RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486539.1

CACNA2D1-211, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1, humanhuman

TSL 5

Gene CACNA2D1, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1-211ENST00000486539 ERVS71-1P61550 626 aa-1.38□□□□□ -2.63
CACNA2D1-211ENST00000486539 NPC2P61916 151 aa-1.38□□□□□ -2.63
CACNA2D1-211ENST00000486539 PP6455Q8WZ26 134 aa-1.38□□□□□ -2.63
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMEM141Q96I45 108 aa-1.38□□□□□ -2.63
CACNA2D1-211ENST00000486539 CCDC42Q96M95 316 aa-1.38□□□□□ -2.63
CACNA2D1-211ENST00000486539 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP-1.38□□□□□ -2.63
CACNA2D1-211ENST00000486539 FAIMQ9NVQ4 179 aa-1.38□□□□□ -2.63
CACNA2D1-211ENST00000486539 IQGAP3Q86VI3 1631 aa-1.39□□□□□ -2.63
CACNA2D1-211ENST00000486539 BANF1O75531 89 aa-1.39□□□□□ -2.63
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR2H2O95918 312 aa-1.39□□□□□ -2.63
CACNA2D1-211ENST00000486539 HLA-DRB4P13762 266 aa-1.39□□□□□ -2.63
CACNA2D1-211ENST00000486539 OGNP20774 298 aaKnown RBP-1.39□□□□□ -2.63
CACNA2D1-211ENST00000486539 NCALDP61601 193 aa-1.39□□□□□ -2.63
CACNA2D1-211ENST00000486539 RTL8BQ17RB0 113 aa-1.39□□□□□ -2.63
CACNA2D1-211ENST00000486539 LIN52Q52LA3 116 aa-1.39□□□□□ -2.63
CACNA2D1-211ENST00000486539 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa-1.39□□□□□ -2.63
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR5A2Q8NGI9 324 aa-1.39□□□□□ -2.63
CACNA2D1-211ENST00000486539 MYOZ3Q8TDC0 251 aa-1.39□□□□□ -2.63
CACNA2D1-211ENST00000486539 CLEC2BQ92478 149 aa-1.39□□□□□ -2.63
CACNA2D1-211ENST00000486539 SPRR4Q96PI1 79 aa-1.39□□□□□ -2.63
CACNA2D1-211ENST00000486539 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP-1.39□□□□□ -2.63
CACNA2D1-211ENST00000486539 DDA1Q9BW61 102 aa-1.39□□□□□ -2.63
CACNA2D1-211ENST00000486539 CBLN4Q9NTU7 201 aa-1.39□□□□□ -2.63
CACNA2D1-211ENST00000486539 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa-1.39□□□□□ -2.63
CACNA2D1-211ENST00000486539 ANKRD36A6QL64 1941 aa-1.39□□□□□ -2.63
CACNA2D1-211ENST00000486539 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP-1.4□□□□□ -2.63
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMEM189A5PLL7 270 aa-1.4□□□□□ -2.63
CACNA2D1-211ENST00000486539 FAM223BA6NKX1 122 aa-1.4□□□□□ -2.63
CACNA2D1-211ENST00000486539 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP-1.4□□□□□ -2.63
CACNA2D1-211ENST00000486539 SPINK4O60575 86 aa-1.4□□□□□ -2.63
CACNA2D1-211ENST00000486539 RPP14O95059 124 aaKnown RBP-1.4□□□□□ -2.63
CACNA2D1-211ENST00000486539 NCR2O95944 276 aa-1.4□□□□□ -2.63
CACNA2D1-211ENST00000486539 SPINK8P0C7L1 97 aa-1.4□□□□□ -2.63
CACNA2D1-211ENST00000486539 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP-1.4□□□□□ -2.63
CACNA2D1-211ENST00000486539 IL20Q9NYY1 176 aa-1.4□□□□□ -2.63
CACNA2D1-211ENST00000486539 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa-1.4□□□□□ -2.63
CACNA2D1-211ENST00000486539 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP-1.4□□□□□ -2.63
CACNA2D1-211ENST00000486539 CEP162Q5TB80 1403 aa-1.4□□□□□ -2.63
CACNA2D1-211ENST00000486539 PRXQ9BXM0 1461 aa-1.41□□□□□ -2.63
CACNA2D1-211ENST00000486539 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa-1.41□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 A0A096LPF7 62 aa-1.41□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 NDUFC2O95298 119 aa-1.41□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 CST2P09228 141 aa-1.41□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 CCL7P80098 99 aa-1.41□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 TSLPQ969D9 159 aa-1.41□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 PRAP1Q96NZ9 151 aa-1.41□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 RBAKDNA6NC62 111 aa-1.42□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 RIIAD1A6NNX1 92 aa-1.42□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 H3BUX3 64 aa-1.42□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 NDUFA4O00483 81 aa-1.42□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 BCE1O60756 84 aa-1.42□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 TPM3P06753 285 aa-1.42□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 ACYP2P14621 99 aa-1.42□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 FGF7P21781 194 aa-1.42□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 BLCAPP62952 87 aa-1.42□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 AKIRIN2Q53H80 203 aa-1.42□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 SS18L2Q9UHA2 77 aa-1.42□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 PRNDQ9UKY0 176 aa-1.42□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 FANCD2Q9BXW9 1451 aa-1.43□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMEM14DPA8MWL7 114 aa-1.43□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 PPP5D1E7EU14 171 aa-1.43□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa-1.43□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 H7BZZ5 65 aa-1.43□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 CDC42EP2O14613 210 aa-1.43□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 APOA2P02652 100 aa-1.43□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 RPS17P08708 135 aaKnown RBP-1.43□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 APELAP0DMC3 54 aa-1.43□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 DEFB130BP0DP73 79 aa-1.43□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 DEFB130AP0DP74 79 aa-1.43□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 COX4I1P13073 169 aa-1.43□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 IL7P13232 177 aa-1.43□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 TPT1P13693 172 aaKnown RBP-1.43□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP-1.43□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 TAS2R41P59536 307 aa-1.43□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 NCMAPQ5T1S8 102 aa-1.43□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 FAM223AQ8IWN6 122 aa-1.43□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 NEK7Q8TDX7 302 aa-1.43□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 AP3S1Q92572 193 aa-1.43□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 COX14Q96I36 57 aa-1.43□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 SH3BGRL3Q9H299 93 aa-1.43□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 PYCARDQ9ULZ3 195 aa-1.43□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP-1.43□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 CNTLNQ9NXG0 1405 aa-1.43□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 C5orf58C9J3I9 102 aa-1.44□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 G3V318 75 aa-1.44□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 H7C1C5 153 aa-1.44□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 EDF1O60869 148 aaKnown RBP-1.44□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 APOC1P02654 83 aa-1.44□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 CEBPGP53567 150 aa-1.44□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 LCN6P62502 163 aa-1.44□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 VSTM2AQ8TAG5 236 aa-1.44□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 MAFIPQ8WZ33 124 aa-1.44□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP-1.44□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 BATF3Q9NR55 127 aa-1.44□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP-1.44□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLC22A13Q9Y226 551 aa-1.44□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa-1.45□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 H3BQV1 296 aa-1.45□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 CCL3L1P16619 93 aa-1.45□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 GCHFRP30047 84 aa-1.45□□□□□ -2.64
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