RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518681.5

MIB2-231, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene MIB2, Length 3,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MIB2-231	ENST00000518681	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		13.18	□□□□□ -0.3
MIB2-231	ENST00000518681	TRAC	P01848	142 aa		13.18	□□□□□ -0.3
MIB2-231	ENST00000518681	SMR3A	Q99954	134 aa		13.18	□□□□□ -0.3
MIB2-231	ENST00000518681	TENM1	Q9UKZ4	2725 aa		13.16	□□□□□ -0.3
MIB2-231	ENST00000518681	NCR3	O14931	201 aa		13.16	□□□□□ -0.3
MIB2-231	ENST00000518681	IGLV1-51	P01701	117 aa		13.16	□□□□□ -0.3
MIB2-231	ENST00000518681	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		13.15	□□□□□ -0.3
MIB2-231	ENST00000518681	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		13.15	□□□□□ -0.3
MIB2-231	ENST00000518681	SMIM20	Q8N5G0	67 aa		13.15	□□□□□ -0.3
MIB2-231	ENST00000518681	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		13.15	□□□□□ -0.3
MIB2-231	ENST00000518681	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.31
MIB2-231	ENST00000518681	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		13.15	□□□□□ -0.31
MIB2-231	ENST00000518681	IGKV3D-7	A0A0C4DH55	119 aa		13.14	□□□□□ -0.31
MIB2-231	ENST00000518681	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		13.14	□□□□□ -0.31
MIB2-231	ENST00000518681	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
MIB2-231	ENST00000518681	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
MIB2-231	ENST00000518681	ATR	Q13535	2644 aa		13.13	□□□□□ -0.31
MIB2-231	ENST00000518681	LRRC75A-AS1	Q8N1F1	130 aa		13.13	□□□□□ -0.31
MIB2-231	ENST00000518681	TMEM86B	Q8N661	226 aa		13.13	□□□□□ -0.31
MIB2-231	ENST00000518681	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		13.12	□□□□□ -0.31
MIB2-231	ENST00000518681	TRBV7-7	A0A0K0K1E9	115 aa		13.12	□□□□□ -0.31
MIB2-231	ENST00000518681		A0A087WZ39	114 aa		13.11	□□□□□ -0.31
MIB2-231	ENST00000518681	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		13.11	□□□□□ -0.31
MIB2-231	ENST00000518681	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		13.11	□□□□□ -0.31
MIB2-231	ENST00000518681	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
MIB2-231	ENST00000518681	LINC00643	Q86TS7	51 aa		13.09	□□□□□ -0.31
MIB2-231	ENST00000518681	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		13.08	□□□□□ -0.32
MIB2-231	ENST00000518681	PF4	P02776	101 aa		13.08	□□□□□ -0.32
MIB2-231	ENST00000518681	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		13.08	□□□□□ -0.32
MIB2-231	ENST00000518681	ACYP1	P07311	99 aa		13.07	□□□□□ -0.32
MIB2-231	ENST00000518681		A0A087WVE0	104 aa		13.07	□□□□□ -0.32
MIB2-231	ENST00000518681	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		13.07	□□□□□ -0.32
MIB2-231	ENST00000518681	HTN3	P15516	51 aa		13.06	□□□□□ -0.32
MIB2-231	ENST00000518681	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		13.06	□□□□□ -0.32
MIB2-231	ENST00000518681	KRTAP10-3	P60369	221 aa		13.06	□□□□□ -0.32
MIB2-231	ENST00000518681	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
MIB2-231	ENST00000518681	DEFB135	Q30KP9	77 aa		13.05	□□□□□ -0.32
MIB2-231	ENST00000518681	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		13.05	□□□□□ -0.32
MIB2-231	ENST00000518681	LINC00846	Q9NV44	126 aa		13.05	□□□□□ -0.32
MIB2-231	ENST00000518681	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		13.05	□□□□□ -0.32
MIB2-231	ENST00000518681	SS18	Q15532	418 aa		13.04	□□□□□ -0.32
MIB2-231	ENST00000518681	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	13.04	□□□□□ -0.32
MIB2-231	ENST00000518681	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	13.03	□□□□□ -0.32
MIB2-231	ENST00000518681	C9orf153	Q5TBE3	101 aa		13.02	□□□□□ -0.33
MIB2-231	ENST00000518681	CXCL5	P42830	114 aa		13.01	□□□□□ -0.33
MIB2-231	ENST00000518681	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		13.01	□□□□□ -0.33
MIB2-231	ENST00000518681	C6orf223	Q8N319	242 aa		13	□□□□□ -0.33
MIB2-231	ENST00000518681		Q8NDZ9	215 aa		13	□□□□□ -0.33
MIB2-231	ENST00000518681		X6R8D5	127 aa		13	□□□□□ -0.33
