RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460328.5

TTC3-211, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, humanhuman

TSL 3

Gene TTC3, Length 573 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC3-211ENST00000460328 SPTBN4Q9H254 2564 aa-1.06□□□□□ -2.58
TTC3-211ENST00000460328 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP-1.06□□□□□ -2.58
TTC3-211ENST00000460328 GNG11P61952 73 aa-1.07□□□□□ -2.58
TTC3-211ENST00000460328 DEFB112Q30KQ8 113 aa-1.07□□□□□ -2.58
TTC3-211ENST00000460328 CCDC58Q4VC31 144 aa-1.07□□□□□ -2.58
TTC3-211ENST00000460328 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa-1.07□□□□□ -2.58
TTC3-211ENST00000460328 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP-1.07□□□□□ -2.58
TTC3-211ENST00000460328 ITPR3Q14573 2671 aa-1.07□□□□□ -2.58
TTC3-211ENST00000460328 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa-1.08□□□□□ -2.58
TTC3-211ENST00000460328 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa-1.08□□□□□ -2.58
TTC3-211ENST00000460328 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP-1.08□□□□□ -2.58
TTC3-211ENST00000460328 Q0VG73 95 aa-1.08□□□□□ -2.58
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TTC3-211ENST00000460328 PRO1933Q9H354 126 aa-1.08□□□□□ -2.58
TTC3-211ENST00000460328 DPH3P1Q9H4G8 78 aa-1.08□□□□□ -2.58
TTC3-211ENST00000460328 ADGRL2O95490 1459 aa-1.08□□□□□ -2.58
TTC3-211ENST00000460328 A0A1B0GWA3 101 aa-1.09□□□□□ -2.58
TTC3-211ENST00000460328 SEC11AP67812 179 aa-1.09□□□□□ -2.58
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TTC3-211ENST00000460328 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa-1.1□□□□□ -2.59
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TTC3-211ENST00000460328 FGF7P21781 194 aa-1.1□□□□□ -2.59
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TTC3-211ENST00000460328 TRAPPC2BP0DI82 140 aa-1.11□□□□□ -2.59
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TTC3-211ENST00000460328 C12orf57Q99622 126 aa-1.15□□□□□ -2.59
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TTC3-211ENST00000460328 SLIT1O75093 1534 aa-1.15□□□□□ -2.59
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TTC3-211ENST00000460328 LINC00846Q9NV44 126 aa-1.17□□□□□ -2.6
TTC3-211ENST00000460328 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa-1.17□□□□□ -2.6
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TTC3-211ENST00000460328 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa-1.18□□□□□ -2.6
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TTC3-211ENST00000460328 MYO18BQ8IUG5 2567 aa-1.18□□□□□ -2.6
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TTC3-211ENST00000460328 C7orf77A4D0Y5 90 aa-1.19□□□□□ -2.6
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TTC3-211ENST00000460328 COL4A6Q14031 1691 aa-1.2□□□□□ -2.6
TTC3-211ENST00000460328 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP-1.2□□□□□ -2.6
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TTC3-211ENST00000460328 COL6A5A8TX70 2615 aa-1.21□□□□□ -2.6
TTC3-211ENST00000460328 WFDC13Q8IUB5 93 aa-1.21□□□□□ -2.6
TTC3-211ENST00000460328 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa-1.21□□□□□ -2.6
TTC3-211ENST00000460328 A0A1B0GV90 55 aa-1.22□□□□□ -2.6
TTC3-211ENST00000460328 hADV29S1A0JD25 119 aa-1.22□□□□□ -2.6
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TTC3-211ENST00000460328 PTPN23Q9H3S7 1636 aa-1.22□□□□□ -2.61
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