RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469653.5

SEMA4D-215, Transcript of semaphorin 4D, humanhuman

TSL 2

Gene SEMA4D, Length 3,533 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4D-215ENST00000469653 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa7.18□□□□□ -1.26
SEMA4D-215ENST00000469653 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa7.18□□□□□ -1.26
SEMA4D-215ENST00000469653 IGLV1-51P01701 117 aa7.18□□□□□ -1.26
SEMA4D-215ENST00000469653 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.18□□□□□ -1.26
SEMA4D-215ENST00000469653 C20orf203Q8NBC4 194 aa7.18□□□□□ -1.26
SEMA4D-215ENST00000469653 XCL2Q9UBD3 114 aa7.18□□□□□ -1.26
SEMA4D-215ENST00000469653 LINC00526Q96FQ7 95 aa7.17□□□□□ -1.26
SEMA4D-215ENST00000469653 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
SEMA4D-215ENST00000469653 A0A0J9YX75 114 aa7.17□□□□□ -1.26
SEMA4D-215ENST00000469653 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa7.17□□□□□ -1.26
SEMA4D-215ENST00000469653 TRGV11A0A075B6L2 103 aa7.17□□□□□ -1.26
SEMA4D-215ENST00000469653 H7C423 109 aa7.17□□□□□ -1.26
SEMA4D-215ENST00000469653 RHOHQ15669 191 aa7.17□□□□□ -1.26
SEMA4D-215ENST00000469653 FAM222AQ5U5X8 452 aa7.17□□□□□ -1.26
SEMA4D-215ENST00000469653 TMEM61Q8N0U2 210 aa7.17□□□□□ -1.26
SEMA4D-215ENST00000469653 DCANP1Q8TF63 244 aa7.17□□□□□ -1.26
SEMA4D-215ENST00000469653 MGAM2Q2M2H8 2515 aa7.17□□□□□ -1.26
SEMA4D-215ENST00000469653 TMEM258P61165 79 aa7.16□□□□□ -1.26
SEMA4D-215ENST00000469653 Q6Q795 121 aa7.16□□□□□ -1.26
SEMA4D-215ENST00000469653 H3BMM0 161 aa7.16□□□□□ -1.26
SEMA4D-215ENST00000469653 UBE2WQ96B02 151 aa7.16□□□□□ -1.26
SEMA4D-215ENST00000469653 Q9HAA7 133 aa7.16□□□□□ -1.26
SEMA4D-215ENST00000469653 TIMM21Q9BVV7 248 aa7.15□□□□□ -1.26
SEMA4D-215ENST00000469653 NDUFA12Q9UI09 145 aa7.15□□□□□ -1.26
SEMA4D-215ENST00000469653 DAD1P61803 113 aa7.15□□□□□ -1.26
SEMA4D-215ENST00000469653 ICOSQ9Y6W8 199 aa7.15□□□□□ -1.26
SEMA4D-215ENST00000469653 LYRM9A8MSI8 78 aa7.14□□□□□ -1.27
SEMA4D-215ENST00000469653 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa7.14□□□□□ -1.27
SEMA4D-215ENST00000469653 NOTCH1P46531 2555 aa7.14□□□□□ -1.27
SEMA4D-215ENST00000469653 I3L3M4 83 aa7.14□□□□□ -1.27
SEMA4D-215ENST00000469653 KRTAP10-11P60412 298 aa7.13□□□□□ -1.27
SEMA4D-215ENST00000469653 WFDC10AQ9H1F0 79 aa7.13□□□□□ -1.27
SEMA4D-215ENST00000469653 DNAH3Q8TD57 4116 aa7.13□□□□□ -1.27
SEMA4D-215ENST00000469653 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SEMA4D-215ENST00000469653 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa7.13□□□□□ -1.27
SEMA4D-215ENST00000469653 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SEMA4D-215ENST00000469653 CLPSL2Q6UWE3 100 aa7.11□□□□□ -1.27
SEMA4D-215ENST00000469653 MPLKIPQ8TAP9 179 aa7.11□□□□□ -1.27
SEMA4D-215ENST00000469653 OVOL2Q9BRP0 275 aa7.11□□□□□ -1.27
SEMA4D-215ENST00000469653 SPANXDQ9BXN6 97 aa7.11□□□□□ -1.27
SEMA4D-215ENST00000469653 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa7.11□□□□□ -1.27
SEMA4D-215ENST00000469653 MIAQ16674 131 aa7.11□□□□□ -1.27
SEMA4D-215ENST00000469653 A0A096LPF7 62 aa7.11□□□□□ -1.27
SEMA4D-215ENST00000469653 H3BT86 120 aa7.11□□□□□ -1.27
SEMA4D-215ENST00000469653 K7EQG2 157 aa7.11□□□□□ -1.27
SEMA4D-215ENST00000469653 LST1O00453 97 aa7.11□□□□□ -1.27
SEMA4D-215ENST00000469653 COX6CP09669 75 aa7.11□□□□□ -1.27
SEMA4D-215ENST00000469653 BEAN1Q3B7T3 259 aa7.11□□□□□ -1.27
SEMA4D-215ENST00000469653 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa7.11□□□□□ -1.27
SEMA4D-215ENST00000469653 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa7.1□□□□□ -1.27