MIB2-231	ENST00000518681	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	13	□□□□□ -0.33
MIB2-231	ENST00000518681		H0YGX0	51 aa		12.99	□□□□□ -0.33
MIB2-231	ENST00000518681	HIVEP1	P15822	2718 aa		12.98	□□□□□ -0.33
MIB2-231	ENST00000518681	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	12.98	□□□□□ -0.33
MIB2-231	ENST00000518681	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		12.98	□□□□□ -0.33
MIB2-231	ENST00000518681	PRO0255	Q9UI72	69 aa		12.97	□□□□□ -0.33
MIB2-231	ENST00000518681	CFAP161	Q6P656	301 aa		12.97	□□□□□ -0.33
MIB2-231	ENST00000518681	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	12.96	□□□□□ -0.33
MIB2-231	ENST00000518681	ORMDL1	Q9P0S3	153 aa		12.96	□□□□□ -0.34
MIB2-231	ENST00000518681	HIST1H4A	P62805	103 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
MIB2-231	ENST00000518681	C10orf25	Q5T742	122 aa		12.95	□□□□□ -0.34
MIB2-231	ENST00000518681	C16orf95	Q9H693	158 aa		12.95	□□□□□ -0.34
MIB2-231	ENST00000518681	IMUP	Q9GZP8	106 aa		12.95	□□□□□ -0.34
MIB2-231	ENST00000518681	CELA1	Q9UNI1	258 aa		12.94	□□□□□ -0.34
MIB2-231	ENST00000518681	REG3A	Q06141	175 aa		12.94	□□□□□ -0.34
MIB2-231	ENST00000518681	C6orf99	Q4VX62	202 aa		12.94	□□□□□ -0.34
MIB2-231	ENST00000518681		Q8IZM0	81 aa		12.94	□□□□□ -0.34
MIB2-231	ENST00000518681	C3orf22	Q8N5N4	141 aa		12.93	□□□□□ -0.34
MIB2-231	ENST00000518681	CYSTM1	Q9H1C7	97 aa		12.93	□□□□□ -0.34
MIB2-231	ENST00000518681	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		12.93	□□□□□ -0.34
MIB2-231	ENST00000518681	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		12.93	□□□□□ -0.34
MIB2-231	ENST00000518681	HILS1	P60008	231 aa		12.92	□□□□□ -0.34
MIB2-231	ENST00000518681	KIAA0087	Q14695	138 aa		12.92	□□□□□ -0.34
MIB2-231	ENST00000518681	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		12.91	□□□□□ -0.34
MIB2-231	ENST00000518681	hADV29S1	A0JD25	119 aa		12.91	□□□□□ -0.34
MIB2-231	ENST00000518681		A0A1B0GX51	115 aa		12.91	□□□□□ -0.34
MIB2-231	ENST00000518681	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		12.9	□□□□□ -0.34
MIB2-231	ENST00000518681	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		12.9	□□□□□ -0.34
MIB2-231	ENST00000518681		A0A1B0GUV1	79 aa		12.89	□□□□□ -0.35
MIB2-231	ENST00000518681	DAD1	P61803	113 aa		12.89	□□□□□ -0.35
MIB2-231	ENST00000518681		Q8N814	137 aa		12.89	□□□□□ -0.35
MIB2-231	ENST00000518681	LY6G6D	O95868	133 aa		12.88	□□□□□ -0.35
MIB2-231	ENST00000518681	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		12.88	□□□□□ -0.35
MIB2-231	ENST00000518681	KLK12	Q9UKR0	248 aa		12.88	□□□□□ -0.35
MIB2-231	ENST00000518681	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		12.88	□□□□□ -0.35
MIB2-231	ENST00000518681	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
MIB2-231	ENST00000518681	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
MIB2-231	ENST00000518681	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MIB2-231	ENST00000518681	UQCRQ	O14949	82 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MIB2-231	ENST00000518681	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MIB2-231	ENST00000518681	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MIB2-231	ENST00000518681	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MIB2-231	ENST00000518681	OBSCN-AS1	Q96MR7	158 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MIB2-231	ENST00000518681	SPAG11B	Q08648	103 aa		12.85	□□□□□ -0.35
MIB2-231	ENST00000518681	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		12.84	□□□□□ -0.35
MIB2-231	ENST00000518681	COX7C	P15954	63 aa		12.84	□□□□□ -0.35
MIB2-231	ENST00000518681	C2orf48	Q96LS8	159 aa		12.84	□□□□□ -0.35
MIB2-231	ENST00000518681	TMEM126A	Q9H061	195 aa		12.84	□□□□□ -0.35
MIB2-231	ENST00000518681		M0R2N4	97 aa		12.83	□□□□□ -0.36
MIB2-231	ENST00000518681	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		12.83	□□□□□ -0.36
MIB2-231	ENST00000518681	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		12.82	□□□□□ -0.36

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