RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533012.1

TRAPPC4-211, Transcript of trafficking protein particle complex 4, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC4, Length 817 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4-211ENST00000533012 A0A087WZ39 114 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAPPC4-211ENST00000533012 A0A0J9YXV3 536 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAPPC4-211ENST00000533012 A0A1B0GV90 55 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAPPC4-211ENST00000533012 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAPPC4-211ENST00000533012 C11orf86A6NJI1 115 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAPPC4-211ENST00000533012 E9PLD3 99 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAPPC4-211ENST00000533012 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAPPC4-211ENST00000533012 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
TRAPPC4-211ENST00000533012 C15orf56Q8N910 161 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAPPC4-211ENST00000533012 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
TRAPPC4-211ENST00000533012 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
TRAPPC4-211ENST00000533012 HIGD2BQ4VC39 106 aa7.34□□□□□ -1.23
TRAPPC4-211ENST00000533012 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa7.34□□□□□ -1.23
TRAPPC4-211ENST00000533012 LINC01561Q8N1V8 128 aa7.34□□□□□ -1.23
TRAPPC4-211ENST00000533012 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa7.33□□□□□ -1.24
TRAPPC4-211ENST00000533012 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
TRAPPC4-211ENST00000533012 GCSHP23434 173 aa7.33□□□□□ -1.24
TRAPPC4-211ENST00000533012 LINC00469Q8N7U9 141 aa7.33□□□□□ -1.24
TRAPPC4-211ENST00000533012 ORAOV1Q8WV07 137 aa7.33□□□□□ -1.24
TRAPPC4-211ENST00000533012 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa7.33□□□□□ -1.24
TRAPPC4-211ENST00000533012 DNAH5Q8TE73 4624 aa7.32□□□□□ -1.24
TRAPPC4-211ENST00000533012 C2orf91Q6ZV80 131 aa7.32□□□□□ -1.24
TRAPPC4-211ENST00000533012 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC4-211ENST00000533012 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC4-211ENST00000533012 A6NJY4 79 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC4-211ENST00000533012 H3BRM9 83 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC4-211ENST00000533012 SLPIP03973 132 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC4-211ENST00000533012 CNBPP62633 177 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC4-211ENST00000533012 TMEM170BQ5T4T1 132 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC4-211ENST00000533012 PLEKHB2Q96CS7 222 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC4-211ENST00000533012 LINC00526Q96FQ7 95 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC4-211ENST00000533012 CHAC1Q9BUX1 264 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC4-211ENST00000533012 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC4-211ENST00000533012 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC4-211ENST00000533012 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC4-211ENST00000533012 SPAG11BQ08648 103 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC4-211ENST00000533012 PCP2Q8IVA1 136 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC4-211ENST00000533012 C9orf163Q8N9P6 203 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC4-211ENST00000533012 C2orf48Q96LS8 159 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC4-211ENST00000533012 PKHD1P08F94 4074 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC4-211ENST00000533012 ZNF815PA8K554 130 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC4-211ENST00000533012 F8WDY8 70 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC4-211ENST00000533012 PRSS2P07478 247 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC4-211ENST00000533012 PTTG1IPP53801 180 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC4-211ENST00000533012 SYCNQ0VAF6 134 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC4-211ENST00000533012 C6orf226Q5I0X4 101 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC4-211ENST00000533012 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC4-211ENST00000533012 