RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490435.5

ITGA4-211, Transcript of integrin subunit alpha 4, humanhuman

TSL 5

Gene ITGA4, Length 720 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4-211ENST00000490435 CFAP46Q8IYW2 2715 aa-0.97□□□□□ -2.57
ITGA4-211ENST00000490435 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP-0.97□□□□□ -2.57
ITGA4-211ENST00000490435 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa-0.98□□□□□ -2.57
ITGA4-211ENST00000490435 TLN2Q9Y4G6 2542 aa-0.98□□□□□ -2.57
ITGA4-211ENST00000490435 DEFB1P60022 68 aa-0.98□□□□□ -2.57
ITGA4-211ENST00000490435 DEFB112Q30KQ8 113 aa-0.98□□□□□ -2.57
ITGA4-211ENST00000490435 BAGE2Q86Y30 109 aa-0.98□□□□□ -2.57
ITGA4-211ENST00000490435 COPS9Q8WXC6 57 aa-0.98□□□□□ -2.57
ITGA4-211ENST00000490435 SERP1Q9Y6X1 66 aa-0.98□□□□□ -2.57
ITGA4-211ENST00000490435 ZZEF1O43149 2961 aa-0.98□□□□□ -2.57
ITGA4-211ENST00000490435 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP-0.98□□□□□ -2.57
ITGA4-211ENST00000490435 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP-0.98□□□□□ -2.57
ITGA4-211ENST00000490435 DNAJC13O75165 2243 aa-0.99□□□□□ -2.57
ITGA4-211ENST00000490435 DMXL1Q9Y485 3027 aa-0.99□□□□□ -2.57
ITGA4-211ENST00000490435 F8VRH5 84 aa-0.99□□□□□ -2.57
ITGA4-211ENST00000490435 UQCR11O14957 56 aa-0.99□□□□□ -2.57
ITGA4-211ENST00000490435 SPRR1BP22528 89 aa-0.99□□□□□ -2.57
ITGA4-211ENST00000490435 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP-0.99□□□□□ -2.57
ITGA4-211ENST00000490435 FRYQ5TBA9 3013 aa-0.99□□□□□ -2.57
ITGA4-211ENST00000490435 DMDP11532 3685 aa-0.99□□□□□ -2.57
ITGA4-211ENST00000490435 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP-1□□□□□ -2.57
ITGA4-211ENST00000490435 COL4A6Q14031 1691 aa-1□□□□□ -2.57
ITGA4-211ENST00000490435 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP-1□□□□□ -2.57
ITGA4-211ENST00000490435 WDR7Q9Y4E6 1490 aa-1□□□□□ -2.57
ITGA4-211ENST00000490435 ATMQ13315 3056 aa-1□□□□□ -2.57
ITGA4-211ENST00000490435 IGLC7A0M8Q6 106 aa-1.01□□□□□ -2.57
ITGA4-211ENST00000490435 COX6B1P14854 86 aa-1.01□□□□□ -2.57
ITGA4-211ENST00000490435 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa-1.01□□□□□ -2.57
ITGA4-211ENST00000490435 MGST2Q99735 147 aa-1.01□□□□□ -2.57
ITGA4-211ENST00000490435 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa-1.01□□□□□ -2.57
ITGA4-211ENST00000490435 ADAMTS12P58397 1594 aa-1.01□□□□□ -2.57
ITGA4-211ENST00000490435 BTAF1O14981 1849 aa-1.01□□□□□ -2.57
ITGA4-211ENST00000490435 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa-1.02□□□□□ -2.57
ITGA4-211ENST00000490435 CEP290O15078 2479 aa-1.02□□□□□ -2.57
ITGA4-211ENST00000490435 TPPP2P59282 170 aa-1.02□□□□□ -2.57
ITGA4-211ENST00000490435 SHROOM2Q13796 1616 aa-1.02□□□□□ -2.57
ITGA4-211ENST00000490435 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa-1.02□□□□□ -2.57
ITGA4-211ENST00000490435 DEFB123Q8N688 67 aa-1.02□□□□□ -2.57
ITGA4-211ENST00000490435 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa-1.02□□□□□ -2.57
ITGA4-211ENST00000490435 TSLPQ969D9 159 aa-1.02□□□□□ -2.57
ITGA4-211ENST00000490435 PTPN23Q9H3S7 1636 aa-1.02□□□□□ -2.57
ITGA4-211ENST00000490435 DYNLRB1Q9NP97 96 aa-1.02□□□□□ -2.57
ITGA4-211ENST00000490435 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa-1.02□□□□□ -2.57
ITGA4-211ENST00000490435 SPEGQ15772 3267 aa-1.03□□□□□ -2.57
ITGA4-211ENST00000490435 LRBAP50851 2863 aa-1.03□□□□□ -2.57
ITGA4-211ENST00000490435 APOC3P02656 99 aa-1.03□□□□□ -2.57
ITGA4-211ENST00000490435 ASIPP42127 132 aa-1.03□□□□□ -2.57
ITGA4-211ENST00000490435 DEFB135Q30KP9 77 aa-1.03□□□□□ -2.57
