000549107 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
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PTPRR-208ENST00000549107 SFTA2Q6UW10 78 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRR-208ENST00000549107 Q6ZVH6 145 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRR-208ENST00000549107 APOMO95445 188 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRR-208ENST00000549107 SMIM13P0DJ93 91 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRR-208ENST00000549107 KIAA0087Q14695 138 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRR-208ENST00000549107 C6orf226Q5I0X4 101 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRR-208ENST00000549107 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRR-208ENST00000549107 MUSTN1Q8IVN3 82 aa7.54□□□□□ -1.2
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PTPRR-208ENST00000549107 RPL24P83731 157 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
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PTPRR-208ENST00000549107 A4D1N5 150 aa7.51□□□□□ -1.21
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PTPRR-208ENST00000549107 C2orf82Q6UX34 121 aa7.51□□□□□ -1.21
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PTPRR-208ENST00000549107 Q9HAA7 133 aa7.51□□□□□ -1.21
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PTPRR-208ENST00000549107 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
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PTPRR-208ENST00000549107 A0A0B4J2C4 111 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRR-208ENST00000549107 H3BUT2 72 aa7.48□□□□□ -1.21
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PTPRR-208ENST00000549107 C6orf223Q8N319 242 aa7.48□□□□□ -1.21
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PTPRR-208ENST00000549107 C15orf56Q8N910 161 aa7.48□□□□□ -1.21
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PTPRR-208ENST00000549107 C10orf25Q5T742 122 aa7.46□□□□□ -1.22
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PTPRR-208ENST00000549107 F8WDY8 70 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRR-208ENST00000549107 FABP2P12104 132 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRR-208ENST00000549107 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa7.42□□□□□ -1.22
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PTPRR-208ENST00000549107 K7EP34 96 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRR-208ENST00000549107 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
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PTPRR-208ENST00000549107 SPCS1Q9Y6A9 102 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRR-208ENST00000549107 GAGE10A6NGK3 116 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRR-208ENST00000549107 SYCNQ0VAF6 134 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRR-208ENST00000549107 Q1RN00 199 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRR-208ENST00000549107 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRR-208ENST00000549107 IGKV2D-28P01615 120 aa7.38□□□□□ -1.23
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PTPRR-208ENST00000549107 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa7.37□□□□□ -1.23
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