RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494956.1

NELFE-213, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-213ENST00000494956 C10orf91Q5T1B1 145 aa6.5□□□□□ -1.37
NELFE-213ENST00000494956 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa6.5□□□□□ -1.37
NELFE-213ENST00000494956 LINC00469Q8N7U9 141 aa6.5□□□□□ -1.37
NELFE-213ENST00000494956 SCGB3A1Q96QR1 104 aa6.5□□□□□ -1.37
NELFE-213ENST00000494956 GNB1LQ9BYB4 327 aa6.5□□□□□ -1.37
NELFE-213ENST00000494956 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.49□□□□□ -1.37
NELFE-213ENST00000494956 FABP9Q0Z7S8 132 aa6.49□□□□□ -1.37
NELFE-213ENST00000494956 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
NELFE-213ENST00000494956 TIMM17AQ99595 171 aa6.49□□□□□ -1.37
NELFE-213ENST00000494956 LINC01546A6NGU7 62 aa6.48□□□□□ -1.37
NELFE-213ENST00000494956 PRSS2P07478 247 aa6.48□□□□□ -1.37
NELFE-213ENST00000494956 NPSP0C0P6 89 aa6.48□□□□□ -1.37
NELFE-213ENST00000494956 KRTAP10-8P60410 259 aa6.48□□□□□ -1.37
NELFE-213ENST00000494956 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.48□□□□□ -1.37
NELFE-213ENST00000494956 REG3GQ6UW15 175 aa6.48□□□□□ -1.37
NELFE-213ENST00000494956 ERASQ7Z444 233 aa6.48□□□□□ -1.37
NELFE-213ENST00000494956 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.48□□□□□ -1.37
NELFE-213ENST00000494956 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
NELFE-213ENST00000494956 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
NELFE-213ENST00000494956 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.47□□□□□ -1.37
NELFE-213ENST00000494956 M0QXV9 152 aa6.47□□□□□ -1.37
NELFE-213ENST00000494956 CKS1BP61024 79 aa6.47□□□□□ -1.37
NELFE-213ENST00000494956 HERVK_113P63121 156 aa6.47□□□□□ -1.37
NELFE-213ENST00000494956 Q8IZM0 81 aa6.47□□□□□ -1.37
NELFE-213ENST00000494956 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa6.47□□□□□ -1.37
NELFE-213ENST00000494956 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.47□□□□□ -1.37
NELFE-213ENST00000494956 A0A096LNJ9 63 aa6.46□□□□□ -1.38
NELFE-213ENST00000494956 SMIM1B2RUZ4 78 aa6.46□□□□□ -1.38
NELFE-213ENST00000494956 IGLV7-43P04211 117 aa6.46□□□□□ -1.38
NELFE-213ENST00000494956 RHEBQ15382 184 aa6.46□□□□□ -1.38
NELFE-213ENST00000494956 PMCHL1Q16048 86 aa6.46□□□□□ -1.38
NELFE-213ENST00000494956 FA2HQ7L5A8 372 aa6.46□□□□□ -1.38
NELFE-213ENST00000494956 CST9LQ9H4G1 147 aa6.46□□□□□ -1.38
NELFE-213ENST00000494956 HMCN2Q8NDA2 5059 aa6.46□□□□□ -1.38
NELFE-213ENST00000494956 SPINK8P0C7L1 97 aa6.45□□□□□ -1.38
NELFE-213ENST00000494956 G0S2P27469 103 aa6.45□□□□□ -1.38
NELFE-213ENST00000494956 UBE2BP63146 152 aa6.45□□□□□ -1.38
NELFE-213ENST00000494956 SEC11AP67812 179 aa6.45□□□□□ -1.38
NELFE-213ENST00000494956 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa6.45□□□□□ -1.38
NELFE-213ENST00000494956 SMCO4Q9NRQ5 59 aa6.45□□□□□ -1.38
NELFE-213ENST00000494956 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa6.44□□□□□ -1.38
NELFE-213ENST00000494956 APOC3P02656 99 aa6.44□□□□□ -1.38
NELFE-213ENST00000494956 COX19Q49B96 90 aa6.44□□□□□ -1.38
NELFE-213ENST00000494956 C18orf32Q8TCD1 76 aa6.44□□□□□ -1.38
NELFE-213ENST00000494956 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa6.44□□□□□ -1.38
NELFE-213ENST00000494956 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa6.43□□□□□ -1.38
NELFE-213ENST00000494956 F8VRH5 84 aa6.43□□□□□ -1.38
NELFE-213ENST00000494956 PMVKQ15126 192 aa6.43□□□□□ -1.38
NELFE-213ENST00000494956 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.43□□□□□ -1.38
