RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 LINC00612Q8N6U2 182 aa8.96□□□□□ -0.97
PRAME-213ENST00000492657 LINC01600Q96MT4 127 aa8.96□□□□□ -0.97
PRAME-213ENST00000492657 C9orf66Q5T8R8 295 aa8.95□□□□□ -0.98
PRAME-213ENST00000492657 C5orf38Q86SI9 138 aa8.95□□□□□ -0.98
PRAME-213ENST00000492657 Q9HAA7 133 aa8.95□□□□□ -0.98
PRAME-213ENST00000492657 C9orf153Q5TBE3 101 aa8.94□□□□□ -0.98
PRAME-213ENST00000492657 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa8.94□□□□□ -0.98
PRAME-213ENST00000492657 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa8.94□□□□□ -0.98
PRAME-213ENST00000492657 CLPSL2Q6UWE3 100 aa8.94□□□□□ -0.98
PRAME-213ENST00000492657 COX7B2Q8TF08 81 aa8.94□□□□□ -0.98
PRAME-213ENST00000492657 CYSTM1Q9H1C7 97 aa8.93□□□□□ -0.98
PRAME-213ENST00000492657 STAB1Q9NY15 2570 aa8.93□□□□□ -0.98
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PRAME-213ENST00000492657 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa8.92□□□□□ -0.98
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PRAME-213ENST00000492657 PRO0255Q9UI72 69 aa8.92□□□□□ -0.98
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PRAME-213ENST00000492657 Q8N3U1 123 aa8.91□□□□□ -0.98
PRAME-213ENST00000492657 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa8.91□□□□□ -0.98
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PRAME-213ENST00000492657 CELA1Q9UNI1 258 aa8.9□□□□□ -0.98
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PRAME-213ENST00000492657 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa8.86□□□□□ -0.99
PRAME-213ENST00000492657 A0A1B0GUV1 79 aa8.85□□□□□ -0.99
PRAME-213ENST00000492657 C3orf22Q8N5N4 141 aa8.85□□□□□ -0.99
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PRAME-213ENST00000492657 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa8.85□□□□□ -0.99
PRAME-213ENST00000492657 C6orf226Q5I0X4 101 aa8.85□□□□□ -0.99
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PRAME-213ENST00000492657 SS18Q15532 418 aa8.84□□□□□ -0.99
PRAME-213ENST00000492657 C14orf132Q9NPU4 83 aa8.84□□□□□ -0.99
PRAME-213ENST00000492657 NOTCH1P46531 2555 aa8.84□□□□□ -0.99
PRAME-213ENST00000492657 WFDC9Q8NEX5 89 aa8.83□□□□□ -1
PRAME-213ENST00000492657 TMEM126AQ9H061 195 aa8.82□□□□□ -1
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PRAME-213ENST00000492657 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa8.81□□□□□ -1
PRAME-213ENST00000492657 RPL28P46779 137 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
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PRAME-213ENST00000492657 MIFP14174 115 aa8.8□□□□□ -1
PRAME-213ENST00000492657 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
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PRAME-213ENST00000492657 SPART-AS1P0CW21 52 aa8.8□□□□□ -1
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PRAME-213ENST00000492657 RETNQ9HD89 108 aa8.79□□□□□ -1
PRAME-213ENST00000492657 DNAL4O96015 105 aa8.79□□□□□ -1
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PRAME-213ENST00000492657 DSCR8Q96T75 97 aa8.78□□□□□ -1
PRAME-213ENST00000492657 NCR3O14931 201 aa8.78□□□□□ -1
PRAME-213ENST00000492657 Q8IZM0 81 aa8.78□□□□□ -1
PRAME-213ENST00000492657 LINC00526Q96FQ7 95 aa8.78□□□□□ -1
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PRAME-213ENST00000492657 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1
PRAME-213ENST00000492657 CD164L2Q6UWJ8 174 aa8.77□□□□□ -1
PRAME-213ENST00000492657 A0A1B0GX51 115 aa8.77□□□□□ -1.01
PRAME-213ENST00000492657 KRTAP10-11P60412 298 aa8.77□□□□□ -1.01
PRAME-213ENST00000492657 PRR3P79522 188 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
PRAME-213ENST00000492657 COX7CP15954 63 aa8.76□□□□□ -1.01
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