CAMK2N2Q96S95 79 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC4-211ENST00000533012 LRP1BQ9NZR2 4599 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC4-211ENST00000533012 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC4-211ENST00000533012 LEPROTO15243 131 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC4-211ENST00000533012 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC4-211ENST00000533012 KRTAP10-1P60331 282 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC4-211ENST00000533012 LINC01620Q4KN68 170 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC4-211ENST00000533012 CARD19Q96LW7 228 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC4-211ENST00000533012 TOMM7Q9P0U1 55 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC4-211ENST00000533012 SPINK8P0C7L1 97 aa7.27□□□□□ -1.25
TRAPPC4-211ENST00000533012 KIAA0087Q14695 138 aa7.27□□□□□ -1.25
TRAPPC4-211ENST00000533012 CEND1Q8N111 149 aa7.27□□□□□ -1.25
TRAPPC4-211ENST00000533012 HIST1H4GQ99525 98 aa7.27□□□□□ -1.25
TRAPPC4-211ENST00000533012 TMEM223A0PJW6 202 aa7.26□□□□□ -1.25
TRAPPC4-211ENST00000533012 SMIM1B2RUZ4 78 aa7.26□□□□□ -1.25
TRAPPC4-211ENST00000533012 J3QQQ9 107 aa7.26□□□□□ -1.25
TRAPPC4-211ENST00000533012 NDUFA1O15239 70 aa7.26□□□□□ -1.25
TRAPPC4-211ENST00000533012 SMIM13P0DJ93 91 aa7.26□□□□□ -1.25
TRAPPC4-211ENST00000533012 CKS1BP61024 79 aa7.26□□□□□ -1.25
TRAPPC4-211ENST00000533012 Q8IZM0 81 aa7.26□□□□□ -1.25
TRAPPC4-211ENST00000533012 BIRC6Q9NR09 4857 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC4-211ENST00000533012 VAMP3Q15836 100 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC4-211ENST00000533012 SDIM1Q6ZPB5 146 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC4-211ENST00000533012 Q6ZRU5 148 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC4-211ENST00000533012 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC4-211ENST00000533012 PKIGQ9Y2B9 76 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC4-211ENST00000533012 TMEM238C9JI98 176 aa7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC4-211ENST00000533012 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC4-211ENST00000533012 RNF151Q2KHN1 245 aa7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC4-211ENST00000533012 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC4-211ENST00000533012 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC4-211ENST00000533012 COX7B2Q8TF08 81 aa7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC4-211ENST00000533012 DNAH8Q96JB1 4490 aa7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC4-211ENST00000533012 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC4-211ENST00000533012 TAX1BP3O14907 124 aa7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC4-211ENST00000533012 CXCL5P42830 114 aa7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC4-211ENST00000533012 C10orf25Q5T742 122 aa7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC4-211ENST00000533012 C2orf82Q6UX34 121 aa7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC4-211ENST00000533012 COPS9Q8WXC6 57 aa7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC4-211ENST00000533012 DPH3Q96FX2 82 aa7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC4-211ENST00000533012 TP73-AS1Q9UF72 201 aa7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC4-211ENST00000533012 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa7.22□□□□□ -1.25
TRAPPC4-211ENST00000533012 C9orf118A6NHY6 69 aa7.22□□□□□ -1.25
TRAPPC4-211ENST00000533012 UBE2V1Q13404 147 aa7.22□□□□□ -1.25
TRAPPC4-211ENST00000533012 LYRM7Q5U5X0 104 aa7.22□□□□□ -1.25
TRAPPC4-211ENST00000533012 Q6ZVH6 145 aa7.22□□□□□ -1.25
TRAPPC4-211ENST00000533012 FAM30AQ9NZY2 134 aa7.22□□□□□ -1.25
TRAPPC4-211ENST00000533012 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa7.21□□□□□ -1.26
TRAPPC4-211ENST00000533012 CDK2AP2O75956 126 aa7.21□□□□□ -1.26
TRAPPC4-211ENST00000533012 SFTA2Q6UW10 78 aa7.21□□□□□ -1.26
TRAPPC4-211ENST00000533012 TTTY13Q9BZ97 58 aa7.21□□□□□ -1.26
TRAPPC4-211ENST00000533012 C6orf48Q9UBA6 75 aa7.21□□□□□ -1.26
TRAPPC4-211ENST00000533012 APOBP04114 4563 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
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