NELFE-213ENST00000494956 COX7B2Q8TF08 81 aa6.43□□□□□ -1.38
NELFE-213ENST00000494956 NDUFA6P56556 154 aa6.42□□□□□ -1.38
NELFE-213ENST00000494956 RAB5BP61020 215 aa6.42□□□□□ -1.38
NELFE-213ENST00000494956 PDZD11Q5EBL8 140 aa6.42□□□□□ -1.38
NELFE-213ENST00000494956 C22orf24Q9Y442 160 aa6.42□□□□□ -1.38
NELFE-213ENST00000494956 H0Y9J4 135 aa6.41□□□□□ -1.38
NELFE-213ENST00000494956 LINC00614P0C842 121 aa6.41□□□□□ -1.38
NELFE-213ENST00000494956 TNXBP22105 4242 aa6.41□□□□□ -1.38
NELFE-213ENST00000494956 DIRC1Q969H9 104 aa6.4□□□□□ -1.38
NELFE-213ENST00000494956 SCO1O75880 301 aa6.39□□□□□ -1.39
NELFE-213ENST00000494956 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.39□□□□□ -1.39
NELFE-213ENST00000494956 IGLC3P0DOY3 106 aa6.39□□□□□ -1.39
NELFE-213ENST00000494956 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
NELFE-213ENST00000494956 CXCL5P42830 114 aa6.39□□□□□ -1.39
NELFE-213ENST00000494956 YPEL4Q96NS1 127 aa6.39□□□□□ -1.39
NELFE-213ENST00000494956 GAGE10A6NGK3 116 aa6.38□□□□□ -1.39
NELFE-213ENST00000494956 LINC01549A6NIU2 74 aa6.38□□□□□ -1.39
NELFE-213ENST00000494956 RPL37AP8A6NKH3 93 aa6.38□□□□□ -1.39
NELFE-213ENST00000494956 SNAPINO95295 136 aa6.38□□□□□ -1.39
NELFE-213ENST00000494956 HBDP02042 147 aa6.38□□□□□ -1.39
NELFE-213ENST00000494956 SVBPQ8N300 66 aa6.38□□□□□ -1.39
NELFE-213ENST00000494956 CDIP1Q9H305 208 aa6.38□□□□□ -1.39
NELFE-213ENST00000494956 C11orf86A6NJI1 115 aa6.37□□□□□ -1.39
NELFE-213ENST00000494956 PFN2P35080 140 aa6.37□□□□□ -1.39
NELFE-213ENST00000494956 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
NELFE-213ENST00000494956 BAGE3Q86Y29 109 aa6.37□□□□□ -1.39
NELFE-213ENST00000494956 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
NELFE-213ENST00000494956 LINC00167Q96N53 147 aa6.37□□□□□ -1.39
NELFE-213ENST00000494956 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.36□□□□□ -1.39
NELFE-213ENST00000494956 H3BRM9 83 aa6.36□□□□□ -1.39
NELFE-213ENST00000494956 NDUFA5Q16718 116 aa6.36□□□□□ -1.39
NELFE-213ENST00000494956 CBLN2Q8IUK8 224 aa6.36□□□□□ -1.39
NELFE-213ENST00000494956 ZNF861PO60384 105 aa6.35□□□□□ -1.39
NELFE-213ENST00000494956 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
NELFE-213ENST00000494956 ATP5LO75964 103 aa6.34□□□□□ -1.39
NELFE-213ENST00000494956 TMEM170BQ5T4T1 132 aa6.34□□□□□ -1.39
NELFE-213ENST00000494956 Q8NDZ9 215 aa6.34□□□□□ -1.39
NELFE-213ENST00000494956 TP73-AS1Q9UF72 201 aa6.34□□□□□ -1.39
NELFE-213ENST00000494956 UBR4Q5T4S7 5183 aa6.34□□□□□ -1.39
NELFE-213ENST00000494956 NUPR1O60356 82 aa6.33□□□□□ -1.4
NELFE-213ENST00000494956 FAM19A2Q8N3H0 131 aa6.33□□□□□ -1.4
NELFE-213ENST00000494956 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
NELFE-213ENST00000494956 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa6.32□□□□□ -1.4
NELFE-213ENST00000494956 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa6.32□□□□□ -1.4
NELFE-213ENST00000494956 A0A0U1RRA0 63 aa6.32□□□□□ -1.4
NELFE-213ENST00000494956 BCE1O60756 84 aa6.32□□□□□ -1.4
NELFE-213ENST00000494956 IGKV2D-28P01615 120 aa6.32□□□□□ -1.4
NELFE-213ENST00000494956 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa6.32□□□□□ -1.4
NELFE-213ENST00000494956 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.32□□□□□ -1.4
NELFE-213ENST00000494956 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.32□□□□□ -1.4
NELFE-213ENST00000494956 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.32□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.5 ms