ITGA4-211ENST00000490435 TRANK1O15050 2925 aa-1.03□□□□□ -2.57
ITGA4-211ENST00000490435 MYOM1P52179 1685 aa-1.04□□□□□ -2.58
ITGA4-211ENST00000490435 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP-1.04□□□□□ -2.58
ITGA4-211ENST00000490435 TNFP01375 233 aa-1.04□□□□□ -2.58
ITGA4-211ENST00000490435 LINC00470Q9BZP3 86 aa-1.04□□□□□ -2.58
ITGA4-211ENST00000490435 WDFY4Q6ZS81 3184 aa-1.04□□□□□ -2.58
ITGA4-211ENST00000490435 TCHHQ07283 1943 aa-1.05□□□□□ -2.58
ITGA4-211ENST00000490435 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP-1.05□□□□□ -2.58
ITGA4-211ENST00000490435 DCHS1Q96JQ0 3298 aa-1.05□□□□□ -2.58
ITGA4-211ENST00000490435 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa-1.05□□□□□ -2.58
ITGA4-211ENST00000490435 BPTFQ12830 3046 aa-1.05□□□□□ -2.58
ITGA4-211ENST00000490435 LOC730098B7Z3J9 87 aa-1.05□□□□□ -2.58
ITGA4-211ENST00000490435 HMGN4O00479 90 aa-1.05□□□□□ -2.58
ITGA4-211ENST00000490435 SELENOWP63302 87 aa-1.05□□□□□ -2.58
ITGA4-211ENST00000490435 MEIG1Q5JSS6 88 aa-1.05□□□□□ -2.58
ITGA4-211ENST00000490435 ARL11Q969Q4 196 aa-1.05□□□□□ -2.58
ITGA4-211ENST00000490435 NAA60Q9H7X0 242 aa-1.05□□□□□ -2.58
ITGA4-211ENST00000490435 S4R3F8 94 aa-1.05□□□□□ -2.58
ITGA4-211ENST00000490435 FREM2Q5SZK8 3169 aa-1.05□□□□□ -2.58
ITGA4-211ENST00000490435 VPS13CQ709C8 3753 aa-1.05□□□□□ -2.58
ITGA4-211ENST00000490435 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP-1.06□□□□□ -2.58
ITGA4-211ENST00000490435 FMN2Q9NZ56 1722 aa-1.06□□□□□ -2.58
ITGA4-211ENST00000490435 CENPEQ02224 2701 aa-1.06□□□□□ -2.58
ITGA4-211ENST00000490435 H3BNG1 76 aa-1.06□□□□□ -2.58
ITGA4-211ENST00000490435 SPANXDQ9BXN6 97 aa-1.06□□□□□ -2.58
ITGA4-211ENST00000490435 ARHGEF5Q12774 1597 aa-1.06□□□□□ -2.58
ITGA4-211ENST00000490435 MBD5Q9P267 1494 aa-1.06□□□□□ -2.58
ITGA4-211ENST00000490435 NSD3Q9BZ95 1437 aa-1.06□□□□□ -2.58
ITGA4-211ENST00000490435 K7EP34 96 aa-1.07□□□□□ -2.58
ITGA4-211ENST00000490435 GNG7O60262 68 aa-1.07□□□□□ -2.58
ITGA4-211ENST00000490435 BTG2P78543 158 aa-1.07□□□□□ -2.58
ITGA4-211ENST00000490435 PPP3R2Q96LZ3 170 aa-1.07□□□□□ -2.58
ITGA4-211ENST00000490435 MAP3K1Q13233 1512 aa-1.07□□□□□ -2.58
ITGA4-211ENST00000490435 TULP4Q9NRJ4 1543 aa-1.07□□□□□ -2.58
ITGA4-211ENST00000490435 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa-1.07□□□□□ -2.58
ITGA4-211ENST00000490435 GAPVD1Q14C86 1478 aa-1.07□□□□□ -2.58
ITGA4-211ENST00000490435 SHANK2Q9UPX8 1470 aa-1.07□□□□□ -2.58
ITGA4-211ENST00000490435 MUC3AQ02505 3323 aa-1.08□□□□□ -2.58
ITGA4-211ENST00000490435 Q56UQ5 140 aa-1.08□□□□□ -2.58
ITGA4-211ENST00000490435 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa-1.08□□□□□ -2.58
ITGA4-211ENST00000490435 QRICH2Q9H0J4 1663 aa-1.09□□□□□ -2.58
ITGA4-211ENST00000490435 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP-1.09□□□□□ -2.58
ITGA4-211ENST00000490435 FAM25AB3EWG3 89 aa-1.09□□□□□ -2.58
ITGA4-211ENST00000490435 FAM25CB3EWG5 89 aa-1.09□□□□□ -2.58
ITGA4-211ENST00000490435 FAM25GB3EWG6 89 aa-1.09□□□□□ -2.58
ITGA4-211ENST00000490435 SFT2D2O95562 160 aa-1.09□□□□□ -2.58
ITGA4-211ENST00000490435 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa-1.1□□□□□ -2.59
ITGA4-211ENST00000490435 C9orf92A6NGG3 77 aa-1.1□□□□□ -2.59
ITGA4-211ENST00000490435 NDUFA2O43678 99 aa-1.1□□□□□ -2.59
ITGA4-211ENST00000490435 MGAQ8IWI9 3026 aa-1.1□□□□□ -2.59
ITGA4-211ENST00000490435 DEFB4AO15263 64 aa-1.11□□□□□ -2.59
ITGA4-211ENST00000490435 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP-1.11□□□□□ -2.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms