RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 LINC00469Q8N7U9 141 aa11.6□□□□□ -0.55
SH3BP2-218ENST00000511185 GAGE2DQ9UEU5 116 aa11.6□□□□□ -0.55
SH3BP2-218ENST00000511185 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa11.59□□□□□ -0.55
SH3BP2-218ENST00000511185 SMIM1B2RUZ4 78 aa11.59□□□□□ -0.55
SH3BP2-218ENST00000511185 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa11.59□□□□□ -0.55
SH3BP2-218ENST00000511185 Q8IZM0 81 aa11.59□□□□□ -0.55
SH3BP2-218ENST00000511185 CST9LQ9H4G1 147 aa11.59□□□□□ -0.55
SH3BP2-218ENST00000511185 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa11.58□□□□□ -0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa11.57□□□□□ -0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 PRSS2P07478 247 aa11.57□□□□□ -0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 SEC11AP67812 179 aa11.57□□□□□ -0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 PMVKQ15126 192 aa11.57□□□□□ -0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa11.57□□□□□ -0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 MT1HL1P0DM35 61 aa11.56□□□□□ -0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa11.56□□□□□ -0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 TNXBP22105 4242 aa11.56□□□□□ -0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 LINC01549A6NIU2 74 aa11.55□□□□□ -0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa11.55□□□□□ -0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 HBDP02042 147 aa11.55□□□□□ -0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 SPINK8P0C7L1 97 aa11.55□□□□□ -0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 LINC00614P0C842 121 aa11.55□□□□□ -0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 CKS1BP61024 79 aa11.54□□□□□ -0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 PDZD11Q5EBL8 140 aa11.54□□□□□ -0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa11.54□□□□□ -0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 C6orf226Q5I0X4 101 aa11.53□□□□□ -0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 IGLC3P0DOY3 106 aa11.52□□□□□ -0.57
SH3BP2-218ENST00000511185 HMCN2Q8NDA2 5059 aa11.51□□□□□ -0.57
SH3BP2-218ENST00000511185 NDUFA6P56556 154 aa11.51□□□□□ -0.57
SH3BP2-218ENST00000511185 COX7B2Q8TF08 81 aa11.51□□□□□ -0.57
SH3BP2-218ENST00000511185 F8VRH5 84 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP2-218ENST00000511185 M0QXV9 152 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-218ENST00000511185 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-218ENST00000511185 XAGE1AQ9HD64 81 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-218ENST00000511185 CXCL5P42830 114 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-218ENST00000511185 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-218ENST00000511185 C1orf137Q5JT78 98 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-218ENST00000511185 RAB5BP61020 215 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP2-218ENST00000511185 SPINK6Q6UWN8 80 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP2-218ENST00000511185 C11orf86A6NJI1 115 aa11.46□□□□□ -0.57
SH3BP2-218ENST00000511185 ODF1Q14990 250 aa11.46□□□□□ -0.57
SH3BP2-218ENST00000511185 TRGC2P03986 189 aa11.45□□□□□ -0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 H3BRM9 83 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 ATP5LO75964 103 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 LINC00310P59036 64 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 BAGE3Q86Y29 109 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 LINC01600Q96MT4 127 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 UBE2BP63146 152 aa11.42□□□□□ -0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM19A2Q8N3H0 131 aa11.42□□□□□ -0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 IGLV7-43P04211 117 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 IFI27L1Q96BM0 104 aa11.4□□□□□ -0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM170BQ5T4T1 132 aa11.39□□□□□ -0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 C22orf24Q9Y442 160 aa11.39□□□□□ -0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 COLCA2A8K830 154 aa11.38□□□□□ -0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 SERF1AO75920 110 aa11.38□□□□□ -0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 REG3GQ6UW15 175 aa11.38□□□□□ -0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 HSBP1O75506 76 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 SCO1O75880 301 aa11.36□□□□□ -0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 PFN2P35080 140 aa11.36□□□□□ -0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa11.35□□□□□ -0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 NUPR1O60356 82 aa11.35□□□□□ -0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM223A0PJW6 202 aa11.33□□□□□ -0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 H0Y8G0 127 aa11.33□□□□□ -0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 ERG28Q9UKR5 140 aa11.33□□□□□ -0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa11.33□□□□□ -0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 H0Y9J4 135 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 KRTAP10-8P60410 259 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 TP73-AS1Q9UF72 201 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 GAGE10A6NGK3 116 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 Q8NDZ9 215 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 RPL37AP8A6NKH3 93 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 DIRC1Q969H9 104 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 LINC00167Q96N53 147 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 LEPROTL1O95214 131 aa11.28□□□□□ -0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa11.28□□□□□ -0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 VPREB1P12018 145 aa11.26□□□□□ -0.61
SH3BP2-218ENST00000511185 FABP4P15090 132 aa11.26□□□□□ -0.61
SH3BP2-218ENST00000511185 TSPEAR-AS2P59090 65 aa11.26□□□□□ -0.61
SH3BP2-218ENST00000511185 PRR26Q8N8Z3 221 aa11.26□□□□□ -0.61
SH3BP2-218ENST00000511185 NKAPP1Q8N9T2 125 aa11.26□□□□□ -0.61
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A0U1RRA0 63 aa11.25□□□□□ -0.61
SH3BP2-218ENST00000511185 PMCHL2Q9BQD1 86 aa11.25□□□□□ -0.61
SH3BP2-218ENST00000511185 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa11.24□□□□□ -0.61
SH3BP2-218ENST00000511185 IGKV2D-28P01615 120 aa11.24□□□□□ -0.61
SH3BP2-218ENST00000511185 COX17Q14061 63 aa11.24□□□□□ -0.61
SH3BP2-218ENST00000511185 UBR4Q5T4S7 5183 aa11.24□□□□□ -0.61
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF861PO60384 105 aa11.23□□□□□ -0.61
SH3BP2-218ENST00000511185 BCE1O60756 84 aa11.22□□□□□ -0.61
SH3BP2-218ENST00000511185 HIST1H2BKO60814 126 aa11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89.3 ms