RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475302.1

ITGA6-210, Transcript of integrin subunit alpha 6, humanhuman

TSL 3

Gene ITGA6, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6-210ENST00000475302 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.5□□□□□ -1.37
ITGA6-210ENST00000475302 C5orf38Q86SI9 138 aa6.5□□□□□ -1.37
ITGA6-210ENST00000475302 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
ITGA6-210ENST00000475302 KLK12Q9UKR0 248 aa6.5□□□□□ -1.37
ITGA6-210ENST00000475302 LINC00588Q9Y4M8 146 aa6.5□□□□□ -1.37
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ITGA6-210ENST00000475302 KIAA0087Q14695 138 aa6.49□□□□□ -1.37
ITGA6-210ENST00000475302 CLPSL2Q6UWE3 100 aa6.49□□□□□ -1.37
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ITGA6-210ENST00000475302 Q6ZVH6 145 aa6.49□□□□□ -1.37
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ITGA6-210ENST00000475302 UPK3BQ9BT76 320 aa6.48□□□□□ -1.37
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ITGA6-210ENST00000475302 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa6.47□□□□□ -1.37
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ITGA6-210ENST00000475302 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.46□□□□□ -1.38
ITGA6-210ENST00000475302 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
ITGA6-210ENST00000475302 COX11Q9Y6N1 276 aa6.46□□□□□ -1.38
ITGA6-210ENST00000475302 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
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ITGA6-210ENST00000475302 A6NDN8 102 aa6.45□□□□□ -1.38
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ITGA6-210ENST00000475302 TMEM238C9JI98 176 aa6.45□□□□□ -1.38
ITGA6-210ENST00000475302 COX7A2LO14548 114 aa6.45□□□□□ -1.38
ITGA6-210ENST00000475302 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.45□□□□□ -1.38
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ITGA6-210ENST00000475302 COL7A1Q02388 2944 aa6.45□□□□□ -1.38
ITGA6-210ENST00000475302 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6.44□□□□□ -1.38
ITGA6-210ENST00000475302 K7ERJ3 54 aa6.44□□□□□ -1.38
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ITGA6-210ENST00000475302 SMIM13P0DJ93 91 aa6.44□□□□□ -1.38
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ITGA6-210ENST00000475302 UBE2WQ96B02 151 aa6.44□□□□□ -1.38
ITGA6-210ENST00000475302 A4D1N5 150 aa6.43□□□□□ -1.38
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ITGA6-210ENST00000475302 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
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ITGA6-210ENST00000475302 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.41□□□□□ -1.38
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ITGA6-210ENST00000475302 C15orf56Q8N910 161 aa6.4□□□□□ -1.38
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ITGA6-210ENST00000475302 C10orf25Q5T742 122 aa6.39□□□□□ -1.39
ITGA6-210ENST00000475302 C6orf223Q8N319 242 aa6.39□□□□□ -1.39
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ITGA6-210ENST00000475302 COX17Q14061 63 aa6.37□□□□□ -1.39
ITGA6-210ENST00000475302 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.37□□□□□ -1.39
ITGA6-210ENST00000475302 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.37□□□□□ -1.39
ITGA6-210ENST00000475302 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
ITGA6-210ENST00000475302 C1orf43Q9BWL3 253 aa6.37□□□□□ -1.39
ITGA6-210ENST00000475302 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.37□□□□□ -1.39
ITGA6-210ENST00000475302 TSPAN13O95857 204 aa6.36□□□□□ -1.39
ITGA6-210ENST00000475302 CKS1BP61024 79 aa6.36□□□□□ -1.39
ITGA6-210ENST00000475302 CASC10Q5T4H9 136 aa6.36□□□□□ -1.39
ITGA6-210ENST00000475302 LINC00526Q96FQ7 95 aa6.36□□□□□ -1.39
ITGA6-210ENST00000475302 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa6.35□□□□□ -1.39
ITGA6-210ENST00000475302 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa6.35□□□□□ -1.39
ITGA6-210ENST00000475302 F8WDY8 70 aa6.35□□□□□ -1.39
ITGA6-210ENST00000475302 IGKV2D-28P01615 120 aa6.35□□□□□ -1.39
ITGA6-210ENST00000475302 LINC00158P58513 81 aa6.35□□□□□ -1.39
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