RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517072.1

RNU6-334P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 334, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-334P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-334P-201ENST00000517072 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-334P-201ENST00000517072 NAP1L6A6NFF2 107 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-334P-201ENST00000517072 ADGRL2O95490 1459 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-334P-201ENST00000517072 SVBPQ8N300 66 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-334P-201ENST00000517072 A0A0G2JMZ2 1700 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-334P-201ENST00000517072 FAM223BA6NKX1 122 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-334P-201ENST00000517072 LCN9Q8WX39 176 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-334P-201ENST00000517072 C12orf57Q99622 126 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-334P-201ENST00000517072 LINC00846Q9NV44 126 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-334P-201ENST00000517072 MRC2Q9UBG0 1479 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-334P-201ENST00000517072 EFCAB10A6NFE3 127 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-334P-201ENST00000517072 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-334P-201ENST00000517072 GNG4P50150 75 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-334P-201ENST00000517072 SFTA2Q6UW10 78 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-334P-201ENST00000517072 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-334P-201ENST00000517072 SEC11AP67812 179 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-334P-201ENST00000517072 SCN7AQ01118 1682 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-334P-201ENST00000517072 H3BQ15 152 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-334P-201ENST00000517072 DLEU1O43261 78 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-334P-201ENST00000517072 PPP3R1P63098 170 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-334P-201ENST00000517072 APLNQ9ULZ1 77 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-334P-201ENST00000517072 CCDC141Q6ZP82 1450 aa-1.36□□□□□ -2.63
RNU6-334P-201ENST00000517072 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP-1.36□□□□□ -2.63
RNU6-334P-201ENST00000517072 MT4P47944 62 aa-1.36□□□□□ -2.63
RNU6-334P-201ENST00000517072 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa-1.36□□□□□ -2.63
RNU6-334P-201ENST00000517072 HYDINQ4G0P3 5121 aa-1.36□□□□□ -2.63
RNU6-334P-201ENST00000517072 PCNX1Q96RV3 2341 aa-1.37□□□□□ -2.63
RNU6-334P-201ENST00000517072 LAMA5O15230 3695 aa-1.37□□□□□ -2.63
RNU6-334P-201ENST00000517072 USH2AO75445 5202 aa-1.37□□□□□ -2.63
RNU6-334P-201ENST00000517072 CORTO00230 105 aa-1.37□□□□□ -2.63
RNU6-334P-201ENST00000517072 RYR1P21817 5038 aa-1.37□□□□□ -2.63
RNU6-334P-201ENST00000517072 NUP188Q5SRE5 1749 aa-1.37□□□□□ -2.63
RNU6-334P-201ENST00000517072 FMN2Q9NZ56 1722 aa-1.37□□□□□ -2.63
RNU6-334P-201ENST00000517072 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa-1.38□□□□□ -2.63
RNU6-334P-201ENST00000517072 MAPKBP1O60336 1514 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-334P-201ENST00000517072 TOP2BQ02880 1626 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-334P-201ENST00000517072 HIVEP1P15822 2718 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-334P-201ENST00000517072 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-334P-201ENST00000517072 SPRR2AP35326 72 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-334P-201ENST00000517072 KIAA1109Q2LD37 5005 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-334P-201ENST00000517072 ARHGAP5Q13017 1502 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-334P-201ENST00000517072 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-334P-201ENST00000517072 KRTDAPP60985 99 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-334P-201ENST00000517072 NRKQ7Z2Y5 1582 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-334P-201ENST00000517072 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-334P-201ENST00000517072 SVEP1Q4LDE5 3571 aa-1.41□□□□□ -2.63
RNU6-334P-201ENST00000517072 A0A1B0GV90 55 aa-1.41□□□□□ -2.64
RNU6-334P-201ENST00000517072 UBR4Q5T4S7 5183 aa-1.42□□□□□ -2.64
RNU6-334P-201ENST00000517072 TGP01266 2768 aa-1.42□□□□□ -2.64
RNU6-334P-201ENST00000517072 CRIPTQ9P021 101 aa-1.42□□□□□ -2.64
RNU6-334P-201ENST00000517072 PKHD1P08F94 4074 aa-1.42□□□□□ -2.64
RNU6-334P-201ENST00000517072 NLRP1Q9C000 1473 aa-1.43□□□□□ -2.64
RNU6-334P-201ENST00000517072 A0A1B0GU69 56 aa-1.43□□□□□ -2.64
RNU6-334P-201ENST00000517072 DEFB135Q30KP9 77 aa-1.43□□□□□ -2.64
RNU6-334P-201ENST00000517072 CGREF1Q99674 301 aa-1.43□□□□□ -2.64
RNU6-334P-201ENST00000517072 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP-1.43□□□□□ -2.64
RNU6-334P-201ENST00000517072 SNCAP37840 140 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-334P-201ENST00000517072 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-334P-201ENST00000517072 S100A1P23297 94 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-334P-201ENST00000517072 VAMP8Q9BV40 100 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-334P-201ENST00000517072 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-334P-201ENST00000517072 I3L3M4 83 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-334P-201ENST00000517072 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-334P-201ENST00000517072 PZPP20742 1482 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-334P-201ENST00000517072 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-334P-201ENST00000517072 A0A087WVE0 104 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-334P-201ENST00000517072 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-334P-201ENST00000517072 TMEM203Q969S6 136 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-334P-201ENST00000517072 GNG8Q9UK08 70 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-334P-201ENST00000517072 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-334P-201ENST00000517072 TMEM262E9PQX1 116 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-334P-201ENST00000517072 H3BQF6 201 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-334P-201ENST00000517072 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-334P-201ENST00000517072 C6orf201Q7Z4U5 140 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-334P-201ENST00000517072 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-334P-201ENST00000517072 C7orf77A4D0Y5 90 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-334P-201ENST00000517072 STARD9Q9P2P6 4700 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-334P-201ENST00000517072 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-334P-201ENST00000517072 C2orf88Q9BSF0 95 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-334P-201ENST00000517072 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-334P-201ENST00000517072 COL4A6Q14031 1691 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-334P-201ENST00000517072 hADV29S1A0JD25 119 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-334P-201ENST00000517072 C9orf62Q8N4C0 152 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-334P-201ENST00000517072 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-334P-201ENST00000517072 A0A0G2JND7 137 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-334P-201ENST00000517072 MXRA5Q9NR99 2828 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-334P-201ENST00000517072 CHD1O14646 1710 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-334P-201ENST00000517072 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-334P-201ENST00000517072 H0Y9P7 68 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-334P-201ENST00000517072 SPRR2EP22531 72 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-334P-201ENST00000517072 NDUFC1O43677 76 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-334P-201ENST00000517072 HSD52Q0P140 79 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-334P-201ENST00000517072 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa-1.57□□□□□ -2.66
RNU6-334P-201ENST00000517072 CACFD1Q9UGQ2 172 aa-1.57□□□□□ -2.66
RNU6-334P-201ENST00000517072 LRRC37AA6NMS7 1700 aa-1.57□□□□□ -2.66
RNU6-334P-201ENST00000517072 DEFB107AQ8IZN7 70 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-334P-201ENST00000517072 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-334P-201ENST00000517072 GNGT1P63211 74 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-334P-201ENST00000517072 PMCHL1Q16048 86 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-334P-201ENST00000517072 PSMG4Q5JS54 123 aa-1.59□□□□□ -2.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.1 ms