SEMA4D-215ENST00000469653 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa7.1□□□□□ -1.27
SEMA4D-215ENST00000469653 DEFB121Q5J5C9 76 aa7.1□□□□□ -1.27
SEMA4D-215ENST00000469653 VSIG2Q96IQ7 327 aa7.1□□□□□ -1.27
SEMA4D-215ENST00000469653 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa7.1□□□□□ -1.27
SEMA4D-215ENST00000469653 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
SEMA4D-215ENST00000469653 Q6ZSN1 163 aa7.09□□□□□ -1.27
SEMA4D-215ENST00000469653 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
SEMA4D-215ENST00000469653 COX7CP15954 63 aa7.09□□□□□ -1.27
SEMA4D-215ENST00000469653 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa7.08□□□□□ -1.28
SEMA4D-215ENST00000469653 TIMM17BO60830 172 aa7.08□□□□□ -1.28
SEMA4D-215ENST00000469653 SLPIP03973 132 aa7.08□□□□□ -1.28
SEMA4D-215ENST00000469653 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
SEMA4D-215ENST00000469653 ODF3L2Q3SX64 289 aa7.08□□□□□ -1.28
SEMA4D-215ENST00000469653 MAP6D1Q9H9H5 199 aa7.08□□□□□ -1.28
SEMA4D-215ENST00000469653 SMIM26A0A096LP01 95 aa7.08□□□□□ -1.28
SEMA4D-215ENST00000469653 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
SEMA4D-215ENST00000469653 C19orf73Q9NVV2 129 aa7.07□□□□□ -1.28
SEMA4D-215ENST00000469653 X6R8D5 127 aa7.07□□□□□ -1.28
SEMA4D-215ENST00000469653 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa7.07□□□□□ -1.28
SEMA4D-215ENST00000469653 LINC00467Q9BRT7 94 aa7.07□□□□□ -1.28
SEMA4D-215ENST00000469653 CHCHD7Q9BUK0 85 aa7.07□□□□□ -1.28
SEMA4D-215ENST00000469653 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
SEMA4D-215ENST00000469653 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa7.06□□□□□ -1.28
SEMA4D-215ENST00000469653 SMCR5Q8TEV8 140 aa7.05□□□□□ -1.28
SEMA4D-215ENST00000469653 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa7.05□□□□□ -1.28
SEMA4D-215ENST00000469653 GYPEP15421 78 aa7.05□□□□□ -1.28
SEMA4D-215ENST00000469653 LINC00158P58513 81 aa7.05□□□□□ -1.28
SEMA4D-215ENST00000469653 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
SEMA4D-215ENST00000469653 COX6A2Q02221 97 aa7.04□□□□□ -1.28
SEMA4D-215ENST00000469653 SDIM1Q6ZPB5 146 aa7.04□□□□□ -1.28
SEMA4D-215ENST00000469653 CYSTM1Q9H1C7 97 aa7.04□□□□□ -1.28
SEMA4D-215ENST00000469653 A0A087WVE0 104 aa7.04□□□□□ -1.28
SEMA4D-215ENST00000469653 CRYGAP11844 174 aa7.04□□□□□ -1.28
SEMA4D-215ENST00000469653 TRGV2A0A075B6R0 118 aa7.04□□□□□ -1.28
SEMA4D-215ENST00000469653 K7EIL1 84 aa7.04□□□□□ -1.28
SEMA4D-215ENST00000469653 C5orf38Q86SI9 138 aa7.04□□□□□ -1.28
SEMA4D-215ENST00000469653 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa7.03□□□□□ -1.28
SEMA4D-215ENST00000469653 LINC00474Q9P2X8 69 aa7.03□□□□□ -1.28
SEMA4D-215ENST00000469653 DEFB4AO15263 64 aa7.03□□□□□ -1.28
SEMA4D-215ENST00000469653 DEFB130BP0DP73 79 aa7.03□□□□□ -1.28
SEMA4D-215ENST00000469653 DEFB130AP0DP74 79 aa7.03□□□□□ -1.28
SEMA4D-215ENST00000469653 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa7.03□□□□□ -1.28
SEMA4D-215ENST00000469653 LINC00308Q8TCZ7 52 aa7.03□□□□□ -1.28
SEMA4D-215ENST00000469653 NDUFA1O15239 70 aa7.02□□□□□ -1.28
SEMA4D-215ENST00000469653 Q6ZRU5 148 aa7.02□□□□□ -1.28
SEMA4D-215ENST00000469653 C6orf223Q8N319 242 aa7.02□□□□□ -1.28
SEMA4D-215ENST00000469653 C22orf24Q9Y442 160 aa7.02□□□□□ -1.28
SEMA4D-215ENST00000469653 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa7.02□□□□□ -1.29
SEMA4D-215ENST00000469653 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa7.02□□□□□ -1.29
SEMA4D-215ENST00000469653 NDUFS5O43920 106 aa7.02□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 211.6 ms