RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496892.5

POLR1A-210, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 4

Gene POLR1A, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-210ENST00000496892 ZNF815PA8K554 130 aa9.42□□□□□ -0.9
POLR1A-210ENST00000496892 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa9.42□□□□□ -0.9
POLR1A-210ENST00000496892 SMIM1B2RUZ4 78 aa9.42□□□□□ -0.9
POLR1A-210ENST00000496892 APOMO95445 188 aa9.42□□□□□ -0.9
POLR1A-210ENST00000496892 MALP21145 153 aa9.42□□□□□ -0.9
POLR1A-210ENST00000496892 KRTAP10-2P60368 255 aa9.42□□□□□ -0.9
POLR1A-210ENST00000496892 C5orf38Q86SI9 138 aa9.42□□□□□ -0.9
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POLR1A-210ENST00000496892 EPM2AB3EWF7 344 aa9.41□□□□□ -0.9
POLR1A-210ENST00000496892 SFTA2Q6UW10 78 aa9.41□□□□□ -0.9
POLR1A-210ENST00000496892 C1orf43Q9BWL3 253 aa9.41□□□□□ -0.9
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POLR1A-210ENST00000496892 SCGB1D4Q6XE38 83 aa9.4□□□□□ -0.9
POLR1A-210ENST00000496892 HIGD1BQ9P298 99 aa9.4□□□□□ -0.9
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POLR1A-210ENST00000496892 TSPEAR-AS2P59090 65 aa9.38□□□□□ -0.91
POLR1A-210ENST00000496892 HERV-K104P63124 156 aa9.38□□□□□ -0.91
POLR1A-210ENST00000496892 TTC32Q5I0X7 151 aa9.38□□□□□ -0.91
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POLR1A-210ENST00000496892 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
POLR1A-210ENST00000496892 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa9.37□□□□□ -0.91
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POLR1A-210ENST00000496892 C6orf226Q5I0X4 101 aa9.37□□□□□ -0.91
POLR1A-210ENST00000496892 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa9.37□□□□□ -0.91
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POLR1A-210ENST00000496892 Q8IZM0 81 aa9.36□□□□□ -0.91
POLR1A-210ENST00000496892 TM2D2Q9BX73 214 aa9.36□□□□□ -0.91
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POLR1A-210ENST00000496892 TAL2Q16559 108 aa9.35□□□□□ -0.91
POLR1A-210ENST00000496892 C2orf91Q6ZV80 131 aa9.35□□□□□ -0.91
POLR1A-210ENST00000496892 ORAOV1Q8WV07 137 aa9.35□□□□□ -0.91
POLR1A-210ENST00000496892 Q9HAA7 133 aa9.35□□□□□ -0.91
POLR1A-210ENST00000496892 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa9.34□□□□□ -0.91
POLR1A-210ENST00000496892 M0R143 59 aa9.34□□□□□ -0.91
POLR1A-210ENST00000496892 CKS1BP61024 79 aa9.34□□□□□ -0.91
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POLR1A-210ENST00000496892 A0A0J9YXY3 114 aa9.33□□□□□ -0.92
POLR1A-210ENST00000496892 TMEM238C9JI98 176 aa9.33□□□□□ -0.92
POLR1A-210ENST00000496892 TIMM17BO60830 172 aa9.33□□□□□ -0.92
POLR1A-210ENST00000496892 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa9.33□□□□□ -0.92
POLR1A-210ENST00000496892 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
POLR1A-210ENST00000496892 F8WDY8 70 aa9.32□□□□□ -0.92
POLR1A-210ENST00000496892 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP9.32□□□□□ -0.922e-7■■□□□ 14.2
POLR1A-210ENST00000496892 Q5VSD8 79 aa9.32□□□□□ -0.92
POLR1A-210ENST00000496892 HIST1H4GQ99525 98 aa9.32□□□□□ -0.92
POLR1A-210ENST00000496892 TP73-AS1Q9UF72 201 aa9.32□□□□□ -0.92
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POLR1A-210ENST00000496892 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa9.31□□□□□ -0.92
POLR1A-210ENST00000496892 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa9.31□□□□□ -0.92
POLR1A-210ENST00000496892 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
POLR1A-210ENST00000496892 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa9.3□□□□□ -0.92
POLR1A-210ENST00000496892 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP9.3□□□□□ -0.92
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POLR1A-210ENST00000496892 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa9.28□□□□□ -0.92
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POLR1A-210ENST00000496892 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
POLR1A-210ENST00000496892 CEND1Q8N111 149 aa9.27□□□□□ -0.93
POLR1A-210ENST00000496892 C2orf48Q96LS8 159 aa9.27□□□□□ -0.93
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POLR1A-210ENST00000496892 A6NJY4 79 aa9.26□□□□□ -0.93
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POLR1A-210ENST00000496892 COX17Q14061 63 aa9.26□□□□□ -0.93
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POLR1A-210ENST00000496892 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa9.26□□□□□ -0.93
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POLR1A-210ENST00000496892 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
POLR1A-210ENST00000496892 A6NDN8 102 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-210ENST00000496892 PTTG1IPP53801 180 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-210ENST00000496892 BATFQ16520 125 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-210ENST00000496892 LINC00158P58513 81 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-210ENST00000496892 RPL24P83731 157 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-210ENST00000496892 C14orf177Q52M58 125 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-210ENST00000496892 C15orf56Q8N910 161 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-210ENST00000496892 CAMK2N2Q96S95 79 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-210ENST00000496892 LITAFQ99732 161 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-210ENST00000496892 SNHG12Q9BXW3 62 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-210ENST00000496892 ERG28Q9UKR5 140 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-210ENST00000496892 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-210ENST00000496892 USP17L23D6RBM5 183 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-210ENST00000496892 EREGO14944 169 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-210ENST00000496892 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
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